Cryptosporidium parvum: cgd3_2360
Help
Entry
cgd3_2360 CDS
T00168
Name
(RefSeq) nucleoporin, FG-rich motifs within N-terminal region
KO
K14297
nuclear pore complex protein Nup98-Nup96
Organism
cpv
Cryptosporidium parvum
Pathway
cpv03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpv00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
cgd3_2360
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cpv03019
]
cgd3_2360
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
cpv03036
]
cgd3_2360
Messenger RNA biogenesis [BR:
cpv03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
cgd3_2360
Chromosome and associated proteins [BR:
cpv03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Spindle formation proteins
cgd3_2360
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin2
Nup96
Nup98_GLEBS
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3373919
NCBI-ProteinID:
XP_626800
ApiDB_CryptoDB:
cgd3_2360
UniProt:
Q5CUL4
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(619937..625354)
Genome browser
AA seq
1805 aa
AA seq
DB search
MLGGGGFGSNQNQQSSGGLFGTSNSFGVGIGQQGVSQNINTVQPASTGLFNSSTSLFGGN
ASPGLFGSTGSSNSGFGNTGQSSVFGQSSNGLFGQSMSTFGGNQQISSTQPTMFGSSSSS
TIGSSSGFFNSSSANNSGGFGSFQNSFGTSGGFGSQSSQSNPSSFFGQQNNSGLFGSMPI
QTFGNTSASPFGGTMGTNSNIFGAKKGTNGITFQPVVDRDSDARIMSIVYQKDIDQKKSV
EELRWEDYQEKRGPANSLSSINTNFTTSTNSFGNSSFSNAGGFASNSQGPSISNSIFGQP
QSSFISSTTPQNSLFGSSGSSSGLGQTSILGQGLQNSQSNIGNTQFVSNNGLFGASNNTN
SFPLQSSTSGSNSGLFSTPSLFSSNSNNGIINNSNNSNNLGTSISSLNGGNLFGQPSNLG
SLDSSLKTSGSLFGGSSTTSNSASLTLFNSNSNTQPQISLSNSSLSMKPLFGSNQTLSGS
NLGAGSGSTSGANLSTSLFGSTLPSSSGLFSNSPNSLFSSTQPQNTLNNNNANASSSSLF
GQSTSLSQSFGFSSVNPPNQSWSSLTSGVSNSAIGQTNLPGNSQLNNSSIQLQNILGGGQ
SGKPSNQNSSIVLGNGLSSNKLINSVLPKPIVQNSKYSDSNERGKSLWLWKPLPQFISRS
NRYQLDNLSHVSHERITNSSELALPAVATESARHNTALLTSVRRIEKTMDPQTPAAFLNL
LERQQQFFDAVQSPEQNGNSPTNSKTRSLVFTTSHTTKFVPLDETFEDAIDDSSSATFSP
RASKIENKSSSDSSKPLINLDSISRISQDVQISKSDDCRTSIGRVVNESNNAARTPYLNQ
HRNSVNSISAVSNERQARSSIGLTTPRPITRRPDQLIDSIPSDLVKSYIRKQKEFVIESL
TPILTKHDYFCIPSIELLKTFSEERLAVVEDFKIVREGVGEIVWPGVTDLRGINLDSVVS
IEPLCVSVYGDGDSSIPIGEGLNKKAIITLKNCKPKRAIPSKDPQEIDEFNSNRVKQIKS
YTEQMGARFISLDTITWEWKFEVTHFSKYGFLSEDNSLSHFKEPCSALATKETNFNVSDQ
ENHFLRSSKQEQYKGHFFVMKSQYNFSLYSEIKSIVEKDNSLKKSAYNGICFRSGMYIGS
NSFVVVPHRSFRKDIQGVSDYNTSITLLRINNLTGSVTKDSINNLGYSRRLISAWFRLYF
EIIGNKTSNNCSGVSIESIIKLIFLLWSITKNEVEIYSHLSGFKFNSLNFERLKYFEQTF
GLVGGIMELIIKNLNNPSEKRFESNLRELISWWMKIVINDIPVIRFGDDKQNSQCLHEER
ISLLLNNIVNGNLLDLVRNGPSLSYLTIPRTASLFLSIGNNKTSILQMMENMQWWSKIGL
VSDLTSYSNRIYKTISNIDASADGFLYEWQNNVFLSANYSTNSKLGERLLKMKNASLIDN
TQKLGKLIDSDDPINISPSEVGKKQVFEQIQFQIIKFFFGDENSRQVELFRLNNFGSIKF
SSFNWLIARALTFYHNSICNSNEITPTNKLNLILIEELEILGLWEWAVFIIMHTNMNSDF
YYLLNCVIMRNIQENPDYSNPEDYLNDEKWKFLVDKLGIPLNWLLEAIIYKLESSGNILQ
SLKCTMYLINRLQENKYKAGDLLFHRSDHVSAINSLAISAAKKLFYAPLLPNTLIEISAL
TKCVIIGKKPLYKIRNYFDAYLLNTNENLQLIFSAYEEQIVTDIWHALKSIITISSQYMK
FATRLIESETYYIDQDELKIIFTNLEKFTALREDTVRYSFEQCINNIIDNYCWDIVLDAI
GIAKH
NT seq
5418 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttggtggaggagggtttggttcaaaccaaaaccaacagtcttctggaggattattt
ggaacatccaactcttttggagttgggatcggccagcaaggggtatcacaaaatattaat
acggtacaaccggcttcaacgggattgtttaattcatcaacttccctatttggaggaaat
gcgagccctgggctatttggaagtactggctcttctaattccgggtttggaaatactggg
caatcttcagtttttggtcaatcttccaatggcttatttggccaatcaatgagtacgttt
ggaggtaatcagcaaataagttctacacaaccaactatgtttggctcaagttcctcttct
acgataggttctagctctgggttttttaattctagctcggcaaataactctggaggcttt
ggctcttttcaaaactcatttggaacttctggaggctttggaagccagtcatctcaaagc
aacccatcaagcttttttgggcaacaaaacaatagtggtctttttgggtcaatgcccatt
cagacttttggtaacacctcagcttcgcccttcggaggcactatgggaacaaattcgaat
atttttggggcaaagaaaggcacaaatgggattacatttcaacccgtagtcgatagagat
agcgatgccagaatcatgtctattgtatatcagaaggacattgatcagaaaaagtcagtt
gaagagcttagatgggaagattatcaagaaaaaagagggcctgcaaatagtttatcatcc
atcaatacgaattttaccacaagcaccaatagttttgggaatagctcattttctaacgct
ggcgggtttgcttctaactcccaaggaccttctatctcaaactcaatttttggacaacct
cagtcatcttttatatcatcaacgacaccacaaaactctcttttcggttctagtggctcg
tcctcaggtttgggccaaacttcaattctaggtcaggggcttcaaaactctcaatcaaac
ataggtaatactcagtttgtatcaaataatggattatttggtgcttcgaacaatacaaat
tcatttccacttcaatcttcaacgagtggttcaaactcaggattattctccactcccagt
ttattctctagcaatagcaataatggtattattaataatagtaataacagcaacaactta
ggtacaagtattagcagtttaaacggtggtaatttgtttgggcagccatccaatttagga
tcactagatagctctctaaagacttctggttccttgtttggggggagttcgacaacttca
aatagtgccagcttgactctttttaattcaaattcaaatactcaacctcaaatttctttg
tcaaattcttcgctttcaatgaagccattatttggtagtaatcaaacattaagtggctct
aatttgggtgcaggttctggtagtacaagtggagctaatttatctacaagcttatttggt
tcaacgctgcctagctcgtcaggcttgtttagtaactctccaaatagtctatttagttcc
actcaacctcagaatacgctgaataacaataatgcaaacgcatccagttcaagcttattt
ggccaatcaacttctttatctcagtcatttggattctcaagcgttaatcctcctaatcaa
tcatggtcatctttgacttctggggtttcgaattctgcaattggtcaaacaaatttacca
ggaaattctcaactgaataatagctcaattcagctacagaatatacttggtggtgggcaa
tctggaaagccttcaaatcaaaactcgtcaattgttttaggcaatgggctttcttcaaac
aaattaatcaatagtgtgcttcctaagccaattgttcagaattcaaagtattctgattcg
aatgaaagaggaaagtcactatggctctggaaacctctaccacaatttatttctcgttct
aatagataccaactcgataacttaagtcacgtttctcacgaaagaattacaaattcatca
gaactggctcttcctgcggttgcaaccgagagtgcgagacataatactgctcttttaact
tccgttaggcgcattgagaaaactatggatcctcagactcctgcagcattcctaaacttg
cttgagcgtcaacaacagttctttgacgcggtacagtctccagaacaaaatggaaattca
cctacaaattccaaaactaggtccttggtatttactacatctcatactacaaagtttgtc
cctttagacgaaacatttgaagatgcaatagatgattctagttcagctactttctcccca
agagcctcaaaaattgagaataagtcaagttctgatagttcaaagccattgataaacctc
gattcaatttcacgtatttcgcaggatgtgcaaatttccaaaagtgatgattgcagaact
tcaattggtagggtagttaatgaaagtaataatgcagcaagaactccatatttaaaccaa
catagaaactcagtaaattctatttcggctgttagtaatgaacgtcaggcacgtagctcc
attggtcttacaacacctagacctattactagaaggccagatcagttgatagatagcatc
ccatctgatctagttaagtcctatataaggaagcaaaaagaatttgttattgaatccctg
accccaatactcaccaagcatgactacttttgtattccatcaatagaattattaaaaaca
ttttcagaagagagacttgccgtcgtggaagacttcaaaatagttagagaaggagttggg
gagatcgtttggcctggagttactgatttacgtgggattaatcttgattcagttgtttcc
attgaacctctatgtgtgtcggtatatggtgatggagactcctctattccaattggcgaa
ggattaaataaaaaagctattataacactcaagaattgcaaaccaaagagagctataccc
tctaaagatccacaagagatagacgaatttaacagtaatcgtgttaaacaaattaagtct
tacacagagcaaatgggtgcaagatttatttcgcttgatactattacctgggaatggaaa
tttgaggtcacacatttttctaaatatggttttttgagtgaagataattctttatctcac
tttaaagaaccttgtagtgctcttgcgacaaaagaaactaattttaatgtctccgaccag
gaaaatcattttcttcgaagttctaaacaagaacagtataaaggtcatttttttgtaatg
aagagccaatataattttagtttgtactcagaaattaaaagcattgtggaaaaagacaat
agcttaaagaaatctgcttataatggaatctgtttcagaagtggtatgtatattggctca
aatagttttgttgtagtaccacatagatcatttcgtaaagatattcaaggtgttagcgac
tataacacatcgattactctattaagaataaataacctgacaggatccgtaactaaagat
tcaataaacaatttgggttattcccgaaggttgatttctgcctggtttaggctatatttt
gagataataggaaataaaacaagtaataattgttctggagtttcaatcgaatcaataata
aaacttattttcctcctgtggagcataacaaaaaatgaagttgaaatttattcgcattta
tctggattcaagtttaattctttaaattttgagcgattaaaatattttgaacaaacattt
ggtttggttggtggaataatggaattaataattaaaaatttgaataatccatctgaaaag
cgtttcgagtctaatttaagagaactgatttcctggtggatgaagattgtgattaatgac
attccagtgattaggtttggtgatgacaaacaaaattctcaatgtttacatgaagaaaga
attagccttctcttgaataatattgtaaacggaaacttacttgatctagttagaaatggc
ccaagtttatcatatttgacgattccaaggactgcgtcgttgttcttgtccattggaaat
aataaaacgtctattttgcagatgatggaaaacatgcagtggtggtcaaaaatcggtctt
gtttcggatctaacttcttattcaaatagaatatacaaaacaatatctaatatagatgca
tctgcggatggttttttatacgaatggcaaaataacgtattcctatctgcaaattattca
acaaattcaaagcttggtgaaaggttactaaaaatgaaaaacgcctctttaattgataat
acacaaaaattgggaaaattaattgattcagatgatcctattaacataagtccatcagag
gtaggcaaaaaacaagtatttgagcagatacaatttcaaataattaaattcttctttggc
gatgaaaattctagacaggtagagctatttcgattgaacaacttcggctctatcaaattc
tcttcatttaattggctaattgcaagggccctcacgttctatcacaacagtatctgcaat
agtaatgagattacacctacaaataaattaaacttaatacttatagaggaactagaaatt
cttggtttgtgggaatgggcagtttttatcataatgcatactaatatgaactcagacttt
tattatcttcttaattgcgttattatgagaaatatacaagagaatcccgattattctaat
cccgaagattacttaaatgatgaaaagtggaagttcttagtcgataaattggggataccg
ctgaattggttgctcgaggcaataatttataaattagagtctagcggaaacatattgcaa
tcactaaaatgcacaatgtatctaataaatcgcttgcaagaaaataaatataaagctgga
gatttattatttcatcgttcagatcatgtatctgccattaatagtctggctatatctgct
gcaaagaagctattttatgctcctcttctaccaaatacactgattgaaatatcagctctt
acaaaatgtgtaataattggaaagaagccactctataagattagaaattattttgatgct
tacttgctcaataccaatgaaaatctacaattaatcttttcagcatatgaagaacagatt
gtgacagatatatggcatgcactcaagtctataataaccatttcaagtcaatacatgaag
tttgccacgagattaatagaaagtgagacttactatatagatcaggatgaattgaaaatt
attttcactaatctggaaaagtttactgctttgagggaagatactgttagatattcgttt
gaacaatgcattaacaatataatagataattactgttgggatatagttttagacgcaata
ggaattgctaaacattag
DBGET
integrated database retrieval system
