Chlamydia psittaci 01DC12: BN356_6133
Help
Entry
BN356_6133 CDS
T02343
Name
(GenBank) polymorphic outer membrane protein
Organism
cpsd
Chlamydia psittaci 01DC12
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
ChlamPMP_M
Chlam_PMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCO02119
LinkDB
All DBs
Position
713071..715617
Genome browser
AA seq
848 aa
AA seq
DB search
MKHPVYWFLISSSLFASNSLSFAEVTQATLTPSDSYNGNVTSDEFKVKETSSGATYTCEG
NVCISYAGLSNSGLSNSCFTDSAGDLSFIGNGYSLCFDNITTQASNPGAINVKGSGKTLN
VSGFSLFSCAYCPPGTTGYGAIKTLGNTTIKDNSSLVFHKNCSKTDGGVIYCKASSGTTE
LKIENNQNLVFSENSSNTKGGAIFTQKLTITSGGPTLFSNNSVSHDSTPKGGAICLDDTS
SECNLTADLGDIIFDGNKIITTSEGSSTVKRNSIDLGSGGKFTNLRAKDGFGIFFYDPIA
NQGDTGAEIELNKTESGTNYTGKIVFSGEKLSDEEKTDPDNLKSYFTQPLKIGAGSLVLK
DGVTLEAKQVTQTAGTVVMDLGTTLQTPSSSGETITLTNLDINIASLGGGGGTSPAKVAA
NTDSKKVTITAVNLVDADGNTYEDPILSSSKPFTAITAKSGSSATTTAPTTNLENYTPPT
HYGYQGNWTVTWKEGSSAQEQIATLTWEQTGYSPNPERQGPLVPNTLWGSFSDIRAIQNL
MDISVNGADYHRGVWVSGLANFLHKSGSDTKRKFRHNSAGYALGVYAQTPSEDVFSAAFC
QLFGKDKDYLVSKNNANIYAGSLYYQHISYWSTWQNLLQNTIGAEAPLVLNAQLTYCHAS
NDMKTNMTTTYAPLKTTYSEIKGDWGNDCFGIELGATVPIQTESSLLFDMYSPFLKLQLV
HAHQDDFKENNSDQGRYFESSNLTNLSLPIGVKLERFAHNDTASYHVTAAYSPDIVRSNP
DCTTSLLVSPTSAVWVTKANNLARSAFILKAGNYLSLSHNIELFSQFGFELRGSSRTYNV
DLGSKIQF
NT seq
2547 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatccagtctactggttcttaatatcctcgagtctatttgcctcgaattccttg
agctttgctgaagtaactcaagcaaccttaactccctctgatagttataatggaaatgta
acatctgatgagttcaaggtaaaagaaacttcatcaggagcaacgtatacttgtgaaggt
aatgtgtgtatctcatatgcagggttaagtaactcaggcttatccaatagttgctttact
gattctgctggtgatctctctttcataggaaatggttattctctttgctttgataatatc
actacacaagctagtaatcctggagccattaatgttaaaggtagcggaaaaaccttaaac
gtctcaggattttcattattttcatgtgcttattgtcctccgggcacaaccggttacgga
gctattaaaactttagggaataccactatcaaagataactctagtcttgtcttccataaa
aactgttcgaaaacagatggtggcgtcatttactgtaaagcaagcagtggtaccacagaa
ttaaaaatagaaaataatcagaacctcgttttctcagagaactcttctaacaccaaaggc
ggggctatatttactcaaaaactcaccataacttccggtgggcctacgttattttctaat
aactctgtgtcccatgattcgacacctaaaggcggagctatttgtttagatgataccagc
agtgagtgtaacctaaccgctgatctcggggatattatcttcgacggaaacaaaatcatc
acaacaagtgaaggaagttctacagtcaaaagaaattccatagatcttggctctggtggg
aaatttacaaacttaagagctaaagatggcttcggaattttcttttacgaccccattgct
aatcaaggggatactggagcagaaatagaattaaataaaactgaaagcggcactaattat
acaggtaagattgtcttctcaggtgaaaaattatccgacgaagaaaaaacagacccggac
aatctaaaatcatatttcacacaacccctaaaaatcggtgcgggttccttagtccttaag
gatggtgtcactttagaagcaaaacaagtcacacagacagcaggcactgttgtcatggat
ttaggcactacgttacagacaccttcctcaagtggagaaaccattaccctaactaattta
gatattaacatcgcctcattgggggggggggggggtacctctcctgctaaagtcgcagca
aatacagacagtaaaaaagtcaccatcacggctgtcaatctagtcgatgctgatggcaat
acttatgaagatcccatcctctcttcatccaaacctttcacagcaataacagcaaaatct
ggttctagcgccactactactgcacccacaaccaatctagaaaactatacccctcctacc
cattacggttaccaaggaaattggacggtaacttggaaagaaggatcaagcgcccaagag
caaatagccactctaacttgggaacaaactggttattctcctaacccagaacgtcaagga
cctttggttcctaacactctttggggttccttctcggatatccgtgctatacaaaactta
atggatattagcgtcaatggagctgactaccatagaggggtctgggtatccggtctagct
aacttcttacacaaaagcggttctgatacgaaacgcaagttccgtcacaatagtgctggg
tatgccttgggtgtgtatgcacaaactccttcagaagacgttttcagtgcggctttctgc
caactcttcggaaaagacaaagactatttagtgtcgaaaaacaacgccaacatttacgca
ggttctctctattaccaacatatctcttattggagcacttggcagaacctgctacaaaac
actatcggtgcggaagctccgttagtccttaacgcacagttaacttattgtcatgcttca
aatgacatgaaaacaaacatgacaactacctacgctcctcttaaaacaacgtattcagaa
atcaagggtgattggggtaacgattgtttcggaatcgagcttggggcaactgtgcctatc
caaacagaatcttctctcctattcgatatgtattcacctttcttaaaactccaacttgtg
catgcgcaccaagatgactttaaggaaaacaatagtgatcagggaagatatttcgaaagt
agcaatctcactaacctttctcttcctatcggcgtgaaactagagagattcgctcataat
gatactgcttcttatcacgtcactgctgcttattctcctgatatcgtaagaagcaaccct
gactgtaccacttctctgttagtgagcccaacctctgccgtctgggtaactaaagctaat
aacctcgctcgaagtgctttcatactaaaagcaggaaattatttgtctttaagtcacaac
atagaattgttcagccagttcggtttcgaactcaggggctcttctcgaacctataacgta
gatctcggatcgaagatccagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system