Cryptosporidium parvum: cgd5_4480
Help
Entry
cgd5_4480 CDS
T00168
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19525
vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C
Organism
cpv
Cryptosporidium parvum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
cpv04131
]
cgd5_4480
Membrane trafficking [BR:
cpv04131
]
Endosome - Golgi transport
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
cgd5_4480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
3372552
NCBI-ProteinID:
XP_625609
ApiDB_CryptoDB:
cgd5_4480
UniProt:
Q5CQ17
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(1027762..1034523)
Genome browser
AA seq
2253 aa
AA seq
DB search
MLAPCNQWSKIELNSDKNMDLTFSQSNEKPISELGFKSKSKLSSISLKYVNNCNSQIPLL
RVSLPNKLFCIFSAPMDMDVLRLKREFKNLDIEFIIRVLAVYKSYNLAQNVLKYYKDLEN
QDDLCNKVLGPLPNGLCFTHFQNNIVSSANIDTIIPFHNLYYLKSKISKNSETYNRLFSD
INFDSYILGREGEQEGAGEREDGGEGEGGEGEGGEGDEYEEREGEEKKEKVRNMENTKLR
KSTVGKESTGGQTISTTVTFPSNTIPPNSNPTPLNKSIAKSISKSFSKSSMKSFQNGIKR
NLEKKLLKKTGITTNGKSSSKKILTKENINNSNYVYKNVIGQIIPINSQEKLFCLISNNR
IVNKTGIPLEICFINENNIPIQLFDISNISIEKELTNLILNQEVPNHHSKYKNIYDQKHF
KESKKLKFNSEYITDNQLNYNETNSIPLWLNNTDIINTILNSMSQIYNGENDIQDILFES
SHIITNNNNNNNNNNNNNNNTIQRIKQKRFYYSYFLPNNHMMSVPQIALLNDHCKVIFRP
CIIGLLEIYNIHCQYNNDNDIDQMLFDQEIFLKYSKLMNNYYDEDILNEEFHQITYELLK
IFKTSNGEFIMDLYYSFWNHLISRFTNTNNQIMDLSYLQSRGWTHSPIITNKNLNTSQTH
FCNLYPDFKNYKKSESHYKENAIYFQSYIQTYQSLFPGNTCIKNILLYPSFSLLNLSPAI
MDIKFKSLNQNLLHKCSNVLFRFKPMHHYNIYQLSSEMKLQYKVRIMLETNSLSEFQFNS
ESRKTDQLLYTQWSSPMDLNLSDTETPFTLYCNNNSIIDLKCTIIDKTNQNLPGKNKFGS
LFGKMQNNIIALSLSTWFINKTNHNVVPIFENSPFPYINTKSGAFFLNNSSFQDDGDYDG
RDRDHDRDRDRDHDHDHDRNHDHCHNQGNNKKGEDSEKRILSKRKNKLGDEEKIFLLNNR
HNYLKIYFNSYENLKEKYGNIGQRINDEIYLKEEKEILEVINSSEASIYSSGGGNYDNNN
NNSNNSNIGLLEIPPLNGTYSFPIVNEGKVYFFTVKSSPLFYYNDFSCSSKVITISPHII
IQNTTDDQFIWSSFMFPSGNDDLDKINAISRIDPNNLLLPNSDNTETRRYLGPIEKDFIT
SIKIDNPINSILSNNNNNNIHNNHHLQNLRSKTGSNMITVPSSSSSSISGSGIESNNSNN
SENNKSMIKDQSILLYLSRYVEYKTNNNPKWSQPILISSESNGIFYMHIPKMYENQIQDG
IIVNPKTYCIEMIASNGLFILKIIKDFSIGNKWDGVIFTNYCDYLSKIYIETYHFEHNFE
EIKKKRKLSLLSSGLLSIGNNKVTNNNDNNNNFLSEMNDDITIRYIISSGQKKPIKISWS
SPFVYNSRNCRLYIIPNQETSEFIDQNGIHNNNCYNNTSGILAFDMNFRYNQNNPYQSKR
YILSLPESDIIKLCTMYPYLNPRYFLNKNAKKGNGMNNYPIATISITARNNGLYIDILPP
RNHSSLLLNLLGNNINDNNSNNNKIINNDDETTKDSFQKEKVYIEDLYQKRIHEINKLVN
NDVWSLIYTYYRKITLDISQIGISIISENRQAEIVYVELSTIQFKKQEKNRNGIIESYKF
VIGNLQIDNQYISSNSKFYINNSSKFYGSPELDNTDLEDSNNSELDNSIIIGSNGVAPYV
LLANRSNNEKSIDNMNPFITLKWSCSNAKSQWETIIYNFDCELSDLELNFDFNVYRILNE
FMEECRKNSNKQYILDIKSILSKDQILEGVEPNMTFSIEKIKIGALNLYVWCSIPLSELN
YIPEWFRIGLRILTVSNALELRGAPIKLESHNLENSIGTIQNIVNAFYEYYMAELLWRIG
TVLGHSSFVNIPLVPLQVGKNTLNMAFSTISMVNSNITSLLSNLTLDTEYINSRQRELLY
NNSTISCPNSFGNAPKLLHGTNSQQASSLRQGFVQAGHNLTQGILSLGNVITKPIEGAQK
SGFTGFCTGLIKGVTSSVVRPIDHIGQALNNVIDGIQAEVNKPLGGYKERIYRRRIPRML
YSQYSKISDYEIQDALLRDIIGPKFARHLNQYFIIPTDHYSMPLILLLFPKNIVLIKLMS
SFSISDLNNNCQTSLRNNIIRGNSVVGVNGGSNGSSIGGNNGMNSNFGISSSNSIGVNGK
VSTGGGFSSGFTSTSSFSSSGRNNFYKSQIIWLVNINNIREVKASSHGILIELSNEKRDT
LQIPICKFSLIKKIIVALDNSQNNASPHLIFKK
NT seq
6762 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttggctccttgtaatcaatggagtaaaattgaattaaattctgataaaaatatggat
ctgactttctctcaatcaaatgaaaaaccaatttcagaactaggattcaaatccaaatcc
aaattatcttctatatcactcaaatatgtcaataattgtaattcacagattccacttctc
agagtttctcttcctaataaattattttgtatcttctcagctccaatggatatggatgtt
ttgagacttaaaagagaatttaaaaatctagatattgagtttattatacgagtactggca
gtatataagtcttataatctcgctcaaaatgtacttaaatactataaagatttggagaat
caagatgatttatgtaataaagtacttggacctcttcctaatggtctgtgttttactcat
tttcaaaataatattgtctcaagtgcaaatatagacacaattattccattccataattta
tattaccttaaaagcaaaatatctaaaaatagtgaaacttataaccgattattctcagat
attaattttgactcttatatactgggaagagagggagagcaagaaggtgcaggagaacga
gaagatggaggagaaggtgagggaggagaaggtgagggaggagaaggagacgagtatgaa
gagcgagaaggtgaagaaaaaaaagaaaaagtgagaaatatggaaaatacaaagcttaga
aaaagtaccgtaggaaaggagtctactggaggacaaactatctctactactgttaccttt
ccttcaaatacaattcctcccaattctaaccccacccccctaaacaaatcaattgccaag
tctatttcaaaatcattctctaaatcttcaatgaagtctttccaaaatggaattaaaaga
aatcttgagaaaaaattattaaagaaaactggaattactacaaatggaaaatcatcatcg
aaaaaaatacttacaaaagaaaatattaataattctaattacgtgtataaaaatgttatt
ggacaaataataccaatcaattcacaagaaaaattgttttgtcttatatcaaataataga
attgttaataaaactggtattcctttagagatttgttttattaatgaaaataatataccc
atacaattatttgatatttctaatatatccatagaaaaagagttaactaatttaatatta
aaccaagaagtaccaaatcatcattccaaatataaaaatatctatgatcaaaaacatttt
aaagaatctaaaaagttaaaattcaactcagaatatattactgataatcaattaaattat
aatgaaactaattcaataccattatggttgaataatactgatattattaatacaatactc
aattctatgtctcaaatttataatggagaaaatgatattcaagatatattatttgaatcc
tcccatattattacaaataataataataataataataataataataataataataataat
acaatacaaagaattaaacaaaaaagattctactattcttattttctacctaataatcat
atgatgtcagttcctcaaattgccctattaaatgatcattgtaaagtaatatttagacca
tgtattattggacttttggaaatatataatatacattgtcaatataataatgataatgat
attgatcaaatgttgtttgatcaagaaatcttccttaaatattcaaaattaatgaataat
tattatgatgaagatatacttaatgaagaatttcatcaaattacttatgaacttttaaaa
atatttaaaacttcaaatggtgaatttattatggatttatattattctttctggaatcat
ttaattagtagatttactaatacaaataatcaaataatggatctttcatatcttcaatct
agaggatggacacattcacctattattactaataaaaatcttaatacttctcaaacacat
ttttgtaatttatatccagatttcaagaattataaaaaatctgaaagtcattataaagaa
aatgctatttattttcaatcttatatacaaacttatcaatctttatttccaggaaataca
tgtattaaaaatattctattatatccaagcttttctttattaaatttatcaccagctatt
atggatattaaatttaaatcattaaatcaaaatcttctacataaatgttcaaatgtatta
ttcagatttaaaccaatgcatcattataatatatatcaactttctagtgaaatgaaatta
cagtataaagtcagaataatgttagaaactaactctttaagtgaatttcaattcaattca
gaatcaagaaaaactgatcaattattatatacacaatggtcttctccaatggatttaaat
ttatcagatacagaaactccatttacattatactgtaataataactcaataattgactta
aaatgtacaataattgataaaacaaatcaaaatttaccgggtaagaataaatttggttct
ctttttggtaagatgcagaataacattattgctttaagcttaagtacttggtttattaac
aaaacaaatcataacgtagtacccatttttgagaattcaccttttccttatattaacaca
aaatcaggggcattctttttaaataattcaagttttcaagatgatggcgattatgatggc
cgtgatcgtgatcatgatcgtgatcgtgatcgtgatcatgatcatgatcatgaccgtaat
catgatcattgtcataatcaaggaaacaataaaaaaggtgaagattctgagaaaagaata
ctaagcaagagaaaaaataagcttggagatgaagaaaaaatctttctccttaataataga
cataattatttaaaaatatactttaactcttatgaaaatttaaaagaaaaatatggaaat
attggtcaaagaattaatgatgaaatatatctcaaagaagaaaaagagattcttgaagtt
attaatagcagtgaagcaagtatttatagcagtggaggtggaaactatgataataataat
aataatagtaataattcaaatattggattattagaaatacctccattaaatggaacctac
tcatttcccattgtaaatgaaggaaaagtctactttttcacagttaaaagtagtccttta
ttttactataatgatttctcttgttcaagtaaagttatcaccatttcacctcatattatt
atacaaaataccacagatgatcaatttatttggagttcatttatgtttccttcaggaaat
gatgatcttgataaaattaatgcaatttcaagaattgatccaaataatcttcttttacca
aattctgataatacagaaacaagaagatatttaggtccaattgaaaaagattttattact
tcaataaaaattgataatccaataaattctattttatctaataataacaataacaatatt
cataataatcatcatttacaaaatttaagatctaaaacaggatctaatatgattacggta
ccttcttcttcttcttcttcaatatcaggatctggtatagaatcaaataattcaaataat
tcagaaaataataaaagtatgattaaagatcaaagtattcttttatacctaagtagatat
gttgaatataaaacaaacaataatccaaaatggtcccaaccaatattaatttcatcagaa
agtaatggaatattttatatgcatatacctaaaatgtatgaaaaccaaattcaagatgga
ataattgttaatccaaaaacttattgtattgaaatgattgcatctaatggattatttatt
ctaaaaattattaaagatttttctattggtaataaatgggatggagtaatttttactaat
tattgtgattatttatccaaaatctatatagaaacttatcattttgaacataattttgaa
gaaataaaaaagaaaagaaaactttctcttttatcatcaggattattatcaattggaaat
aataaagtaacaaataataatgataataataataatttcttatcagaaatgaatgatgat
attactattagatatataattagcagtggacaaaaaaaaccaataaaaatttcttggtca
tctccttttgtatataactcaagaaactgtagattatatataattccaaatcaagaaact
tcagaattcattgatcaaaatggtattcataataataattgttataataatacttctggt
atattagcttttgatatgaattttagatataatcaaaataatccatatcaatcaaaaaga
tatattctatcattaccagaatctgatataattaaactttgtacaatgtatccatatttg
aatccaagatactttttaaataagaatgctaagaaaggaaatggtatgaataattatcca
attgcaacaatttctattacagctagaaataatggactttatattgatattcttccacca
agaaatcattcatctttattattaaatttacttggtaataatattaatgataataatagt
aataataataaaataataaataatgatgatgaaaccacaaaagattcttttcaaaaagaa
aaagtttatattgaagacttataccaaaaaagaatccatgaaattaacaaacttgttaat
aatgatgtttggtcactaatttatacatattatagaaaaattactttggatatttctcaa
attggaatttcaataatttcagaaaatagacaagctgaaattgtctacgtggaattaagt
acaatacaatttaaaaaacaagaaaagaatagaaatggaataatagaaagttataaattt
gtaataggtaatttacaaattgataatcaatatatttcatcaaattcaaaattttatata
aataattcaagtaaattctatggatcaccagaattagataatacagatttagaagatagt
aataattcagaattagacaattcaataattattggatcaaatggagtagcaccttatgta
cttttagcaaacagatcaaataatgaaaaatcaatagataatatgaatccatttattaca
ttaaaatggagttgttcaaatgcaaaatcacaatgggaaacaataatttacaactttgat
tgtgaattaagtgatttggaattaaattttgattttaatgtatatagaattttgaatgaa
tttatggaagaatgcagaaaaaattcaaataaacaatatatattagatattaaaagtatt
ttatcaaaagatcaaatattagaaggtgttgaaccaaatatgacattttcaatagaaaag
ataaagattggagctttaaatttatatgtttggtgttcaattccattatcagaattgaat
tatattccagaatggttcagaattggacttagaattttaacagtatcaaatgctttagaa
ttaagaggtgctccaataaaattagaatcacataatttggagaattcgattggtacaatt
caaaatatagtaaatgctttttatgaatattatatggcagaactactttggagaattggt
acagtattaggacatagttcttttgtaaatattccattagtaccattacaagttggtaag
aatacattaaatatggcattttcaacaatatcaatggtaaattcaaatataacaagttta
ctttcaaatttaacattagatacagaatatataaattcaagacagagagaattactttat
aataattcaacaatatcttgtccaaattcttttggaaatgctccaaaattattacatgga
acaaattctcaacaagcttcaagccttcgtcaaggttttgtacaagcaggtcataacctt
actcaaggtatacttagtttaggtaatgtaataacaaaaccaatagaaggagctcaaaag
agtggatttacaggattttgtacaggattaataaaaggagtaacatcttcagttgtaaga
ccaatcgatcatataggacaagctttaaataacgtaatagatggaatacaagcagaagta
aataaaccacttggtggatataaagaaagaatttatagaagaagaattcctagaatgctt
tactctcaatatagtaagataagtgattatgagattcaagatgcgttacttcgagatatt
attggaccaaaatttgcaagacatcttaatcaatactttattattccaacagatcattat
tctatgccactaatattgttattatttccaaagaatatagttttaattaaattaatgtca
agtttttcaataagcgatttaaataataattgtcaaacaagtttgagaaataatattatt
agaggaaatagtgttgttggtgttaatgggggtagcaatggtagtagtattggtggcaat
aatgggatgaattctaattttggtatcagttcttcaaatagtataggagttaatggtaaa
gtatctacaggtggtggtttttcgtcaggtttcacttccacttcaagtttctcatcttct
ggaagaaataatttttacaaatcccaaataatttggttagttaatataaacaatattaga
gaagtcaaagcaagttctcatgggattcttattgagctttccaatgaaaaaagagataca
ttacagattccaatatgtaaattttccctaattaagaagattatcgttgctttggataat
tctcaaaataatgcgtctcctcatttaatttttaagaaatga
DBGET
integrated database retrieval system