Candidatus Cytomitobacter primus: FZC34_00325
Help
Entry
FZC34_00325 CDS
T10141
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K13797
DNA-directed RNA polymerase subunit beta-beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
cpri Candidatus Cytomitobacter primus
Pathway
cpri03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpri00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
FZC34_00325 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
cpri03021
]
FZC34_00325 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cpri03400
]
FZC34_00325 (rpoC)
Enzymes [BR:
cpri01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
FZC34_00325 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
cpri03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
FZC34_00325 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cpri03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
FZC34_00325 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb1_4
BetaGal_ABD_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEK38371
UniProt:
A0A5C0UFA8
LinkDB
All DBs
Position
64567..72705
Genome browser
AA seq
2712 aa
AA seq
DB search
MSIYKDFVRKSFAKTNEDSLFVEDLIKLQKDSYDEFLQLNMLPEKRANKGLQLVLREFFP
IVGLSGILKLEFCGYGVSEPVFSAVECKRKGLTYSGVISILLRLIVHDVDEDGKTFVKDV
REQSVYIGDMPFMTDFGTFIINGTERVVVSQMHRSPGIFLDIEKKTNTVGPSYDIHIARI
IPYRGSWIDVEFDSSNLMYIRIDKNKKIPLMALLMSLGENDVSAKDPGMSKNEILNEFYD
ITEFSVVENGLKFNLDWNKWIGSKFDFDILDATTGGIILKSGDLITKGFIKKLGDKSTKS
LLINKDEFTDIYLTHDINEEVKVSDVVLYENLIEHGITSFKGVIIDGNYNTPYVIDSMRS
YNYKNRIEAMVVLYNTMRPGERVKVDVVYALYKSIFSDQDYYNLSEVGRVKLNQKLGLNL
PLDCLTLTKIDILSTIKSLIRLKKGEESVDDIDSLENRRVRSVGELVENQCRLAMGRFLK
SVKDKMSGVDLESLMPSDLIAHSKSFTGVIREFFCTSQFSQFMDQTNPLSEISHKRRLSA
FGPGGISRERSVLEARGLHATHYGRICPVETPEGQNIGLINSLSIFGKINKFGFIETPYH
PVVDGEVKSEIVYFSASEDKKHIIAHADPDILDDNNKIKASSVKCRFNNDYVIVDPSKVQ
YIDVSPKQIISVASSLIPFVDHNDAGRALMGANMQRQAVPLIEPDSPLIGTGVEKSVVYG
SAVVIQAKRAGEVVRVDSSSIMIKTDDSDLDVYNLRKFEKTNDGTCINQRPIVSVGQYVK
TDELIAEGSSMDKGDLALGKNVKIAFLSWRGGNYEDAVLISSKLVNDFSSVHLEKYEVSA
REIKQGIEQITRDIPRVNEEFLMHLDESGIVNIGANVKGGDVLVGRVTPKAEGPASADER
LLRAIFGDRACDVKDSSLRVPPGVEGTVIDVRVFTRKGMEKNERALVIEHELLRKLQAQK
TIELNVLKDCFVDKLCKAIDGEVLRKKVGKFAVGDALNKEILEEINLMLVPDIIKNPSQN
ILDIMQSYSDRINIITKKFQKEDKKISAGDDLVSGIMVTVQVFLAVKRKLQPGDKIAGRH
GNKGVIARVLNLEDMPYTENGEPVDLIFSSLGISSRMNLGQILETHLGWASFNLGKKIDG
MLSEVKSGQKSVGELREFVDQIYENNPEVQSKTDDEIIDFSGNLKNGVPFSCPAFDGASV
DHISKMLELSGCDSSGQEVLYDGYTGLPFDRKVTVGIMYIMQLHHFVDEKIHARSVGPYS
LITQQPLGGKSNFGGQRFGEMEVWALQGYGAAYTIRECLNAKSDDPLGRMRVFEAISQGY
DVFDQQGVPESFRVLLYSLRSLCLNVECLVSVDGTLVEQDLNNLHNLDALRISIAGPEKV
SQWSYGEVTRAETIHYRTLKPDPDGLFSARIFGPIKDYECLCGKYKKIKYRGVVCEKCGV
EVTVSRVRRERMGHVNLAAPIAHMWFAKSLPSRIGIMLGLSAKDLEAVLNFEKYLVIEPA
TSPYAKGTLLSELEYNSIVEEYEDEGFEADTGAESLEKLLKEINLGEEISEINEELSENP
NESKRKSLIRKLKILEGFYKSNTRPELCIIRVLPILPPELRPLVVLDGGRFASSDVNDLY
RRVINRNNRLKRLLALNAPLVILRNEIRMLQESVDALFDNERKSRPIMHLNSKREYKSLA
YSLKGKRGMFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPELRLDQCGVPKDMALELFKPFVIARLELR
GFAPTYKSAKHMVEHKRPEVWDVLAECIQDHPVLLNRAPTLHRLGIQAFNPVLVNGKAIR
LHPLVCTAYNADFDGDQMAIHIPLSIEAQIEARVLMMSTNCLLNPSNGKAIVKPSKDMVL
GLYYLTLMLSDDPKAIVRDIAEAEHALESGHINIGTPIRVEIEEGDKSRMVLTSLGRLKV
YEITPKHPKIGFDMINKALNTSSISELVETIYEHCEKDVAVKFLDEFMNLGFLYATMSGS
SFGKDDLIVPEEKHDLIAKTEQLVEEYRKQYMEGIITNGERHNKVTSAWSKCADAVAEIM
MDRMSAIKDDQLNSVFMMSDSGARGSAMQIRQIAGMRGLIARSDGSIQEDPVKNSFKEGL
TVPEFLYASEGGRKGLVDMALKTANSGYLTRRLVGVAQDCVVHHEDCGTSKGIMMKAIMQ
SGRTVVSLRDQLYGRTLSKNVILERDGNEVVIESGTIVTRDLAREIEEYGIEEVETRSPV
SCENMDSTVCVKCYGYDLSKAKPTMVQDGESVGVVAAQSIGEPGTQLTMRTFHYGGAAQN
ISEDSFIDASENVTIIMNDIKIVNKGDYGIVMSRNNELKVKSAKKTFAYNLPYGSKIFVK
DQDAVEAGFRIAEWDPYNTPILAEASGNLVYHDLIEGISLKASMDESTGSQNYTVSDWNA
VSKKANLQPALKIELGNSDKEYYYSLSINDVILVIDKEYVEIGDVIATRSQGALKTRDIV
GGLPRIEELFEARSPKSLAILNEEDGRVSFGKDYRSKKKIIVTSLSDGSEKEYIAAKDRY
ILAQTGDIVKKGQILVDGHVSHHDMLRILGAEEMSHDFIEEVQQVYRMQGITINDKHIEI
ILRRMLSQGEVLDPSSSSFLIGDIVDIKKLNSINEILITNGKAPIRFRRILQGITKISTS
AGSSFLSAASFQDTARVLTNAALFNDIDWITGINESIMAGMLIPAGTGAFVRRLETGWKE
ELQKDFLTASAE
NT seq
8139 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaatttataaagattttgttcgcaaatcttttgcaaaaactaatgaggattcttta
tttgttgaagatctgatcaagttacaaaaagattcttatgatgaatttttgcagcttaat
atgctgcctgaaaaaagggcaaataaagggcttcaacttgtattaagagagttttttcct
atcgttggtctttctggaattttaaagttagaattttgtggttatggtgttagtgagcct
gtatttagtgctgtagagtgcaaaagaaaaggcttaacttatagtggagttattagcatc
ttattaaggcttattgttcatgatgttgatgaagatggaaaaacatttgtaaaagatgta
agagagcaaagtgtttatataggcgatatgcctttcatgacagatttcggaacctttatt
attaatggtactgaaagagttgtggtttctcaaatgcatagatctccaggaattttcctt
gatattgagaaaaaaacaaatacagttgggccatcttatgatatccatattgctagaatt
attccttatagagggtcttggattgatgttgagtttgattctagtaacctgatgtacatt
agaatagataaaaacaagaaaatacctcttatggcacttttgatgtctttgggtgaaaat
gatgtttctgctaaagatcctggaatgtcaaaaaatgaaatcttaaatgaattttatgat
attactgaatttagtgttgtggaaaatgggcttaaatttaatttagattggaataaatgg
attggttctaagtttgattttgatatcttagacgcaactacaggtggaattatcctgaaa
tctggagatttaattactaaaggatttattaaaaaactaggagataaaagtacaaaatct
cttttgattaataaagatgaatttacagatatttatttaactcatgatattaatgaagaa
gttaaagttagtgatgttgtattgtatgaaaatctaatagagcacggaataacttctttt
aaaggtgtgattatagatggaaattataacactccttacgttatagattctatgagatcg
tataattataaaaaccgtattgaagctatggttgttctatacaatacaatgaggccaggc
gagagggtgaaagttgatgttgtatatgcattgtacaaatccattttctctgatcaagat
tactataatttatcagaagttgggcgtgttaagctaaatcaaaaacttggtttgaatttg
cctctagattgccttactttaacaaaaattgatattttatctacaattaaatctttaata
agattgaaaaaaggcgaagagtcagtagatgatatagatagcttagagaatagaagagtt
agatctgttggagagttagttgaaaatcaatgtaggcttgcaatgggaagattcttgaaa
tctgttaaagataaaatgagtggcgttgatttagaatctttgatgccgtctgatttgatt
gctcactctaaatcatttacaggagtgattcgtgaattcttctgtacttcacaattctct
caatttatggatcaaaccaacccactttcagaaataagtcataagaggcgtttgtctgca
tttggacctggtggtattagcagagaaagatcagtgctagaagctagaggtttgcatgct
acccattatggaagaatttgtcctgttgaaactcctgaagggcaaaacattggattaatt
aattctctttctatttttggtaagataaacaaatttggatttattgaaactccatatcat
ccagttgttgatggagaagtgaagtcagagattgtgtatttctctgcttctgaagataag
aagcacattattgcgcatgctgatccagatattttagatgataataataagattaaagca
agctctgtgaagtgtagatttaataatgactatgtaattgttgatccatcaaaagttcaa
tacatagatgtttcacctaaacagattatttctgttgcatcatctttgattccttttgtt
gatcataatgatgctggtagagcgttgatgggagcaaacatgcaacgtcaggctgttccg
cttattgagcctgattctccattgattggtactggagttgagaaatctgttgtgtatggt
tctgctgtggtaatacaagctaaacgtgctggtgaagttgttagagtagattcttcttct
attatgattaaaactgatgattcagatttagatgtatataatttgagaaaatttgaaaaa
acaaatgatggtacatgtattaaccaaaggcctatagtatctgttgggcaatatgtgaaa
actgatgagcttattgctgaaggttcttcaatggataaaggtgatcttgcgcttggaaaa
aatgtgaaaattgcctttctatcatggagaggtggaaactacgaagatgctgttttgatt
tcttcgaagttagttaatgatttttcatctgttcatctagagaaatatgaagtttcagct
cgtgagattaaacagggaattgagcaaatcacaagagatatcccaagagttaatgaagaa
ttcttgatgcatcttgatgagagtggaattgttaatatcggtgctaatgttaagggtgga
gatgttcttgttggtagagttacacctaaagctgaagggccagcaagtgctgatgaaaga
ttgttaagagcgatttttggtgatagagcttgtgacgttaaagatagttcattgcgtgtt
cctcctggagtggaaggtacagttattgatgtgcgtgttttcactagaaaaggtatggaa
aaaaatgaaagagctcttgttattgaacacgagcttttgagaaagcttcaagcgcaaaaa
actatagaattaaatgtgctgaaagattgttttgtagataaattatgcaaagctattgat
ggagaggtattgcgcaaaaaagtaggaaaatttgctgttggtgatgctttaaataaagaa
atattagaagaaatcaacttaatgcttgttcctgatatcattaagaatccttcacaaaat
atcttggatattatgcagtcatactcagatagaattaatattataactaagaagttccaa
aaagaagataaaaagataagtgctggagatgatttggtttctggtattatggttactgtg
caggtgttcttagctgttaagagaaagttgcaacctggagataaaattgctggacgacat
ggtaataaaggtgttattgctagagttcttaacttagaagatatgccttatacagaaaat
ggagaacctgtagatttgattttcagttctttgggtatttcttctcgtatgaatcttggt
cagatcttagaaactcacttaggttgggcatcatttaacttaggtaagaagatagatgga
atgttatctgaagttaaatctggacaaaaatctgttggtgaattaagagagtttgttgac
caaatttatgaaaataatccagaagtacaatctaaaacagatgatgaaattattgatttc
tcaggaaatttgaaaaacggagttccgtttagttgtcctgcttttgatggtgctagtgtt
gatcatatttcgaaaatgcttgaattatcaggatgcgattcttctggtcaagaggtccta
tatgatggatataccggtttgccttttgatagaaaagttacagttggaatcatgtacatt
atgcagttgcatcactttgtggatgagaaaattcatgctagatctgttgggccttacagt
cttattacacagcagccgcttggtggtaaatctaatttcggtggacaaaggttcggagaa
atggaggtgtgggcacttcaaggatatggtgcagcatatacaattagagagtgcttgaac
gcaaaatctgatgatcctctagggcgtatgagagtttttgaagctattagtcaaggatat
gatgtgtttgaccaacaaggtgttccagaatctttccgtgtattgttatactcactaaga
tctctatgtttgaatgttgaatgtttggtttctgttgatggaactttggttgagcaagat
ttgaataacttgcataatttagacgcattgagaatttctattgcagggccagagaaagta
agtcaatggtcttatggtgaagtgacaagagcagaaacaattcattacagaactctaaag
cctgatccagatggtttgttctcggctcgtatttttggtcctattaaagattatgaatgc
ttatgcggtaaatataagaaaattaaatatcgtggagttgtttgtgaaaaatgtggagtt
gaagttacagtttcacgcgtaagaagagagagaatggggcatgttaatcttgctgctcct
attgctcatatgtggtttgctaaatctttgccaagtagaattggtattatgcttggattg
tctgctaaagacctagaagcagttctaaactttgagaaatatttggttattgagccagca
acatcaccttatgcgaaaggaactctattaagtgaattagaatataattctattgtagaa
gaatatgaagatgaaggatttgaagctgatacaggggctgagtcattagaaaaactattg
aaagaaattaatcttggagaagagattagtgaaatcaatgaagaattgagtgaaaatcct
aatgagtcaaagagaaagagcttgattaggaaattgaaaatccttgaaggtttctataaa
tcaaacacaaggcctgaactttgtattattagagtacttcctattttgcctcctgaattg
aggccattagttgtgttagatggtggtagatttgcttcatctgatgtgaatgatttgtat
agaagggttatcaatagaaataatagactaaagagattacttgctttgaatgctccatta
gtaattttgagaaatgaaattcgaatgttgcaagaatctgttgatgcattatttgataat
gagagaaaaagcagacctattatgcatttgaatagtaagagagagtataaatcacttgca
tattcattaaagggtaagcgaggaatgtttagacaaaaccttcttggtaagagagttgac
tattctggacgttcagttattgttgttggtcctgaattaaggttagatcaatgtggtgtg
cctaaagatatggcgcttgagctatttaagccttttgtaatcgcaagattagaattaaga
ggttttgctcctacatataaatctgcaaagcatatggttgagcataagagaccagaggta
tgggatgttcttgctgaatgtattcaggatcatcctgttcttttgaatagagctcctacc
ctgcataggttaggtattcaggcgtttaaccctgttcttgttaatggtaaagcaatcagg
ttgcatccattggtatgtacagcatataacgctgactttgatggtgaccaaatggctatt
catattcctttgtctattgaagcccaaattgaagcaagagtattaatgatgtctactaac
tgtcttttgaatccttcaaatggtaaggcaattgtgaaaccatcaaaagatatggtgtta
gggttgtactatttaactcttatgctgtctgatgatccaaaagcaatcgtccgtgatatt
gcagaagcagagcatgcattagagagtggtcatattaatattggaactcctattagagtt
gaaattgaagaaggtgataaatctaggatggtgttaacatcattgggtcgtttaaaggtg
tatgaaattactccaaagcatccaaagattggatttgacatgatcaataaagcgttgaat
acatcatcaatttctgagcttgtagaaacaatttatgagcattgtgagaaagatgtagct
gttaaattcttagatgaatttatgaatcttgggttcttatatgcaactatgtctggatct
tcttttggtaaagatgatttgattgttccagaagagaagcatgatttgatagctaagaca
gagcaattagttgaagaatatcgtaagcaatacatggaaggtattattactaatggagaa
aggcataacaaagttacaagcgcatggtctaaatgtgctgatgctgttgctgaaatcatg
atggatagaatgtctgctataaaagatgatcaattaaactctgtatttatgatgtcagat
tcaggagctagaggttctgccatgcagattaggcagattgccggaatgcgtggtttgatt
gctaggtctgatggttctattcaggaagatccagttaagaatagctttaaagaaggtttg
acagttccagaatttctttatgcttcagaaggtggtcgaaaagggcttgtggatatggct
ttgaaaactgcaaactctggttacttaactagaagattggttggagttgctcaagattgt
gtcgtgcatcatgaagattgtggaacttctaaaggtattatgatgaaagctattatgcaa
tcgggtagaacagtagtttcattacgtgatcaactttatggaagaactttgtctaaaaat
gtgattctagagagagatggaaatgaagttgttatagaatctggaacaattgtaacaaga
gatcttgcaagagaaattgaagaatacggtattgaagaagtagaaaccagatctccagtt
tcttgtgaaaatatggatagtactgtttgtgtgaaatgttatggttatgacttatctaag
gctaaacctactatggtgcaagatggagaatctgttggtgtggttgctgctcaatcaatt
ggtgagcctggaactcagttgactatgcgtaccttccattatggtggagctgctcagaat
atttctgaagattctttcattgatgcttctgaaaatgtaacaatcataatgaatgatatt
aaaatagttaataaaggcgattatggaattgtgatgagtagaaataatgagctaaaagtt
aaatctgctaaaaagacatttgcctataatttgccatatggatctaagatatttgtaaaa
gatcaagatgcagtggaagctggatttagaattgctgagtgggatccatataacactcca
attttggccgaagcatcaggtaatttagtttatcatgatctgattgaaggaatttctttg
aaagcttcaatggatgagtccacaggatcacaaaactatactgttagtgattggaatgct
gtatctaaaaaagctaatttgcaacctgcattgaaaattgaattaggcaatagtgataaa
gaatactattatagtttgtccattaatgatgttattttagtaatagataaagaatatgtt
gaaattggagatgttattgctacacgaagtcaaggagccttgaaaacaagagatattgtt
ggtggtcttcctagaattgaagaattgtttgaagctagaagtcctaaatctttggctatt
ttgaatgaagaagatggtagagtaagttttggtaaagattatagatcaaagaaaaagata
attgtgacatcattaagtgatggctctgaaaaagaatatattgcagcaaaagatagatat
atacttgctcaaacaggagatatagtaaagaaaggacaaatcctggttgatggacatgtt
tcgcatcatgatatgttaagaatattaggtgctgaagaaatgtcccatgatttcatagaa
gaagtacagcaagtgtatagaatgcaaggtattactattaatgataagcatattgaaatt
attctgagacgaatgttgagccaaggagaggttctagatccttcatctagctctttcttg
attggagatatagttgatattaaaaaattgaattcaattaatgaaatattaattacaaat
ggtaaagctcctattagattcagaagaatattacagggtattactaagatttccacatct
gctggaagttcattcttatcagctgcatcgttccaagacactgcaagagtgttgactaat
gctgcgttgtttaatgatatagattggattactggtattaatgagagcattatggctgga
atgcttattccagctggaactggtgcttttgtaagaagactcgaaacaggatggaaagaa
gagcttcaaaaagatttcctaactgcatctgcagaatga
DBGET
integrated database retrieval system
