Colwellia psychrerythraea: CPS_0693
Help
Entry
CPS_0693 CDS
T00258
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
cps
Colwellia psychrerythraea
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Alginate_exp
DUF5827
NLP40
DivIVA
CENP-Q
YadA_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ26422
UniProt:
Q488S1
LinkDB
All DBs
Position
698442..699806
Genome browser
AA seq
454 aa
AA seq
DB search
MNNVLKFIAISTLFLFHHQSFAASETELQTEILKQKEQLQLIEKQLAELKTTMISAQEQR
HEEKTASYNNDKNWQINSYGSVLYKSEEIYRNIQDIDPERKASTDLERVVLEFVYDFDAK
WQVEIELEYEHGGVGSTLEYDGFEEFGEFETEIEAGGEVIVEKLQAKYTANENFTIKMGH
IFVPVGLGTDLHKPGQYFTTQRHWSEATLIPQVWHETGVNLISKWQGFTAQTLITTGLNS
EYFRTYEWVATGHQKRFEQVNADDLAITLRLDYGDIKAGKGFGVSYYTGDTSGNRNNTAK
VAGDGNLTIIGLHGAYRYENWQVRGQYLFGTLDDSEAITNANKTTPGLKPGNFAQLGSEA
ESSFVELAYNSQGLFNLKNPLYLYTTYEYANPIKEVEQGNATDRFNKESVALGINYFPIK
NIVLKAQVAQQMYAQSDLDDSTSFSLSMGYFFSI
NT seq
1365 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataacgtcctaaaatttatagccataagtactctatttctctttcatcatcaaagt
tttgcggctagtgagactgagttacagaccgaaatattaaagcagaaagagcaactgcag
ttgattgaaaaacaattagcagaattaaaaacaacaatgataagtgcgcaagagcagcgt
catgaggaaaaaacagcaagttataacaatgataaaaattggcaaattaactcatacggt
agtgtgctttataagagcgaagagatttatcgtaatatccaagatattgacccagagcgt
aaagcgagcactgatttagagcgagtcgtcttagagtttgtttacgactttgatgctaaa
tggcaagtagaaattgaacttgaatatgaacatggcggagtgggttcaacgcttgaatat
gatggttttgaagagtttggtgaatttgaaaccgaaattgaagcaggcggtgaggttatt
gttgaaaagctacaagcaaaatatacagccaatgaaaacttcaccattaaaatgggtcat
atctttgttcctgtcggtttaggcacagacttacataaaccaggtcagtattttacgact
caacgacattggagtgaagccacactcattccacaagtatggcacgaaacaggcgttaac
ttgatcagtaaatggcagggattcacggcacaaaccttaataacaacaggtttaaattca
gagtactttcgaacttatgaatgggtagctacgggacatcaaaaaagatttgaacaagtt
aatgctgatgatttagcaataacgcttcgtttagattacggtgacataaaagcaggtaaa
gggtttggcgttagttattacacaggtgacacttcaggaaaccgcaataataccgctaaa
gttgctggtgacggaaatctcactatcatcggtcttcatggcgcttaccgctatgaaaac
tggcaagttagagggcaatatctctttggtactttagatgacagtgaagcgataaccaat
gccaataaaaccacacctggccttaaaccaggtaacttcgcacaactgggcagtgaagca
gaatcttcatttgttgaacttgcttataacagccaaggtctttttaatttaaaaaatcct
ctttatttatacaccacttatgaatatgccaacccaatcaaagaggttgagcagggcaat
gcaactgatcgttttaataaagaatcagttgccttaggtattaattactttcctatcaaa
aacattgtcttaaaagctcaagtagcacaacagatgtatgcacaaagtgatttggatgac
agcacaagcttcagtctatcgatgggttactttttctcaatataa
DBGET
integrated database retrieval system