Clostridium perfringens SM101: CPR_0500
Help
Entry
CPR_0500 CDS
T00379
Name
(GenBank) sensor histidine kinase
Organism
cpr
Clostridium perfringens SM101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
sCache_3_2
SPOB_a
HATPase_c_5
AnfO_nitrog
HATPase_c_2
DUF6105
BON
Fis1_TPR_C
DUF7095
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG85570
UniProt:
Q0SVM2
LinkDB
All DBs
Position
594394..595944
Genome browser
AA seq
516 aa
AA seq
DB search
MKVKFENKILLWAILITFIPLALSFTLFIEDKLSYMDEDVRNTLKETAFSISQIPFVQED
LNNGEINPRIQEYTKHFIEAINDVDIIVVADMRGIKYSHLDEKQIGQVFINDDKKEVLTQ
GNSYYSLMKGSMGETLRWFQPVMYNGKQVGFIMVGKYYNEIQLLTHKTLIKYMGLFILVF
LITILISKLFARKVKKAILGMEPEEIAALYKEKKIILNTVSEGIIALNKNNEITEINDNC
YKLIDGFSKYKVLKKLLPYIEENKPVEMKEIILQGKKVFVTIQPIMKKGEYLGSVITLMD
RNDIRKIAKEITGVDEVVKNLRANVHEFRNNLHVILGLIQLGEYEEARKYILKTQKIHEN
NSLKFSNVEDYYVRGLLLSRELVAKERGVNFVLTEESFLFGNHNYVDSYDIVTILGNLIE
NAFDSCVCSSIENKEVEVTLYEDDEKIELQVRDNGKPIDNNIKERIFELGVSSKGEGRGT
GLSLVKNRVELYDGCIDIEEFNEEKIFIITILKGEK
NT seq
1551 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtaaaatttgaaaataaaatattattatgggctatacttataactttcattcca
ctagcattatcttttactttatttatagaagataagctttcatatatggatgaggatgta
agaaataccttaaaagagactgcttttagtataagtcagattccttttgttcaagaggat
cttaataatggagaaataaaccctagaatacaagaatacacaaaacattttattgaagct
ataaatgatgttgatattattgttgttgctgatatgagggggattaagtattctcattta
gatgaaaagcaaatagggcaggtctttattaatgatgataagaaagaagttttaacacaa
ggaaacagttattattctttgatgaagggttctatgggggaaacattaagatggtttcaa
cctgtaatgtacaatggaaagcaagttgggtttattatggttggtaagtattataatgag
attcaacttctaactcataagactttaataaaatatatgggactttttattttagttttt
ttaattactatattaatatctaaactttttgctagaaaggttaaaaaggcaattttggga
atggaaccagaagaaattgctgctttatataaagaaaaaaagataatattaaatacagtg
agtgaaggtattattgccttaaataaaaataatgaaataacagagataaatgataattgc
tataagcttatagatggattttcaaagtataaggtgttgaaaaaattattaccttatata
gaagaaaataaacctgtagaaatgaaagaaattatacttcaggggaagaaggtatttgta
actatacaacctattatgaaaaagggtgaatatttaggttctgtaataactttaatggat
agaaatgatattagaaaaattgcaaaagagataactggtgttgacgaggttgttaagaat
ctaagagctaatgtccatgaatttagaaataatctacatgtaattttagggttaattcaa
ctaggtgaatatgaagaggctagaaaatacatattaaaaactcaaaagattcatgaaaat
aactctttaaaattttcaaatgtagaggattattatgtaagaggattacttttaagtaga
gagttagttgctaaagaaagaggagtaaactttgttttaacagaggaatcatttttattt
ggaaatcataattatgttgattcctatgatattgtaactattttaggtaacttaatagaa
aatgcctttgattcttgtgtatgttcaagtattgagaacaaggaagttgaggttacttta
tatgaagatgatgaaaagatagaattgcaagttagggataatgggaaacctatagataat
aatataaaggaaagaatatttgaattaggagtttcctcaaagggagaaggaagaggaaca
ggattatcattagttaagaatagagttgagctttacgatggttgtattgatattgaggaa
ttcaatgaagagaaaatatttattataactattttaaaaggagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system