Chiloscyllium punctatum (brownbanded bambooshark): 140494600
Help
Entry
140494600 CDS
T11285
Symbol
fbn2b
Name
(RefSeq) fibrillin-2b
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
cpun Chiloscyllium punctatum (brownbanded bambooshark)
Pathway
cpun04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpun00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
140494600 (fbn2b)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cpun00536
]
140494600 (fbn2b)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cpun00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
140494600 (fbn2b)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140494600
NCBI-ProteinID:
XP_072450052
LinkDB
All DBs
Position
24:complement(59979305..60381057)
Genome browser
AA seq
2898 aa
AA seq
DB search
MGVWWIAKFVLGCTALISPSLEDALSQQENHFGAPRFTGAGDRDLQARVRRRGQDNLRGP
NVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNTCGDGFCSRPNMCTCANGQLSPGCGSGSI
QQCNVRCMNGGSCSDDSCICQKGYTGTHCGQPVCKNGCQNGGRCIGPSRCACVYGFTGPQ
CERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFI
PNIRSGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSENTQKCEDVDECSTIS
GVCDGGECSNTVGSYVCTCPRDFVTSLDGSRCIDQRSGTCFSSLLSGRCAGDLHGHYTKM
QCCCDSGRCWSAGHTPEMCPVRGSDEYRRLCIEGVPFGPGYPGIGFPGFSGGIGPNGLGP
GGVGPGGVSPGGVGPGGVGPGGLGPNGVGPSGIGPGGIGTGFSGLPGTGPGIGTATLNQT
IDVCKHFTNLCLNGRCIPTPSSYRCECNMGFKQDVRRECIDVDECSSSPCVNGDCINTPG
AYHCKCHDGFQSTATKQACIDIDECIQNGVLCRNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTPNGKN
CIDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKNGFVLAPNGRYCVDIDECQTPGICMNGRCI
NSEGSFRCECPPGLAIGVDGRVCVDTHMRSTCYGAIKKGTCTRPFSGAVTKSECCCASPD
HGFGEPCQPCPARTSAEFQALCSSGIGITADGRDINECALDPDICANGNCENLRGSYRCI
CNIGYESDVSGKNCVDIDECSVNMLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPTGYIFKPDTETCEDVN
ECESSPCVNGYCRNMAGSFICECSLGSKLDPTRTICIDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGA
TLKSECCATLGAAWGSPCEHCELDPTCPRGYARVKGVTCEDVNECDVFPGVCTNGRCVNT
QGSFKCDCPEGLTLDGTGRTCVDVRLEHCYLKWEEDECTQPMASRFRIDTCCCSIGRAWG
GDCEECPQPGTREYEAICPRGPGFANRGDVLTGRPFYKDINECKVFSSLCTYGTCRNTVG
SFKCRCESGFALNMEERNCTDINECRISPDLCGHGMCVNTPGSFECECFEGYESGFMMMK
NCMDIDECERDPLLCRGGTCVNTDGSYECICPPGHELTTEGDGCVDINECSLSDNLCKNG
RCVNMIGTYQCACDSGYQGTADRQGCVDIDECTIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSEGYAL
MPDKRTCADIDECEENPDICEGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASMDMRTCLDVNECDLNPN
ICLHGDCENTKGSFICHCQLGYFVKKGTTGCTDIDECEVGAHNCDMHASCVNVPGSFKCK
CRDGWIGDGLECIDLDECATEEHQCNPSANCLNTPGSYRCTCKDGFSGDGFSCSDVDECA
ENVNLCENGQCLNAPGGYRCECEMGFTPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFR
CVCDDGYELDRSGGNCTDINECADPVNCINGLCVNTPGSYLCNCPTDFELNPTGVGCVDT
RVGNCFLETLPRGDGGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCEFCPLVNSTEYKTLCP
GGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPAGYYLNEDTRICEDID
ECTTHIGICGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNFNDTCENELSF
NMTKKMCCCSYNVGKGWNKPCEPCPTPATSHYQLLCGNQAPGFIIDIHTGKPVDIDECRE
IPGICANGVCINQIGNFRCECPMGFSYNNVFLICEDIDECTNGDNLCQRNADCINIPGSY
RCECSPGFKLSLSGACVDRNECQEIPNVCSHGECIDTEGSYRCLCHNGFKATADQTMCMD
IDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFDLTHNNDCMDIDECSTQIGQVCRNGQCINSI
GSFQCLCQDGYELPPDGKNCVDINECISFPGTCAPGTCQNLDGSFRCICPPGYEVQNDHC
IDINECEEDPNICLFGFCTNTPGSFQCNCALGFVLSENGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCS
VPKAFNTTKARCCCSKMPGEGWGDPCELCPQEEEVAFQELCPYGHGAIPGIGDTREDVNE
CVENPGICVNGHCINTDGSFRCECPFGYSLDFTGVNCVDTDECTIGNPCGNGTCSNVIGG
FECACDDGFEPGPMMTCEDINECSLNPLLCAFRCINTYGSYACTCPGGYTLRADRKMCKD
LDECSEGFHDCESRGMICKNLIGTFMCICPPGMMRRPDGEGCMDENECRTKPGICQNGRC
INTVGSYRCDCNEGFLESPSSTECLDNRQGFCFIEVLQTMCQMSSTNRNLVTKSECCCNG
GRGWGNQCELCPLPGTARYKKMCPHGPGYTTDGRDIDECRVVPNLCKNGQCINTMGSFRC
FCNIGYTTDLTATSCVDLDECALSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLD
ECSTKQHNCQFLCVNTIGSFACKCPPGFTQHHTSCIDNNECMGQPTICGSKGTCQNTPGS
FSCDCQKGFSLDGTGFNCEDIDECDGNHRCQHGCQNMLGGYRCSCPQGYMQHYQWNQCVD
ENECSNPTACGAASCYNTLGSYKCLCPSGFDFDQYSGGCQDVNECSVSGNPCTYGCSNTD
GGYLCGCPGGYFRVGQGHCISGMGFGNGQYLPLEEEEGDAENVLSPETCYECKINGYPKR
GRHRRSTNGTVSHEDLKISLASLDIDAPIPLNVNISDMGIHDHIMEFLPAIETLENHVRY
IISSGNEANFFRIHQKNGLSYLHLSRKKAMRGKYMLEISSMPLYRKKDLLKLEDENDVDY
LVGDLGEALHMKLQIHLL
NT seq
8697 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtatggtggatagccaagtttgtactgggatgcacggctctgatctcgccttcc
cttgaagatgcactgagccaacaagagaaccatttcggagcaccgcgcttcacgggagcc
ggggacagagatttgcaagcgcgggtcaggaggcgaggtcaagacaacttgagagggcca
aatgtttgtggatctcgatttcattcctactgttgtcctggatggaaaacattgcctggt
ggcaaccagtgtattgtgccaatttgtcggaacacgtgtggcgatggattctgctccaga
ccaaacatgtgcacctgtgccaatgggcaactctccccaggttgtggatctggttcaatc
cagcagtgtaatgtcagatgtatgaatggtggctcttgctcagatgacagctgtatttgc
cagaaaggatacactgggacgcactgtgggcaacctgtgtgtaagaatggctgccagaat
ggagggcgatgcattggaccgagtcgctgtgcgtgtgtgtacgggttcactgggccacag
tgtgaacgagattaccggactggaccgtgcttcactcaagtcaataatcaaatgtgccaa
ggacaactgagtggcattgtctgtaccaaaactctctgctgtgccaccattggtcgggca
tggggtcatccatgtgagatgtgtccggctcagcctcatccctgtcgccgtggtttcatc
cccaacattcgcagtggtgcatgtcaagatgtggatgagtgccaggcaatcccaggcctc
tgtcagggaggaaactgcatcaacaccgtgggatcctacgaatgcaaatgtccagctgga
cacaagcagagtgagaacacacagaagtgtgaagatgttgatgaatgcagcaccatttct
ggagtctgtgatgggggtgaatgctcaaacacggttggtagctacgtctgcacctgtccc
cgtgactttgtcacaagcctggatggctctcggtgtattgaccagcgatctgggacctgt
ttctccagtctgctgagtggtcgatgtgctggagacctacatggacattacactaagatg
cagtgctgctgtgattctgggcgttgttggtcagcaggacacactccagagatgtgtcct
gtcagagggtctgatgaatatcgcagactgtgcatcgaaggtgttccttttggaccgggt
taccctggcataggatttccaggattttctggtggaattgggccgaatggccttggccct
ggtggagttgggcccggtggagttagccctggtggagtcggacctggtggagtcggacct
ggtggacttggacctaatggggttgggcctagtgggattggaccaggtggaattggaaca
ggtttctcagggctacctgggactgggcctggcattggtacagccaccctgaatcagaca
attgatgtctgcaagcatttcaccaacctgtgtctgaacggacgttgtattcccacccca
tccagttaccgctgtgaatgtaacatgggtttcaaacaggatgtgcgtagagagtgtatt
gatgttgatgaatgttccagcagtccttgtgtgaacggggactgcattaacacccctggt
gcctatcattgcaagtgtcatgatggtttccagagtactgccaccaagcaagcctgtatt
gatatcgatgagtgtatccagaacggtgtcttatgcaggaacggccgatgcgttaacact
gatggaagcttccagtgtatctgcaatgctggcttcgagctcacccccaatggaaagaac
tgcattgatcatgatgaatgtgctactaccaacatgtgcctgaatggaatgtgcatcaac
gaggatggcagcttcaagtgtatttgcaagaatggctttgtcctagctcctaatggccgt
tactgtgtggatattgacgaatgtcagacacctggtatctgcatgaatggccgctgcatt
aactcagaaggttccttcaggtgtgagtgccctccaggtctggctattggagtggatgga
cgtgtctgtgttgatacccatatgcggagcacttgctacggagccatcaaaaagggcacc
tgtacccgacctttctctggagccgtgaccaaatcagagtgttgttgtgccagtccagac
catggctttggagagccctgccagccctgcccagccaggacttcagctgagttccaggct
ttgtgcagcagtggcatcgggatcacagctgatggacgagatatcaatgagtgtgctctt
gatcccgatatctgtgccaatgggaattgtgagaacctgcgcggcagttaccgctgtatc
tgtaatattggctatgagtctgacgtcagtggcaagaattgtgtcgatattgacgagtgc
tcagtcaacatgcttctgtgtgataatggactgtgtcgtaacactcctggcagctacaca
tgcacttgccccacaggttacatcttcaaacctgataccgagacctgtgaagatgtgaat
gagtgtgaatccagcccgtgtgtgaatggttactgcaggaacatggcaggctcgttcatc
tgtgaatgttcacttggcagcaaattggatccaaccagaaccatctgtatcgacagtatg
aaggggacgtgctggctgaatattcaggatgggcgttgcgaggtgaacatcaatggagca
acactgaagtcggagtgctgtgccaccttgggagcagcctggggcagtccctgtgaacac
tgcgagctggatcccacctgccccagaggctatgccagagtgaaaggagttacttgtgaa
gatgtgaatgagtgtgatgtattccctggtgtttgcacaaatggacggtgtgtgaataca
caaggctcatttaagtgtgactgccctgaaggactgactctggatgggactgggagaacc
tgtgtggatgttcgtctggaacactgctacctgaagtgggaggaggatgagtgcacacag
ccaatggcgagccggttccgtattgacacttgctgctgttcgattggccgtgcctggggt
ggagactgcgaggaatgcccacagcctggcacacgggaatatgaggctatttgtcccagg
ggaccaggatttgccaacaggggtgatgttctgacaggcagaccattctacaaggatatc
aacgaatgtaaggtattctccagtctgtgtacatatggaacatgccggaacacagttgga
agctttaaatgtcgctgcgagagtggatttgccctaaacatggaggaaaggaactgtaca
gatatcaatgaatgccgtatttcaccggacctctgcggccacggcatgtgtgtgaacaca
ccaggcagttttgaatgtgaatgctttgaaggatatgaaagtggttttatgatgatgaag
aactgcatggatattgatgagtgtgagagagaccccttgctgtgtcggggaggaacctgt
gtaaacactgatggcagctatgagtgtatttgcccaccaggtcatgagttgaccaccgag
ggagatggctgtgtggatatcaatgagtgctcgctgagtgacaacctgtgcaagaatggc
cgctgtgtgaatatgattgggacttaccagtgtgcctgtgactcaggatatcagggcaca
gcggacagacagggctgtgtggatattgatgaatgtacaattatgaacggtggatgtgat
acacactgcacaaactccgagggaagctatgagtgcagctgcagtgagggctatgcactg
atgcctgacaagaggacatgtgcagatattgatgaatgtgaggagaatcctgatatttgt
gagggtggacaatgtaccaacatccctggggaatatcgctgcctctgctttgatgggttt
atggcttcgatggacatgaggacctgtctggatgttaacgaatgtgacctgaaccctaac
atctgtctccacggcgactgtgagaacaccaaaggctcttttatctgtcattgccagctg
ggatactttgtaaagaaaggaacaacaggatgcacagatattgatgagtgtgaagttgga
gctcacaactgcgacatgcacgcctcttgtgtgaatgtgccaggcagcttcaagtgcaag
tgtcgtgatggatggattggagatggactggagtgcatcgatctggatgaatgtgccact
gaggaacaccagtgtaatcccagtgccaactgtctgaacacaccaggctcgtatcgctgc
acctgtaaggatggcttcagtggtgatggcttcagctgctcagatgttgatgaatgtgct
gaaaatgtgaacctgtgtgagaacgggcagtgtctgaatgctcctgggggttatcgttgt
gaatgcgaaatgggattcacaccgaccgaggatagcaaggcctgccaagatattgatgag
tgcaccttccagaatatttgtgtttttggaacttgccagaacctacccggaatgttccgc
tgtgtttgtgatgatggttacgaacttgacagaagtggaggcaattgcacagatatcaat
gaatgtgctgaccctgtaaactgcatcaatggcctctgtgtgaacacccctgggagctac
ctgtgtaactgcccgacagatttcgagctgaatcctacaggggttggttgtgtggatacc
cgcgtgggtaattgtttcctggaaaccttgccaaggggagatggcgggatttcatgcagt
gcagagatcggtgttggtgtcactcgagcctcatgctgttgctcactgggcagggcttgg
ggaaacccttgtgaattctgccctctggtcaactccactgaatacaagactctgtgtcca
ggaggggagggtttccgacccaatcctatcactgtcattctggaggatattgatgagtgt
caggagttaccaggcctatgtcagggtggaaactgtgtgaacacattcggcagcttccag
tgtgaatgtccagctggatattacctgaatgaggatactcgtatatgtgaagatatcgat
gaatgcaccactcacattggaatctgtggacctggaacatgctacaatactttgggcaac
tatacctgtgtctgccctccggagtacatgcaagtcaatggaggaaacaattgtatggat
atgaggaagagtgtctgttaccgcaacttcaacgatacatgtgagaatgaactctccttc
aacatgaccaagaagatgtgctgctgctcatacaacgtgggcaagggatggaataagcca
tgtgagccctgtcccacgccagctacatctcactatcaactcctgtgtgggaatcaggct
cctggcttcatcattgatatccatacgggcaaaccagttgatattgacgagtgtcgggaa
atcccaggcatttgtgcgaatggcgtctgtatcaaccaaatcggtaatttccgctgtgag
tgtccaatgggcttcagctacaacaatgtgttcctgatctgtgaagatattgatgagtgc
accaatggagataacctgtgtcagcggaatgccgactgtatcaacatcccaggcagttac
cgctgtgagtgctccccgggctttaaactgtcactgagtggagcctgtgtggatcgtaat
gaatgccaggagatccccaatgtgtgtagccacggagagtgcattgacacagaaggaagt
tatcggtgtctttgtcacaatgggttcaaagcaacagctgaccagacaatgtgcatggat
atcgatgagtgtgaccggcagccctgtgggaatggaacctgcaagaacaccgttggatct
tacaactgcctctgtttccctggatttgacctcacccacaacaacgattgcatggatatc
gatgagtgctcgactcagattggtcaggtctgtagaaatgggcagtgtataaacagtatc
ggctccttccagtgcctgtgtcaggatggctatgagctgccacccgatgggaagaattgt
gttgatatcaatgaatgcatcagcttccctggcacctgtgcccctgggacctgccagaat
ttagatggttctttccggtgtatttgtccccctggttacgaagtacagaacgaccactgc
atcgatattaatgagtgtgaggaggatcctaacatctgtctgtttggcttctgtactaat
acacctggaagtttccagtgtaactgtgccctaggatttgttctgtcggaaaatggaagg
agatgcttcgatacgaggcagagcttctgcttcaccaggtttgataacggcaagtgttcg
gtacccaaggccttcaatacaaccaaagcccgctgctgctgtagcaagatgccaggggag
ggctggggcgacccatgtgaactttgccctcaggaagaagaagttgctttccaggagctg
tgtccttacggtcacggtgcgatccctggcatcggtgatacccgcgaagatgtgaatgag
tgtgtcgagaaccctggaatctgcgttaacggacactgtataaatactgatggttctttc
cgatgtgaatgtccatttggatatagcctagattttactggagtcaactgtgttgatact
gatgaatgcaccattggtaacccatgtggcaacggaacttgcagcaatgtcattggaggg
tttgagtgtgcgtgtgatgatggatttgaacctggtccaatgatgacttgtgaagatatt
aacgagtgttccctcaatcccctattgtgtgcatttcgctgcatcaacacctatggttca
tacgcgtgcacttgccctggaggttacactctgagagctgaccgcaaaatgtgcaaagat
ttggatgagtgttcagaaggatttcatgactgtgaatcccggggaatgatatgcaagaac
ttgatcggcactttcatgtgcatctgcccacctggaatgatgcgaagaccagatggagag
ggctgcatggatgaaaacgagtgtcgcactaaaccagggatatgtcagaatggccgatgt
atcaacacagtcggcagctaccgatgtgactgtaacgaaggattcttggaaagtccatca
tctacagaatgtctggataatcgtcagggattctgtttcattgaagttttgcaaaccatg
tgccaaatgtcatccaccaaccgcaacctggtcaccaagtcagagtgctgctgcaatgga
ggcagaggatggggtaaccagtgtgagctatgcccactgcctggcactgcccgttacaaa
aaaatgtgcccacatggacctggatataccacagatggtagagatatcgatgaatgtaga
gtagtaccgaatctgtgtaagaacggacagtgcatcaacaccatgggttccttccgctgt
ttctgtaatattggatacaccactgatctaacagcaacctcctgtgttgatcttgatgaa
tgtgcgctgtcacccaaaccatgcaacttcatctgcaagaacacagaaggtagctaccaa
tgctcatgtccgcgaggctacattctgcaggaagatggaaagacatgtaaagatcttgat
gaatgttcaacgaaacagcataactgtcagttcctgtgtgttaacacgattggatccttt
gcgtgcaaatgtccacctggtttcacacaacaccacacatcgtgcatcgacaataatgag
tgcatgggtcagcccacaatctgtggttcaaagggcacatgccaaaatacaccaggaagt
ttcagctgtgactgccagaagggattctcattggatggcaccggttttaactgtgaagat
attgatgagtgtgatgggaaccatcggtgtcagcatggctgccagaatatgttgggtgga
tacagatgcagctgccctcaaggctacatgcaacactaccagtggaaccagtgtgtcgat
gagaatgagtgcagcaatcccactgcctgtggagctgcctcctgttataacactctaggc
agctacaaatgcctctgtccgtctgggtttgattttgaccagtattctgggggatgtcag
gatgtgaacgaatgctcagtctctggaaacccctgcacatatggctgctccaacacagat
ggtggttacctctgcggctgccctgggggctacttcagggtgggtcaaggacactgtata
tcaggaatggggttcgggaatggtcaatatctacctttggaggaggaagagggtgatgca
gagaatgtgctgtctcctgagacatgctatgaatgcaagatcaatggctaccccaagaga
ggcaggcatcggagaagcacaaatggcactgtgtcacatgaggatctcaagattagtctg
gctagtttggacattgatgcaccaatcccattgaatgtgaatatctccgacatgggaatc
catgatcacatcatggaattccttccggccattgagactctggaaaaccacgtgcgttac
atcatctccagtgggaatgaagccaacttcttccgaattcatcagaaaaacggactcagt
tacctccatctaagccgtaaaaaggccatgcgagggaagtacatgctcgagatttccagt
atgcctctgtacaggaagaaggatctcctgaaactggaagatgagaatgacgttgactac
ctcgtgggtgatctcggcgaggccctccacatgaaacttcagattcatcttctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
