Clostridium perfringens SM101: CPR_1955
Help
Entry
CPR_1955 CDS
T00379
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
cpr
Clostridium perfringens SM101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_1
TPR_2
TPR_8
TPR_17
TPR_7
TPR_12
TPR_19
TPR_11
TPR_14
TPR_6
TPR_16
TPR_10
MIT
TPR_9
TPR_CcmH_CycH
TOM20_plant
DUF7017
ARM_TT21_C
TPR_Slam
TPR-S
NatA_aux_su
DUF3856
Sel1
TPR_15
ANAPC3
TPR_MalT
BTAD
SNAP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG85979
UniProt:
Q0SRJ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2160921..2161856)
Genome browser
AA seq
311 aa
AA seq
DB search
MDNNYRIIDNYIRSGDKAHDEGNLIKALNYYLRAEELLEGERDIDLIISIALMLDELGDT
EKAKEKYEEALSINSFEVRAYYGLAVIYDEKEDYVKAIELYKKAIDINPVYDRAIFFLAN
ALDNVGDKEGAIEYYKKTIEVCKEDFWAHINLGSIYEERDMLQEAYRMFSKALQIDGEHY
LALFNMGVIYKRLNVYDKAKKFYEKAIKKNFGYAFSFLNLAVIYKEENNIEKGIEILSLG
LRFNPENHFLYYNRSCFKAILGKDLEDATDDLIKAVEFYPEFIKYINKDNDLIEVRNSNK
FKDFLEAINIG
NT seq
936 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataataactatagaattatagataattatatacgtagtggtgataaagctcatgat
gaagggaatttaataaaggccttaaattattatttaagagctgaggagcttttagaagga
gaaagagatattgatttaataataagtatagctttaatgctagatgagttaggagatact
gaaaaggccaaggaaaaatatgaagaagccttaagtataaatagttttgaggttagagct
tattatggattagcagtgatttatgatgaaaaagaggattatgtaaaggctatagaatta
tataaaaaggctatagatataaacccagtttatgatagagctatatttttcttagcaaat
gcattagataatgtgggagataaagaaggtgcaatagagtattacaaaaagacaatagag
gtttgtaaagaagatttttgggctcatataaatttaggatctatatatgaagaaagggat
atgcttcaagaggcttatagaatgttttctaaagctcttcaaatagatggagagcactat
ttagcactttttaatatgggagtaatatataagagattaaatgtatatgataaggctaag
aaattttatgaaaaagccattaaaaagaattttgggtatgctttttcattcttaaatttg
gcagttatatataaggaagaaaataatatagaaaagggaatagagattttatctctgggt
ttaagatttaatccagaaaatcattttttatattataatagaagttgctttaaggctatt
ttaggaaaagatttagaggatgctacagatgatttaattaaggctgttgaattttatcca
gaatttataaaatatataaataaagataatgatttaattgaggtaagaaatagtaataag
tttaaagattttttagaggccataaatattggttaa
DBGET
integrated database retrieval system