Chlamydia psittaci M56: B602_0232
Help
Entry
B602_0232 CDS
T02310
Name
(GenBank) autotransporter beta-domain protein
Organism
cpsm
Chlamydia psittaci M56
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Chlam_PMP
ChlamPMP_M
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS25072
LinkDB
All DBs
Position
complement(217394..222775)
Genome browser
AA seq
1793 aa
AA seq
DB search
MKWLSATAVFAAVLPSITVFGEPLSKELNSSYRGSGSSASDSLSKNFTQKTQDDIGTTYT
ITGDVSFTTFTNIPDPKPTRVVEPNPAPQSSTGSSKQKSESKRSTATGYESTFTQPQEKW
YHSPDDLNVTSFASYVLDGDQGTFDIGKFADEKPNPLGFSLSSASSTAVSTSTTDASIST
PKGGGAFYNDKMGPVTFITHAGNPGSLSCSLITMTGQGGAIYSKGPISFDGLENLTFQDN
LSQQSGGALFTDSTLTIRNILNSIEFTNNAAHVPIPLIPLLSSTPATGAEVGGLVPSKLK
ETDLFPRYFSQESTAQEAGTQTSTFTTYTTETAGNGGAAFAKGAIVISTYKDMTFRGNSA
EFPPIIDVIKEQIDAQNKAKAAKSPLVPETVQASAEVAKQQAEQTPPVIKGSGGAIFGLD
TITISDGSEDTLFILNTATGAGGAIYGDKTISLNNIANLRFQSNSADTRGGAIYSKGNLT
IQDSTILTQFNANSGKTGGGAIYCLGDVTLTNLSQVRFGVNKAGNYDLKITIPSKELLVA
QALPSSVAEQLAPKPLVPPLGKGGGIYVEKAFTVSNITSILEFINNQATDHGGGAYVKGE
LNCSNSHRIQFTTNTSKLSGGGLYCESDVTFTNLTGKTLFQGNTATENGGGICLADTKSL
TLSNLESFCLVNNTSSKSGGGAYIPKALSFTFPNPNTSSSTTPTIVPVFGSAVITGNTAT
ENGGGVYTTQASLTNLELIDIGQNSAKNGAGLCTTSIPAGVLAIAAQPEEELDFKVDYVI
TANVTKNNATESGGGVYGKKGKISRLDHLNITGNSAGKSGGGLYFTEALTLEGIEISKIS
DNTAKESGGAIYAKVLTCTNLPDGLTVSNNKAQVTSTTKSGKEIASVPTDITGGAFYAET
LTLENLKGSCTFSGNKAIDNNNTASSDSPADPNIQGGAIYAKTTFTLQNSSGSLTFSGNS
AITQRSTTTGQIAGGAIYAPTVKIQNCSQPINFVGNSALCTLAEQPAAEGRAGGAGTPKA
TFGGAIAGTTSITFTGNQALFFKENSADNGSAIGCKNGSSQNSTITFSDSMFCSFEKNTA
KNRGVIYADTLSIPQGHMNFSNNSSANDGSAIYFTTKADITAASSILFLDNKVTLAQTPE
QKHSQVKNLGAAIYGEGNNSTDAILNLTALGGSITFKNNQCAPAAQKVAPSFCSITGKIK
LALNAAANQSINFYDAVRTQTVKSSSNSYETLDINKTSNGGNTTKYTGTVLFSSEYHENK
SVIPQKVVLHDGTLVLGKNTELNIVSFEQKPGSLLVMGPGAVLSTQLKSGRSGSTGGIAI
NNLTIDFSDIVSENGDASPPALKLGVSPAAAAVHRAHIAKNNVLPRADVSNPDVTQEKIY
LTGTLTLIDPSGTFYQNPYLGEDRQIELLKLPTESSKVVISELTLAGDTKPLKGYIGSWT
LGSTDQGGTLQANWKFEEYRRWIYIPRDNYFYVNSILGSQNSLIAVKQGIVNNMLNNARF
DDAAYNNLWLCGIGSFLQKEQGEESRSFSYHSRGYSLAIDAKPRPEFILGASFSQVFGHA
KSEKAVDNYKHKGSDHSFQGTLYAGKAFYLPYKRTKSPRPILLQGVMTYGYMKHDTTTYY
PSIHERNIGNWEDLGWLFDIRMILDLKEPSQNSTTRFSFYSEAEYTGVRQKQFTELDYDP
RTFDSFPYRNLAIPLGFVLEGAIMQYDILMYNKLSLAYVPVIYRNKPKCNYRVNSTGQTG
KVYGVIPSRNAGRAEYSSQVYLGPYWTLYGTYTIEAGMSSLVQIANCGARMIF
NT seq
5382 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtggctatcagctacagctgtttttgctgccgtactcccctcgattacagtattt
ggtgaacctctttcgaaagaattaaactccagctacagagggtcgggctcaagtgcttcg
gattctttatcaaagaatttcacgcagaaaacacaagacgacatcggaacaacatacaca
attactggagacgtctctttcacaactttcactaatattcctgatcccaagcctactcga
gtagtagaacctaatcctgctccacaaagtagtactggctcaagcaaacaaaagagtgag
agtaagcgaagcactgcaacaggatatgagagtacttttacacaacctcaagaaaagtgg
tatcatagcccagatgacctgaatgttacatcatttgcttcgtatgtgttagatggggat
cagggaacttttgacatagggaagttcgcagatgaaaaacctaaccctctaggtttctca
ttatcttcagcatcttctactgccgtctctacctccaccacagatgcgtctatttctact
cctaaaggcggaggtgctttttacaatgacaaaatgggtcctgtaacattcattacacat
gcaggaaacccaggatcattatcctgctccctaattacaatgacaggacaaggtggggct
atatactccaaaggtcctatatcttttgatggattagaaaaccttacgttccaggataat
ctatcccaacaatctggtggtgctttatttaccgactccacactaacaattaggaatatc
ctaaactctattgaatttacaaataacgctgctcacgttcctatccctctgattcccctt
ctatcatcaacaccagcaactggagctgaagttggtggtttagttccttctaaattaaag
gaaacggatctctttcctagatacttctctcaagaatcaacagcacaagaggcagggact
caaacatctacattcacaacctacacgacagaaactgcagggaatgggggtgccgctttt
gctaaaggcgctattgtcatctctacttacaaagatatgactttccgaggaaactctgca
gaatttcctcccattattgatgtaattaaagaacaaattgatgcgcagaacaaagcaaaa
gcagcaaaatcacccttagttcctgaaacggttcaagcctctgcagaggtggctaaacag
caagcagaacagactcctcctgttatcaaaggctctggaggagcaatttttggcttggat
actattaccattagtgatggttctgaagacactctctttatattaaatactgctacagga
gctggaggagccatttatggagataaaaccatctcccttaataacattgctaacttaagg
ttccaaagcaactccgcagatacgagaggcggagcaatttattcaaaagggaatcttaca
atacaagattccaccatactcacacaatttaatgcgaacagtgggaaaacaggtggtggg
gctatctattgcctaggggacgtaaccctgaccaacctttctcaagtccgttttggtgtt
aacaaagctggaaactacgatctcaaaattactattccaagcaaagaactacttgttgct
caagcactgccttcctcagtagcagaacaactagctcccaagcctcttgtacctccttta
ggaaaaggtggaggtatctacgttgagaaagctttcacagtttctaatattacttccatt
ttagaatttataaataaccaagccacagatcatggtgggggtgcgtacgtcaaaggggaa
ctaaattgtagtaattctcacagaatacagttcacaacaaacacctcaaaactatctggg
ggcgggctgtattgcgaaagcgatgttacctttaccaacctcacagggaaaacactcttt
caaggcaacacagccacagaaaatggtggcggtatctgtctagctgacaccaaatctcta
accttatcaaacttagagagcttttgtttagtcaacaatacctcaagcaaaagtggtggt
ggagcatacattcctaaagcgctttcttttacattccccaatccgaatacttcctcttct
acaacaccaactatagttcctgtctttggaagtgctgttatcaccggcaacacagccaca
gaaaatggtggcggtgtctacacaacgcaagcttcgttgactaaccttgaattaatcgat
atcggtcaaaactctgctaaaaatggtgctgggctgtgtacgacaagcattccagcaggt
gtcttagcaattgcggcacaacctgaagaagagttagactttaaagttgattacgttatt
acagccaacgtaacaaaaaacaatgctacagaaagtggtgggggcgtttatgggaaaaaa
gggaagatctctcgtctagaccatctaaatattaccggaaactctgcaggaaaatccggt
ggtgggctgtatttcacagaagcattgactcttgaaggtatagaaatttcaaagatttca
gataatactgcaaaagaatccggtggggctatctatgccaaagtacttacctgcactaac
cttcctgatggactaactgtaagcaataacaaagcacaagttacctcaactactaaatca
ggaaaggagatagctagtgttcctactgatatcacaggtggagctttctatgctgaaacg
ttgaccttagaaaatctgaaaggaagttgcaccttctctgggaacaaagccattgataat
aacaacacagcaagttctgatagtcctgctgatcctaatattcaaggtggggctatctat
gctaagaccacattcacgcttcaaaatagctcaggaagtttaaccttctcaggaaactct
gcaataacgcaacgatcgacaacaacaggacaaatagctggtggagctatttatgctcct
actgtgaaaattcaaaattgttcacaacccataaattttgtaggcaattctgctttatgc
actctagcagaacagcctgctgcagaaggtcgtgcaggaggagctggcacaccgaaagca
acctttggtggagctattgcaggaacaaccagcattacatttacaggaaaccaagcacta
tttttcaaagaaaactctgcggataatggttcagctattggatgtaaaaacggttcttcc
caaaacagtacaataacattctctgactctatgttctgctcctttgaaaagaatacagct
aagaatcgcggtgttatctatgcggatacgttatccattcctcaaggacacatgaacttc
tctaacaatagctctgctaatgacggtagtgctatttacttcacaacaaaagcggatatc
acagcagcttcttctattctgttcctggataacaaggtaactctagctcaaactccagaa
caaaaacactctcaggttaaaaacctgggtgcagcgatctatggggaaggaaataacagc
actgatgctatactaaaccttacagccctaggcggtagcattacatttaaaaataaccaa
tgcgcacctgcagcacaaaaagtcgcgccttctttctgcagtattacaggaaaaattaaa
ctcgctcttaacgctgcagcaaatcaatcgattaatttctatgatgctgtaagaactcaa
acagttaagtcttccagtaatagctacgaaaccctagatattaataaaacatcaaatggg
ggtaatactaccaagtacacaggaactgtattattctcttcagaataccacgagaataaa
tcggtcattccgcaaaaggttgtcttacatgacgggaccttagtcttagggaaaaataca
gagttaaatattgtttccttcgagcaaaaacctggatctttacttgtgatgggaccagga
gcagtactttctactcagctaaagagtggaagatcagggtcaactggaggcatagccatt
aacaacctcactattgattttagtgatattgtttcagaaaatggagatgcctcccctcct
gctttaaaattaggtgtatcgcctgcagcagcagcagtacatagagctcatattgcaaag
aacaacgttcttccaagggcagatgtatccaatccagacgtaactcaagaaaaaatctat
ttaacaggaacacttactcttatcgacccttcgggaactttttaccaaaatccttactta
ggcgaagatcgtcagattgagttactcaaactccccacagaaagtagcaaagtagtgatc
tctgaattaactctagcaggagatacaaaacctctaaaagggtatattggctcttggaca
ctaggatcaactgatcaaggaggaactctccaagctaattggaagtttgaggagtaccgc
cgctggatctacatccctcgagacaactacttctacgtgaactctatcctcggttctcaa
aactctctcattgctgtaaagcaaggtattgttaacaacatgcttaacaatgcacgtttt
gatgatgctgcttacaataacctttggttatgtggtataggctcgttcttgcaaaaagaa
caaggagaagaatcaagatccttctcctatcatagccgaggttattcattggctatcgat
gctaaaccacgccctgaatttatccttggagcttcgtttagccaggtgttcggtcacgct
aaatcagaaaaagctgtagataattacaagcataaaggttctgaccactccttccaaggg
acgttatacgccggcaaagccttttatttgccttataaacgcacgaaatcccctcgacct
atactgcttcaaggggtaatgacatatggctatatgaagcacgatacaactacctattac
ccatcaattcatgagcgcaatattggaaattgggaagatcttggttggttgtttgatatc
cgtatgattctcgacttaaaagagccttcgcaaaactctacaacaagattttctttctac
tctgaagcagagtacacaggagtacgtcaaaagcaatttacagagcttgactatgatcct
agaacattcgactccttcccctatagaaatcttgccatacctttaggcttcgttcttgag
ggtgcaataatgcaatatgatattcttatgtataacaaattatcccttgcttatgtacct
gtgatttacagaaacaaacctaaatgtaattacagagttaactctacagggcaaactggg
aaagtgtatggtgtcattccaagcagaaatgctggaagagctgaatatagttcgcaagta
tatcttggcccttactggacgttatatggtacgtacactatagaagcaggaatgtcttca
ttagttcagattgccaactgtggcgcacgtatgatattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
