Clostridium perfringens SM101: CPR_2326
Help
Entry
CPR_2326 CDS
T00379
Name
(GenBank) sensor histidine kinase
Organism
cpr
Clostridium perfringens SM101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
HAMP
HATPase_c_3
CovS-like_HAMP
KH_DUF2096_C
VasL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG86902
UniProt:
Q0SQL5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2548778..2550199)
Genome browser
AA seq
473 aa
AA seq
DB search
MGWDINLKVRKYKSLNFKVIVPSIVIIIIVTLLTVVISKFYFDKKFGDYIMIKNQNTVQN
ILMELSEQYSDNKWDYKGMEKISYNALDKGIIVALYDKEDKEIMNIEKNSKDKCNRIMNF
IKSSMEGKYGSTTSQFEPVYYPLIKSGEKIGEVRIKFYGPIFYMQNELVFLDIVNKIILG
IGVLLILASTVIGFIISRSITRPINKLMTKAKYISKGEYDKKIEINTDILEINDLINSIN
NLSQSIKEQENIRKRLTGDISHELKTPLTNIQSHLEAMIYGIWEPTEERLLSVKEEAERL
SSLVSDMQKLNKYDESSIKLKKDNVNISDIICFVIFQFSNLAKSKNIKIEYEKKNINLYC
DKDKITQALVNILSNAIRYSNEGSTIFIEEKLKDNKVIISIEDQGIGISEEDLKYVFERF
YRADKSRTRATGGTGIGLTIVKSIVSSHGGEVKLESKLGEGSKFTIILPKEKI
NT seq
1422 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggtgggatataaatttgaaggtaagaaaatataaaagtttaaattttaaggttata
gttccatctatagttatcataataattgtaactttacttactgtggtcatatctaaattt
tattttgataaaaaatttggtgactatattatgattaaaaatcagaatacagtacaaaac
attttgatggagctaagtgaacaatattctgataataagtgggattacaagggtatggag
aaaataagctataatgcattagataaagggattatagttgctttatatgataaagaagat
aaggaaataatgaatatagaaaaaaattctaaagataaatgcaatagaattatgaatttt
ataaaaagttctatggaagggaaatatggctctacaacaagtcaatttgaacctgtgtat
tatcctttaataaagagtggagaaaaaattggagaggttagaattaaattttatggccct
atattttatatgcagaatgaattagtttttctggatatagtaaataagataatattaggt
attggagttttactgattctagcatctacagtaattgggtttataatttcaaggtcaata
acaagacctataaataagctaatgacaaaggctaagtatatttctaaaggggaatatgac
aagaagattgagataaatacagatattttagagataaatgatttgataaattccataaat
aatctttcacagagtataaaagagcaagagaacataagaaaaagacttactggggacatt
tctcatgaattaaaaactcctttaacaaatatacagtctcacttagaggccatgatatat
ggaatatgggaacctacagaggaaaggttactaagtgttaaggaagaggcagaaagacta
tcgtccttagtaagtgatatgcaaaagttaaataagtatgatgagtcttctattaagctt
aaaaaggataatgtgaatataagtgatataatttgctttgtaatatttcaattttctaat
ttagcaaagagtaaaaatataaagatagaatatgaaaaaaagaatattaatttatattgt
gataaggataaaataacacaggctttagtaaatattctttcaaatgctattaggtactca
aatgagggaagtactatttttatagaagaaaaattaaaagataataaggttataatatcc
atagaagatcaaggcataggtatctcagaagaggatttaaaatatgtctttgaaagattt
tatagggcagataaatctagaactagagctactggaggaacaggcataggtttaactata
gtgaaatctatagtatcttctcatggaggagaagttaaattagaaagcaaactaggtgaa
ggaagtaagtttactataatattacctaaggaaaagatataa
DBGET
integrated database retrieval system
