Clostridium perfringens SM101: CPR_0576
Help
Entry
CPR_0576 CDS
T00379
Name
(GenBank) cation efflux family protein
Organism
cpr
Clostridium perfringens SM101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cation_efflux
ZT_dimer
DUF7376
Spore_YhcN_YlaJ
DUF3232
Phage_holin_5_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG87538
UniProt:
Q0SVE7
LinkDB
All DBs
Position
complement(685339..686520)
Genome browser
AA seq
393 aa
AA seq
DB search
MFSNLIIKTFIKDYKNTENESVRSSYGYLASIVGIIVNIILFLIKFSVGLISASIAITAD
AFNNLSDAGSSVITMIGFKLAKMPADKEHPFGHGRIEYISALIVAFMVMLVGFQFTKSSI
ERILNPTPVTFEVIPFILLIVSIFFKFWLSRFNKLTGNRINSSALKAASVDALGDVFTST
CVVISFLAAKFTTFPIDGYIGVIVSLAILYAGFTLVKETINPLLGEAPDPELAKNIREMV
LSYDHIIGVHDLIIHNYGVGKCMASIHAEIPSDINVMKIHDIIDMAEREISKKLKIYLVI
HMDPICLEDDEIKQAKEEIDKIIKYNPLIESMHDFRIVGHGNKKNLIFDIVVNPEKLRKV
MSESELKEEIIKAVKETHPQYNCIITIDKDFTC
NT seq
1182 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttcaaatcttataataaaaaccttcattaaggattacaaaaacacagaaaatgaa
agtgttagaagctcttatggttacttagctagtatagttggaataattgttaatataatt
ttattcttaataaaattttctgtaggattaatttcagcaagtatagctataacagcagac
gcctttaataatttatctgatgctggctcttctgtaataacaatgataggttttaaatta
gctaaaatgccagcagataaagagcatccatttggacatggtagaattgaatatatttca
gctctaatcgtagcattcatggtaatgttagtaggttttcaattcaccaaatcatcaatt
gaaagaattcttaatccaacacctgtaacctttgaagtaattccttttattctacttata
gtatcaatattctttaaattttggttaagtagatttaataaattaacaggtaatagaata
aattcttcagctcttaaggctgcttcagttgatgctttaggagatgtatttacttcaaca
tgtgttgttatatcatttttagctgcaaaatttactacattccctattgatggatatata
ggtgttattgtttcattagctattctatatgctggatttactttagtaaaagaaactata
aatcctcttttaggagaagcacctgatccagagcttgctaaaaatattagagaaatggtt
ctatcatatgatcatataataggagttcatgatcttataattcataactatggtgtaggt
aaatgcatggcttcaattcatgcagaaataccttctgacataaatgttatgaaaatacat
gatattatagatatggctgaaagagaaatttctaaaaaactaaagatttatttggtaatt
catatggaccctatttgtttagaagatgatgaaataaaacaggctaaagaagaaatagac
aaaataataaaatataacccactaatagaatcaatgcacgattttagaattgttggtcat
ggtaacaagaaaaatcttatattcgatattgttgttaacccagaaaaactaagaaaagtt
atgtctgaaagtgagcttaaagaagaaattataaaggcagtaaaagaaactcaccctcaa
tataactgcataataactattgataaagattttacttgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
