Crocodylus porosus (Australian saltwater crocodile): 109306950
Help
Entry
109306950 CDS
T07440
Symbol
NOTCH2
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2
KO
K20994
Notch 2
Organism
cpoo
Crocodylus porosus (Australian saltwater crocodile)
Pathway
cpoo04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpoo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
109306950 (NOTCH2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
Ank
Notch
NOD
EGF_2
NODP
Ank_5
Ank_3
Ank_4
EGF_3
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
EGF_DL_JAG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109306950
NCBI-ProteinID:
XP_019386121
Ensembl:
ENSCPRG00005001488
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2341 aa
AA seq
DB search
MSDLLKMYSGALQCLDISKPCVNEGKCFSYPNGTGFCRCPEGFLGDYCQHRNPCESSTCQ
NGGTCETTSVIGKATCKCAPGFRGEDCRYSDSHICFVSHPCLNGGTCQLLGPDAYECVCR
PGYTGKNCQWIDACMSQPCANGSTCIASGERFSCTCPSGYTGQKCEVDVNECITPGQCHH
GGTCLNVPGSYRCQCKPGFTGHLCESTYVPCSPSPCMNGGTCHQTGDFVYECNCLPGFEG
DTCEHNIDDCPNHKCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECQLQPNACQNGGT
CTNHNGGYACVCVNGWSGDDCSKNIDDCLTASCANGSTCIDRVASFACICPEGKAGLLCH
LDDACVSNPCQKGALCDTNPMNGHYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCV
NTEGSFHCECLKGCFTGAVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGILCEE
NINNCDPDPCHHGRCQDGIDSYTCVCNPGYMGAICSEQIDECYSNPCLNQGRCIDLVNGY
QCNCLPGTSGVNCENNFDDCANKPCIHGTCIDGINHYSCICNPGVTGPRCNTDIDECISG
PCHNGGTCVNEMNGFRCICPEGYHHPTCHSQTDECLNNPCVHGNCTHDVNGYVCLCDPGW
TGTDCEVEENECRSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCRRGFKGVNCQIVQAPCSPDPCENSGI
CQESSGSDGYICLCAPGWEGERCTVDIDECVSKPCRNHAVCHNIQGSYLCECNPGFTGGD
CESNIDDCLSNPCQNGASCVDGVNSFSCICLPGFQGEQCQTDTNECLSEPCKNGGTCSDY
VNSYTCKCPAGFEGTNCENNINECTESSCFNGATCVDGINSFTCQCPVGFTGTFCLMEIN
ECDSHPCLNRGTCVDSLGTYHCVCPMGYTGKNCQILVDLCSKFPCKNKSTCVQQNTHFHC
NCPPGWSGAYCDVPNVSCQVAASQRGVPVDQLCQHSGNCLNVGNSHRCQCRTGYTGSYCE
EQVDECISSPCQNGATCRDYLGGYNCECVPGYQGVNCEYEVNECQFQPCQNGGTCIDLIN
HFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCMPDSGGPRCLNGGQCIDQIGGHSCLCPSGFGGKQCEGD
INECLSNPCSPRGSRDCVQMINNYTCICRSAFTGRHCETVIDVCPQKPCQNGGTCAVASN
MPDGFICQCPPGYSGSKCEFSNTCGQMRCKKGELCIQTSSGPRCYCPELLVGEECQATAG
CTSAPCQNGGSCHPRPQAPYYYCQCPSYTEGSQCEHSVHPSREPEGCLGQHCMERAKDGY
CDEDCNTHACQWDGGDCSLMIEDPWANCSSSLRCWEHFNGLCDEACNTPECLFDNFECQQ
NPKTCKYGKYCEDHYANGLCDKGCNNEECGWDGLDCAGDKAEKLAEGTLIIVVLMPPEQL
LSDVHSFLWTLGTLLHTNLRIKRDSQGKLMVYPYYGEKSALRSRRSLLVIRKTRELEQEA
IGTKVFLEIDNRQCAEESDQCFKNTEAAAALLAAQAIKGMVPYPFVSVESERISRGKTQM
LYLLAVVALIGLVILLLGVMMAKRKRKHGSLWLPEGFILHRDSSNHKRREPVGEDAVGLK
NLSVQVSDGNLADYTAGEHWSGDRGPQPKRAKSEDEALLPEADEQVDQCQWTQQHLRAAD
IDGTTSLALTPPQADQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRVGSSDISDEDEDGEDSSANI
ITDLIYQGANLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANARDNMGRTPLHAAV
AADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGK
SALHWAAAVNNVEATLVLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSFEAAKILLDHFANRDI
TDHMDRLPRDVAQDRMHHDIVQLLNEYNVAHSPSGHPGTMLNSALSPVICGPNRSFLNLK
HASLSKKSRKPNAKGVMAPNLAKEAKRRRKKSLTESKGQFSESSVTLSPVDSLESPHAFA
SEQTSSPVMPSPGILHSSPSSLLTTSVVQAAHPMSFSGLHEMQPLGQGSNTVLPSVSQLL
SQHRTTPSSNGLGRLQPGNISTEWMNHIDMNESQYNEMFGMIPQVVHAHPGGPQQGSLSQ
TDVKHVGVSRETLPPIMTFQLVPKSGMNQQVLVQQAQSNCPQNVAGPLSSMYQITSDLAQ
LPSASFPVAVIPQQDGQVAQTILPAYHQFQSSMGKYPTPPSQHSYTSSSATERTPSHNRH
LQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVATSPSHGSTQRGPVARMSEQQRNNMQVY
A
NT seq
7026 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgacctgctcaagatgtattctggagccttacaatgtctggatatttctaagcct
tgtgtcaatgagggaaagtgcttctcatatcccaatggcactggattttgcagatgtcca
gaaggttttcttggagactattgtcagcacagaaacccctgtgaaagcagtacctgtcag
aatggaggaacatgtgaaaccacgtctgtgataggaaaggccacttgcaaatgtgctcca
gggttcagaggcgaggactgcagatattctgattctcacatctgctttgtgtcacacccc
tgcttaaatggaggaacctgccagctgcttggcccagatgcatatgaatgtgtctgcagg
ccaggttacacaggaaagaactgtcagtggattgatgcttgtatgtctcagccatgtgcc
aatggaagtacttgcatcgcgtctggggagagattttcctgtacatgtccatctggttac
actggacaaaaatgtgaagttgatgtgaatgaatgtatcacaccaggacaatgccatcat
ggtggaacctgtctcaatgtgcctggctcctatcgatgtcagtgcaagccaggctttact
ggccacctctgtgaaagcacgtatgtgccatgttcaccttcaccgtgtatgaatggaggg
acatgtcatcaaactggtgattttgtctatgagtgcaactgtctgccaggctttgaagga
gatacctgtgagcacaacattgatgactgcccaaaccacaaatgccagaatggtggtgta
tgtgtggatggtgtaaacacttacaactgccgctgtcccccgcagtggacaggtcaattc
tgtactgaggatgtggatgaatgtcagctgcagcccaatgcctgccaaaatggaggtacc
tgcaccaaccacaatggcggctatgcctgtgtttgtgtcaacggctggagtggggatgat
tgcagtaagaatattgatgactgtcttactgcttcctgtgccaatggatctacttgcatt
gatcgtgtggcttcatttgcttgcatctgtccagaaggaaaggcaggcctcctgtgtcat
ctggatgatgcatgtgttagtaacccctgccagaagggggctctatgtgataccaaccct
atgaatggacactatatctgcacttgtccccaaggctacaaaggagcagactgtactgaa
gatgtagatgagtgtgctatggcaaacagcaatccgtgtgaacatgctggaaaatgtgtg
aatactgaaggctccttccactgtgagtgtctgaagggatgttttactggagccgtgtgc
cagattgacatcgatgactgctccagcacaccttgcctaaatggagcaaagtgcattgat
catcccaatggctatgagtgccagtgtgctacaggttttactggcatcttgtgtgaggaa
aatataaataattgtgatcctgacccttgccaccatggtagatgccaagatggtattgat
tcatacacatgtgtctgcaatcctggatacatgggtgccatttgtagtgaacagattgat
gaatgctacagcaacccctgccttaatcaaggacgctgcattgacttggtgaatggttac
caatgcaactgtttaccaggcacatcaggagtgaactgcgagaataactttgatgactgt
gcaaataaaccctgcattcatgggacctgtatagatggcattaaccactacagttgcatc
tgcaacccaggagttactggtccaagatgtaatactgatattgatgaatgcatctctggt
ccctgtcacaatggtggaacatgtgtcaatgaaatgaatggatttcgatgtatatgtcct
gaaggctaccatcatcccacctgtcactcacagacagatgaatgtcttaataatccttgt
gtgcatggcaactgcacacatgatgtcaatgggtatgtgtgtctctgtgacccaggttgg
actggaacggactgtgaagtagaggaaaatgagtgtaggtcaaatccgtgccagaatgga
ggaacctgtgacaatctggtgaatggatatagatgcacctgcaggagaggattcaaaggt
gtgaactgccagatagtgcaggctccttgctcccctgatccttgtgagaattctggaatc
tgccaagaatcatctggctctgatggatatatctgtctctgtgctcctggctgggaagga
gagagatgtacggtggatattgatgagtgcgtgtcaaagccctgcaggaatcatgctgtc
tgccacaacattcaaggcagctacctgtgtgaatgcaacccaggcttcactgggggagac
tgcgaaagcaacattgatgactgcctttcaaacccctgccagaatggagcttcatgtgtg
gatggggtgaactctttctcatgcatctgtctgcctgggttccaaggggagcagtgtcag
acagataccaatgagtgtctgagtgaaccatgcaagaatggaggcacctgttctgactac
gtcaacagctacacgtgcaagtgcccagcaggatttgaggggaccaattgtgagaacaac
atcaatgaatgcactgagagttcatgtttcaatggagccacttgtgtggacgggatcaac
tccttcacatgccagtgcccggttgggttcacgggaaccttttgtctcatggaaattaat
gaatgtgattcacatccttgcttgaacagagggacttgtgtggatagcctggggacctat
cattgtgtttgtcccatgggttacactggaaagaactgtcagatacttgtggatctgtgt
agcaagtttccctgtaagaacaaaagtacatgtgtccagcagaatactcactttcattgc
aactgtccccctggttggagtggggcctactgtgatgtgcccaatgtctcctgccaagtg
gctgcctcacagaggggggtccctgtagaccagttgtgtcagcactctggcaattgcctt
aatgttggaaacagccaccgttgccaatgccggacaggctacactggtagctattgtgaa
gagcaggtggatgaatgcatatccagtccttgtcagaatggcgccacctgcagggactat
cttggaggatataactgtgagtgtgtgccagggtaccagggtgtcaactgcgagtatgaa
gtgaatgagtgtcagttccagccctgccaaaatggaggaacctgcattgatctcatcaat
cacttcaaatgctcctgtccaccaggaactcggggccttctttgtgaggagaatattgat
gactgcatgccagattcaggagggcctcgctgccttaatggaggacagtgcatagaccaa
attgggggccacagctgtctttgtccttcaggcttcggaggcaagcagtgtgagggggac
attaatgaatgcctctccaacccttgtagccctcgtggtagccgagactgtgttcagatg
ataaataattatacatgtatctgccgcagtgcctttactggccgtcactgtgaaactgtg
atagatgtgtgtcctcagaagccttgtcagaatggaggtacttgtgctgttgccagtaat
atgcctgatggattcatctgccagtgtcctccaggttattctgggtctaaatgtgaattc
agcaatacttgtgggcaaatgaggtgcaagaaaggggaactgtgcatccagacatcctca
gggccccgttgttactgtccagagctcttggtgggtgaggagtgccaggctactgcaggc
tgtaccagtgcaccctgccagaatgggggaagttgccatcctaggcctcaggctccttat
tattactgtcagtgtcccagttacactgaaggcagccaatgtgagcattcagtacacccc
agccgagaacctgaagggtgtctgggtcaacactgcatggaacgagcaaaagacggctac
tgtgatgaagactgcaacacgcacgcgtgccagtgggatggaggggactgttcgctgatg
atagaagatccctgggccaactgttcttcgtcgctgcgctgctgggagcatttcaatggc
ttgtgcgatgaggcctgtaatacacctgagtgcttgtttgacaactttgagtgtcagcag
aaccctaagacgtgcaagtatggtaaatattgtgaggatcactatgcgaatggcctctgt
gacaaaggatgtaacaatgaggagtgtggttgggatggtctggactgtgccggtgacaaa
gctgagaagctggcggaaggtacccttataattgtggtgctaatgccccctgaacagctg
ctttcagatgtccatagcttcctatggactctaggaacccttctacacaccaacctgaga
ataaaacgggattcccagggaaagttgatggtatatccatactatggagagaagtcagca
ctacggagccggcgatccctgttggtcattcgtaagaccagagagcttgaacaagaggcc
attggcacaaaggtgttcctggaaattgacaatcgacagtgcgctgaagagtcagaccag
tgctttaaaaatacagaagctgcagcagctcttttagcagctcaggccattaagggcatg
gtgccttatccttttgtgtcggttgaaagtgaacgcatatcacgagggaagacccagatg
ctttacctgcttgctgtggtagctttgatcggccttgtaatccttcttttgggtgtgatg
atggcaaagcgaaaacggaagcatggctccctctggctccctgagggctttattttgcac
agagactccagtaaccacaaacggagagaaccagttggggaagacgcagttggattgaaa
aatctgtcagtacaagtttctgatggcaatctggcagactatactgcaggggaacattgg
tcaggtgacaggggacctcagccaaagagagctaagtctgaagatgaagcattgctccca
gaagcagatgagcaggtagatcaatgccaatggacgcaacaacacctcagggcagctgat
attgatgggaccacatcccttgctcttacaccacctcaggcagatcaagaagtagatgtc
ctggacgtcaatgttagaggaccagatgggtgcacgccactcatgttggcatctctgcgt
gtgggcagctccgacattagtgacgaagatgaagatggggaggattcctcagcaaatata
ataacagacctgatctatcaaggggctaacttgcaagctcaaacagaccgcactggggag
atggcactgcacttagcagcccgctattcaagagcagatgcggcaaaacgcttgttggat
gctggtgctgatgctaacgcccgagacaacatggggaggactcctcttcatgcagctgtg
gcagctgacgcacagggtgtcttccagatcttgatccggaacagagtaacagacctggat
gctcgcatgaatgatggaacaaccccgttaattctggcagctcgtttggctgtggaggga
atggtggctgagctgatcaactgccaggcagatgtcaacgcagtggatgaccacggtaaa
tccgctcttcattgggctgcagctgttaacaatgtggaggcaacgttagtgttgttgaaa
aacggagccaaccgagacatgcaggacaacaaggaggagacaccactcttcctggcagct
cgggaagggagttttgaagcagctaaaattctgttggaccattttgccaatcgggacatc
acagaccacatggaccgtctcccccgcgatgtggcgcaggaccgcatgcaccatgacatc
gtgcagcttctcaatgagtacaatgtggcccatagcccatctgggcaccctggcaccatg
ctgaactctgccctctccccagtgatttgtggccccaatagatccttcctcaatttgaaa
catgcttctctaagcaagaagtcgaggaaaccaaatgccaagggtgtgatggccccgaat
cttgccaaagaagcaaagaggagaaggaagaaatctctgactgagagcaagggtcagttt
tctgagagctcagtgaccctctcaccagtcgactccctggaatctccccatgcttttgca
tctgaacaaacgtcctctcctgtgatgccgtccccagggattctgcattcctcgcccagc
tcactgcttacgacctcagtcgtgcaggctgcacaccccatgtccttctccggtctccat
gagatgcagccactggggcaggggtctaacaccgtgcttccatctgtcagccagctgctt
tcccagcaccgaaccaccccttccagcaatgggcttggtagactccagccaggtaacatt
tccaccgaatggatgaaccacatagatatgaatgaatcccaatacaatgagatgtttggc
atgatcccacaggtagtccatgctcaccccggcggccctcagcaaggaagtctgagtcaa
acagatgtgaagcatgtgggagtctccagggagacactgccccctattatgactttccag
ctggttcccaaaagtggcatgaaccaacaggtcctggtgcaacaggcccagtccaactgc
cctcagaatgtagctggtcctcttagttcaatgtaccagataacgtcagatctagctcag
ctgccaagtgcctcctttcccgtggcagtaattcctcagcaggatgggcaggtcgctcag
acaatcctcccagcctatcaccagttccagagctcaatgggaaagtatcccacaccgcca
tcacagcacagctacacctcttcctctgccacggagaggactcccagccataacaggcac
ttgcaaggggagcacccatatctgacaccatctcccgaatctcccgatcagtggtcaagc
tcctccccgcactctgcctcagattggtctgatgtggcgaccagccccagccacggtagt
acccaacgtggtccggtagcgcgaatgtcagagcagcagcggaacaacatgcaggtatat
gcatga
DBGET
integrated database retrieval system
