Colwellia psychrerythraea: CPS_3760
Help
Entry
CPS_3760 CDS
T00258
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cps
Colwellia psychrerythraea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cps00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cps02000
]
CPS_3760
Transporters [BR:
cps02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CPS_3760
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ26620
UniProt:
Q47XP3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3921786..3924689)
Genome browser
AA seq
967 aa
AA seq
DB search
MYNNSKVAKAIRLAMIVSASAAATISAPVFAAEADELESVERISVTGSRIKRAELSTPSP
TLTINAQELVRFGNPDLGSMLAELPALGATSTIIGNNNDGAEAGVSSVDLRRLGTKRTLV
LINGKRHVAGSPGSSQVDLSTIPAALIERVEVITGGASAIYGSDAVSGVVNVILKKDFDG
LEFNLTGGNSTESVGNENYTFSVLGGTDIADGRGNITFFAGIEDTTEVMSSAVRQWDSWG
SVINPDNEGEEDGVFDKFRRPNVGSEMINDFGVMNPFSGDRFTFDKSGNRQDACSRSLDN
SFAFGELEASCGDRGFFGEQYENYIPGVQRTTVGSTINYEITENINFFGDFKYTRADIQQ
QFQPSFRFGSIDINVADNAFLSDEARAELGGTGTASMAKFFGELGNRSSNHNRELFRFVG
GLDGFFSLGDTDVDYELFYIYGETSNNRVSENDLIPGNLAAGIDSVIDPATGQAVCRSQL
ESAQDADYSDPATVDAGSCVAYNPFGFAQSSPEALDWVSADVTRKDVIKQEVIGGSLAGD
TGAFFELPGGAVGIAAGFEYRTESSSTITDELTKSGATTNSATPDEFGEYDVTEMFVEVS
LPLISGQFLAEELTLDGAYRYSDYSHAGSVDAWKVGMMYAPIADLRFRGTYGAAVRAPNI
SEAFSPLSPGFARVSDPCDADNILDDPDRVSNCAALGIPVGFEANDNVSIDTFSGGNDEL
TPEESTSLTIGTVWTPSYLENFSITLDFYDIEIKDAIIEVESQDIADNCVDATGGPDAVY
CGAVDRSATTYDIDLVRSGFLNASAYNTSGIDVEMRYNFALDSLGVPGELYLKLFVNKLL
ELEQFEFQDRPDEINVEVGETGDPELQASFSATYNLDDLSVTWQSRYIDRVVTYDVSPGG
GSPEDLEQGYIPSVTTHDLSFNYIVSENVKVNAGLRNIFDKLPKGWTNDPLYDLVGRRAY
AGVTVNF
NT seq
2904 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataacaatagtaaagtagctaaagcaatacgactagctatgatagtgagtgcaagt
gcagcagcaacaatttcagcgccagtttttgcagctgaagctgacgaacttgaatcagta
gagcgtatttccgttactggttctcgaattaaaagagctgaattatcaacaccatctccg
acactcacgattaatgcgcaagagttagtgcgctttggtaacccagatcttggtagtatg
ttagccgaattgcctgcacttggtgcaacaagtactattattggtaacaataatgatggc
gctgaagctggtgttagctctgttgatttacgtcgtttagggactaaacgtactttagtc
ttaattaatggtaaacgtcatgtagccggctctcctggttcttctcaggttgatttatca
acaatcccagcagctctaattgaacgtgttgaagtcattactggtggtgcttctgctatc
tatggttcagatgctgtttcaggtgttgtaaacgttatcttgaaaaaagactttgacggt
ttagagtttaatttgaccggtggtaattcaactgaaagtgttggcaatgaaaactatact
ttcagtgtgttaggcggtaccgatatagctgatggtagaggtaatattactttcttcgct
ggtattgaagataccactgaagtgatgtcttcagctgttcgtcaatgggatagctgggga
tctgtaattaaccctgataatgaaggcgaagaagacggtgtttttgataagttccgtcga
cctaatgtcggttctgaaatgatcaatgatttcggtgtcatgaatccatttagcggcgat
cgttttacttttgataaaagtggcaatagacaagatgcttgttcacgtagtttagataat
agttttgcttttggtgaacttgaagcaagttgtggtgatcgtggtttcttcggtgagcag
tatgaaaactatattcctggcgtgcaacgtactacagttggttctactataaattatgaa
attactgaaaatatcaatttcttcggtgactttaaatataccagagctgatatacagcag
cagtttcaacctagcttccgattcggtagtattgatatcaatgttgcagataacgctttc
ttaagtgatgaagcaagagctgaacttggtggaaccggtactgcttctatggctaagttc
tttggtgaacttggtaatcgctcttctaatcataatcgtgaattgttccgttttgttggt
ggtttggatggtttcttctcattaggagatactgatgtagattatgagttattttacatt
tatggtgaaacaagcaacaaccgtgtaagtgaaaacgacctgattccaggtaatttagct
gcgggcattgattcagttattgatccagctacaggacaagcagtttgtcgtagtcaactt
gaaagtgctcaagatgctgattacagtgatcctgctacggttgatgctggtagttgtgtt
gcttataacccatttggttttgcgcaatcttctcctgaagcattagattgggtttctgcc
gatgtaacgcgtaaagatgttattaagcaagaagttattggtggtagtttagctggtgat
acaggtgcattcttcgagttacctggtggtgctgttggtatagccgctggttttgaatat
cgtactgaatcatcatcaacgattactgatgagttaactaaaagtggtgcaactactaac
tcggcaacacccgatgaatttggtgagtatgacgtaactgaaatgttcgttgaagttagc
ttaccacttatttcaggacaatttttagctgaagaattaacacttgatggtgcataccgt
tactctgattattctcatgcaggatctgttgatgcatggaaagtaggtatgatgtatgcg
cctattgcagacttacgcttccgtggtacttacggtgcagcggtacgtgcgccaaacata
tctgaagcttttagcccactatcgccaggttttgcacgtgtaagcgatccgtgtgatgct
gataacattcttgacgatccagatcgtgtaagtaactgtgctgcattaggtattcctgtt
ggattcgaagcaaatgataatgtaagtatcgatactttctcaggtggtaatgatgagtta
acaccagaagagtcaacttcacttaccatcggtacagtatggacgcctagttatttagaa
aacttctcaattacattagatttctacgatattgaaattaaagatgcaattattgaagta
gaatcacaagatattgctgataactgtgtggatgcaactggcggtcctgatgctgtatat
tgtggtgctgtagatcgtagtgcaacaacatatgatattgacttagttcgttctggtttc
ttaaatgcttctgcttataatacttcaggcattgatgtagaaatgcgttataactttgca
cttgatagtttaggtgttccaggcgagttatatttaaaattattcgtaaataaactgctt
gaattagagcaatttgaatttcaagatcgtcctgatgaaatcaatgttgaagttggtgaa
acaggtgaccctgaattacaagcaagtttttcagcgacttataacttagatgatttatca
gttacttggcaatcacgttatattgatcgtgttgtaacttatgatgtatcacctggtggc
ggttcacctgaagatttagaacaaggttatattccttcagttaccacccatgatttatcg
tttaattacattgttagcgaaaatgttaaagtgaatgctggtcttcgtaatatttttgat
aaattaccgaaaggctggacgaatgatccattgtatgatttagttggtcgtcgtgcctat
gcaggtgtaactgttaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system