Colwellia psychrerythraea: CPS_2003
Help
Entry
CPS_2003 CDS
T00258
Name
(GenBank) choline/carnitine/betaine transport family protein
KO
K03451
betaine/carnitine transporter, BCCT family
Organism
cps
Colwellia psychrerythraea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cps00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
CPS_2003
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ28733
UniProt:
Q483N3
LinkDB
All DBs
Position
complement(2072725..2074332)
Genome browser
AA seq
535 aa
AA seq
DB search
MSKNKEDTDKDKELVVEKSVYRSDHVIGENNVEIMGMDLHNPVFFFSSTLIVVFVLLTLL
FPELAKQSFDASKSWSIDHFDWLFIVSGNLFVLFCLALVVSPFGKIRLGGTEAKPDFSKL
SWFSMLFSAGMGIGLMFWSVAEPVGYFTNWYGTPLNTVAGTPEAAKMAMAATMYHWGLHP
WAIYAVVGLSLAFFTFNCNMPLTIRSSFYPLLGERVWGWPGNVIDITAVLATIFGLATSL
GFGAQQAAGGLSFLFDIPNTINTQIAIIFGVTMVAIFSVTRGLDGGVKLLSNINMSLAVV
LMLFVIITGSTLVIINGVGTTLLAYAENIIPLSNWIGREDETFYHGWTVFYWAWWVSWSP
FVGMFIARISRGRTVREFILAVLFVPTLLTSVWMATFGGMGLEQVQNGVGQLAQGIGDSS
LALFQMLENLPLSNVTSFLAIVLVLIFFVTSSDSGSLVIDSITAGGKVDVPVPQRIFWAA
IEGVIAAALLFGGGKDALGALQAAAITVGLPFTVLLIVMCFGLFLGLKREYKKLS
NT seq
1608 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaaaaacaaagaagatacagataaagataaggagcttgttgttgaaaagtcagtt
taccgatctgaccacgtgattggagagaataacgtagaaataatgggcatggacttacat
aatcctgtgttctttttctcatctacacttattgttgtatttgttctattaaccctacta
ttccctgaattagccaaacaatctttcgatgcatcaaaaagttggtctatcgaccatttt
gactggctattcattgtcagcggtaacctttttgtccttttttgtttagccttggttgtt
tcaccttttggaaaaatccgactcggtggtactgaagcaaaaccagactttagcaaattg
tcttggttttctatgctattttctgccggaatgggcataggtttaatgttttggagtgtt
gcagagcctgttggttacttcactaattggtatggcacccccctaaatacggttgccggt
actcccgaggcagctaaaatggcgatggcggcaacaatgtatcactggggattacaccca
tgggccatctatgccgttgtaggcttgtctttagctttcttcacttttaactgcaacatg
ccattaaccatccgctcttctttttacccattgttaggcgagcgagtttggggctggccg
ggcaatgtcattgatattaccgcggtattagctactatttttggtctcgctacttcttta
ggttttggggcacaacaagcggctggaggtttaagcttcctattcgatatacccaatacc
ataaacactcagattgccattatatttggcgttaccatggtcgccatattctcagtgact
cgaggcttagatggtggggttaaactattaagtaatatcaatatgtcacttgcggttgta
ttaatgttatttgttattattacgggctctactttagtgattattaatggtgttggcaca
accctgcttgcctatgccgaaaatattattccgttaagtaactggattggtcgtgaagac
gaaacgttttaccatggctggactgtattttattgggcttggtgggtttcttggtcaccg
tttgtcggtatgttcatcgcaagaatttcgcgcggcagaacggttcgtgaatttatatta
gcagtattatttgttcctactttacttacatcagtatggatggcaacctttggcggcatg
ggtcttgaacaagtacaaaatggtgtaggtcaattagctcaaggcattggtgatagctcg
ttagcactatttcaaatgttagagaacttgcctttaagcaatgttacttcgttcttggcg
attgtcttggtattaattttctttgtcacttcatcagattcaggctctttagtcatagac
agtattaccgctggtggtaaagtagatgtgccggttccacaaagaatattctgggcagct
atcgaaggtgttattgctgctgcattattatttggtggtggcaaagatgcattgggtgct
ttgcaagctgcagccatcacagtcggtttaccttttaccgtactattaattgttatgtgt
ttcggtttattcttgggattaaaaagagagtataaaaaactaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
