Colwellia psychrerythraea: CPS_4519
Help
Entry
CPS_4519 CDS
T00258
Symbol
hepA
Name
(GenBank) RNA polymerase-associated protein HepA
KO
K03580
ATP-dependent helicase HepA [EC:5.6.2.-]
Organism
cps
Colwellia psychrerythraea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cps00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
cps03021
]
CPS_4519 (hepA)
Transcription machinery [BR:
cps03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
Other transcription-related factors
RNA polymerase-associated proteins
CPS_4519 (hepA)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RapA_C
Tudor_1_RapA
Tudor_RapA
Helicase_C
SNF2-rel_dom
ResIII
DEAD
AAA_34
DUF8091
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ26843
UniProt:
Q47VK5
LinkDB
All DBs
Position
4768647..4771574
Genome browser
AA seq
975 aa
AA seq
DB search
MPFQVGQRWISDSESDQGLGTVTGVEHRFVNIVFTATGESRKYAKDNAPLTRVIFNKDDL
IPSHEGWSLKVISHSEAQGIISYEGIRQDTNEQIILKEVMIDHFIKFNKPHDRLLNSQVD
RLDWFRLRKDCLQHQYQQQQSDLTGLTGGRVSLIPHQLYIADEVGNRFAPRVLLADEVGL
GKTIEAGLIIHQQLVTGRAKRILIIVPESLMHQWLVEMLRRFNLNFSIFDNERCVETSQD
NYVDGKKANPFSSEQLVLVNLGFITNNPQWFDALVSEDWDLMVVDEAHHLNWQQDKPSIE
YQCIEQLAQVIPGVLLLTATPDQLGHESHFARLRLLDADRFYDYQKFTEEESHYSEVADA
ANALVEGKPLSSEQETTLSDLLKETDISIQLTELNQADSKESAKVRQGLLKQLLDRHGTG
RILFRNSRNTIKGFPARQVVPTVLIMPEQYQENINEFMLSDCPEALAKSKQAKYIFTPEM
LHGLDQRNDTWTDFDPRVDYLIDLLQSLKREKVLVICANAQTAIDLEAVLRIKEGIRSAV
FHEGLSIFERDKAAAYFAQDEDSAQLLLCSEIGSEGRNFQFAHHLVLFDLPSNPDLLEQR
IGRLDRIGQTEIIRIHVPYFADSAQQLLFDWYQQGMQAFEHTCITGRVVFETFGEQLLSL
ALSCQQQSVEAESLISDSWQKHLSIKAELESGRDKLLELNSSGQGRAHELVEKIQQVDND
INLPQFMFQALDVFGVQQDDKADNAIALNQSEHMLNSNFPCLPEDGTTVTFDRETALVNE
NYQLLTWDHPMVRGVMDLVLSDEIGNASIGLLKNEALPVGTFFLECLFTVEATAPAHLQL
GRYLPTTPIRILVDKNGNNLADKVSEKVLDKQLSPVKKQMALQLIKALKTQITPLVAKAE
IHGEQHIVEIQKKSLAAMQSKLSLEHHRLTALKAINPSVRQEEIDFISQQQDELSHYIDK
AQLTFEAIRMIVVTH
NT seq
2928 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccatttcaggtaggtcagcgttggatcagtgacagtgaatcagatcaaggattaggt
acagtaacaggggttgaacaccgctttgttaatattgttttcactgctacaggtgaatcc
cgcaaatatgctaaagataatgccccactaacgcgtgttatatttaataaagatgacctt
attcctagccacgaaggctggtctttaaaggtaatttcacatagtgaagcccaaggtatc
atcagctatgaaggtatacgccaagataccaatgagcaaatcatcctaaaagaagtgatg
atagatcactttattaaattcaataaacctcacgaccgcttacttaatagccaagttgat
cgtttagactggttccgcttgcgcaaagattgtttacaacatcagtatcaacagcagcaa
tctgatttaacaggtttgacgggcggtcgagtcagcttaataccacaccagctttacatt
gccgatgaagtcggtaatcgctttgctccgagagttttacttgccgatgaagttggctta
ggtaaaacaattgaagccggtttaataatccaccagcaattagtcactggtcgtgcaaaa
agaattttgatcatcgtgccggaatctttaatgcatcaatggctggttgaaatgctacgc
cgatttaaccttaactttagcatttttgataatgaacgctgtgttgaaaccagccaggat
aactatgttgatggtaagaaagctaatccttttagttcagaacaattggtattggttaat
ctaggttttatcactaataatccacaatggttcgacgcactggttagtgaagattgggat
ttgatggttgtcgatgaagcgcatcacttaaactggcaacaagataaacctagtattgaa
taccaatgtattgaacaactcgcgcaagttatccctggagttttattattaaccgctact
cctgaccaattaggtcatgaaagtcactttgctcgcttgcgtttacttgatgctgaccgt
ttttatgattatcaaaaatttaccgaagaagagtcccactatagtgaagttgctgatgcc
gccaatgcattagttgaagggaagcccctttctagtgagcaagagacaacactctctgat
ttattgaaagaaactgatatcagcattcaactaacagagttaaaccaagcagacagtaaa
gaatcagcaaaagtacgccaaggtttattaaaacagttactcgacagacatggtactggt
cgtatcttgtttagaaactctcgaaatactattaaaggttttcctgcccgccaagtagtg
cctacagtacttattatgcccgagcaatatcaagaaaatattaatgagtttatgctcagt
gactgcccagaagccctagctaaatcaaagcaggctaaatatattttcactccagaaatg
ctacacggcttggatcaacgaaatgatacgtggactgattttgatcctagagttgattat
ttaattgacctattacagtcgcttaaaagagaaaaagtcttagtcatttgtgcaaacgcc
caaacagctattgatttagaagccgttcttcgtattaaagaaggtatccgcagcgctgtt
ttccatgaaggtctatcgatatttgaacgcgataaggctgccgcctattttgcccaagac
gaagatagtgctcaattattgctttgttctgagattggtagtgaagggcgtaattttcaa
tttgctcatcatctagtactttttgacttaccaagtaaccctgatttattagagcaacgc
attggccgcttagacaggatcggacaaacagagataatccgtattcatgtgccttacttt
gcagattcggcacagcaattattatttgattggtaccaacaaggtatgcaagcatttgag
catacttgtattacgggtcgagtggtttttgaaaccttcggtgagcaattactctcatta
gcattaagctgccagcagcagtcagttgaggcagaatcactcatcagtgatagttggcag
aaacatttatctattaaagcggaattagaatctggccgagataaattattagagctgaac
tcatctggacaaggtcgtgcacatgagttagttgaaaaaatccaacaagttgataacgac
ataaacttgcctcaatttatgtttcaagcactagatgtttttggtgtgcagcaagatgat
aaagccgataatgctattgccttaaatcaaagcgagcatatgcttaatagtaacttccct
tgcttacctgaagacggcactacggttacttttgatagagaaacagccttagttaatgaa
aattatcaattattaacgtgggatcatcctatggttcgtggggtaatggatttggtcttg
agcgatgaaattggtaacgccagtattggtttattaaaaaatgaagcgttaccagtaggc
acatttttccttgaatgcttatttactgttgaagctaccgcccctgctcatttacagtta
ggtcgttatttacctactacgccaattcgtattctggtagacaaaaatggcaataattta
gccgacaaagtcagtgaaaaagtacttgataaacaattatcaccggttaaaaagcaaatg
gcattacaacttatcaaagcacttaagacccaaataacgcctttggttgcaaaagcagaa
atacacggcgagcaacacattgttgaaattcaaaagaaatctttagctgctatgcaaagt
aaactctcattagagcatcataggttaaccgcattaaaagcgattaacccaagtgtgcgc
caagaagagattgactttattagccaacaacaagatgaattgagccactatattgataaa
gcgcaattgacctttgaagccattcgcatgatagtagttactcactaa
DBGET
integrated database retrieval system
