Cryptosporidium parvum: cgd6_500
Help
Entry
cgd6_500 CDS
T00168
Name
(RefSeq) membrane associated HD superfamily cyclic nucleotide phosphodiesterase domain containing protein
Organism
cpv
Cryptosporidium parvum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDEase_I
HD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3376045
NCBI-ProteinID:
XP_627432
ApiDB_CryptoDB:
cgd6_500
UniProt:
Q5CXM2
LinkDB
All DBs
Position
6:111056..116959
Genome browser
AA seq
1967 aa
AA seq
DB search
MEHKCNSMNIHSSQDSIKLSTGGSKEKLADSITGLQNNSSSSSSTNSSFDFLRSKSNSII
LSESQSLSSSIIPILKKSDFCDFKKVSLLPLLFGETTCNQQLTNHNLHDLFDELKQIERY
GSNLSYLSNNYNNSVCYRGSSSFGCVQNHSLSNIAEGSSIYCSPEPNNYYNNDVNTLLST
TRRRLTPTSINSSLSSNNIIDDNNDEFLCEKKCNAVRRHFEKCLTSKMNGYELCKLLSIY
SSVLFQTPLSIVLFYDEETEELIGSFPSKGTWNSYIPRSLTHKWVDYKTTCMHNEHKCPH
FKYKTIGEYGQSSKNFINNNGHNHLYSSLTSNSSIQSFQSKAKDFKEARKSETGSSLIRN
NSIFQSSNKKYQRLSFIGGYKDKIVNRRATFPPLSIANRENEPNTYKNIFDMKSMFNNEM
DEIDQRNSVMEYDLLRFSIRNEKILENEKFVKNSDSIDNNNNNFNISINGNNIKSSQDNQ
NQKKSFLNEILTQSQKQNFFYFNYSSNICDYIIKSSFIKEDDENKNNVYKEKRSEIFLSN
NNQNNDVLFGSYFYNKLKDAEQLPCDIATATQCSICLENMKLTSLSSSSSSSSSSSSSSS
SFSSTSSSSSSFNDSSNGFGRVNNKNNNNNNGNGDGHVYYGNKTNELSMCRNGSEVAYKE
EFSSKNDNIDIGCINFNNNNTNQQISRKNSGIELIQNKGKKSSEEISDKMSDFPVILVSP
PSINDGIINRCCICDKNKNNSNIGNGNNNEKNNEVVLNSVFSDTEIGITNFYQRYSNFKI
PVIACPIIDTRIQKDYNNNTNSKVIGIVICLQPQNPNILLLKSLITEIQAIVCLFLDYKR
LLFNTLQLNMNLELYRWVFKPLLSNRRIRHEDNFDYTISIEVISRLCLLINKITPAQYTL
VYVMESCNEFVCIYGPGQFIGLRLCSKNYLISNILKNKCVNIWNEFKDFSNIFINYSDNN
NNNNNNKFTNSQINFKNTAFIPIFNKNDNINILIQLINRTRDGYCLSNNFDKKKLNHGLS
EKKFNNHTMEKNNLFDDKSIGINNNSNILSEIEFGKHRLSTGNSNSNGIGTGNGNGIGHN
HLSIRRVNTISSDDYINSLNNSSIDLTKSSNSSFNSVNNGHTKDEERLLIMNNNLLPNLR
QRVLASTKAFSFSSSSSSISSSLLVNRVNTIEYLSPNNDNNVEVKEKESYETESLVNSNI
NNNNNNIIDFSQKDMYIYLILINQIMQEFHQQLLTLNIHLFYKSLRNPNFNHLYKSNQIM
LNSLNNFFGIKFEQRYNNNNNNNNNNNSNNNNNINSIESTFSSSSSSSSSSSPMDNSNMN
NHHHEGNKIILDNLLHENNNYSTNLDQFDKNIKDEYNNYKNINKNRYRNLIYKKKSIEKE
RCYQSENEYLKQNNQKCEEYFNLNNNYYKEEEEEEEEIQEEPKQEEELELELEELEHEEK
QQKEEEEEEEEQQQQQQQNYERLFCRMSSVDEFKKEIKLYNTKEKLIIDSSLSLYREWGF
PIWAHGWSVHREFLLNLFKYYGFDSKWNWSNKQLLTLFDLIHDSYNSDIPYHNIFHALQV
VQVCYIILRNFGIMLVLNDLNKFILLFAALCHDIDHPGVNNCFLTISNSKLALKYNDNSI
LENHHCNYIFSLLDKCQDLDIRKNFNDFEKKNFRRIFIRSVLSTDMSYHNTLLSNLEEFI
STNNNNNNNINNNNYYYCHNQNLIFDEEELNNNNINIKMLGEIDENSLLIKMDKEFLIET
LLHAADISNPITPFPICAKWSSLIVEEFNYQSKLESQFGLPITPFMDLKDDITKIEAQIG
FLEFIIIPQWKLLSRIIPKSIILLKQAEKNRELWLNQNNIIINNNNNNNNNNDNNSCELF
KFTLDYLKNNTIGGKDVLEKTSKNKRRITINNKYNKIINQIKCDKFLLLKQEKDCNNNSN
SNIGNDIDKKDYSKYYIEVEDSVKIEYLKNYGLMKMFTLTLNDMIFD
NT seq
5904 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcataaatgtaattctatgaatatacatagttctcaagattcaataaaattatca
acaggtgggagtaaagagaaattggcagattcaataacaggattacaaaataattcatct
tcatcttcatcaacaaactcatcatttgattttttaagaagtaaatcaaattctattatt
ttatcagaatctcaatcattatcttcaagtataatacctattttaaaaaaatcagatttc
tgtgatttcaaaaaggtatcactattaccgttattatttggtgaaacaacttgcaatcaa
cagttaacaaatcataatttacatgatttatttgatgaattaaaacaaatagaaagatat
ggaagtaatttatcatatttaagtaataattacaataacagtgtatgttacaggggaagt
agtagttttggatgcgtacaaaatcattctctttcaaatattgcagaaggttcaagtata
tattgtagtccagaacctaataattattataataatgatgtaaatacgttattaagtacg
acaagaagaagattaactccgacatcaataaattcttcattatcttcaaataatattata
gatgataataatgatgaatttttatgtgaaaagaaatgtaatgcagtaagaagacatttt
gaaaaatgtttaacgtcaaaaatgaatggttatgaattatgtaaattattaagtatttat
tcttcagtattatttcaaacacctttatcaatagtattattttacgatgaagagactgaa
gaattaattggttcatttccatcaaaaggaacatggaactcatatataccaagaagttta
acacataaatgggttgattataaaactacatgtatgcataatgagcataaatgccctcat
tttaaatataaaacaataggggaatatggacaatcatcaaagaattttattaacaataat
ggtcataatcatttatattcaagtttgacatcaaattcttcaatacaaagttttcaatct
aaggctaaagattttaaagaagcaagaaaatctgagacaggatcatctttaattaggaat
aatagtatttttcaatcaagtaataaaaaatatcaaagactaagttttattggtggatat
aaagataaaatagttaatagaagagcaacatttcctccattatcaatagcaaatagagaa
aatgaaccaaatacttacaagaatatatttgatatgaaatcaatgtttaataatgagatg
gatgaaatagatcaaagaaatagtgtaatggaatatgatttattaagattttcgattaga
aatgaaaagattcttgaaaatgagaaattcgtaaagaatagtgacagtattgataataat
aataataactttaatattagcattaatggtaataatataaaatcttcgcaagataatcaa
aatcaaaagaaaagttttttaaatgaaatattgacacaaagtcaaaaacaaaatttcttt
tattttaattattcttcaaatatttgtgattatataataaaatcaagttttattaaagaa
gatgatgaaaataaaaataatgtttataaggaaaagaggtcggaaatttttttaagtaat
aataatcagaataatgatgtattatttggttcatatttttataataaattaaaagatgct
gaacaattaccatgtgatattgcaacagctactcaatgttcaatttgtcttgaaaatatg
aaattaacatcattatcttcgtcatcatcatcatcatcatcatcttcttcttcttcttct
tcattttcttcaacttcatcttcatcgtcatcatttaatgattcaagtaatggatttgga
agagttaataataaaaacaataataataataatggaaatggagatggacatgtttattat
ggtaataaaacaaatgaattatcaatgtgtagaaacggatcagaagtagcatataaagaa
gaattttcttcaaaaaatgataatattgatattggttgtattaattttaataacaataat
actaatcaacaaatttcaagaaagaattcaggaattgaattgatacaaaataaaggaaag
aaatctagtgaagagatttcagataaaatgagtgattttccagtgatcttagtttcacca
ccatctattaatgatggaataattaatagatgttgtatatgtgataagaataagaataat
agtaatattggcaatggtaataataatgaaaaaaataatgaagtggttttaaattctgta
ttttctgatactgaaataggaattacaaatttttatcagagatatagtaattttaagatt
ccagttattgcttgtcctattatagacacaagaattcaaaaagattataataataataca
aattcaaaagtgattggaatagtaatttgtttacaaccacaaaatccaaatatattatta
ttaaaaagtttaattacagaaattcaagcaatcgtttgtttatttttagattataagaga
ttattatttaatacattacaattaaatatgaatcttgaattatacagatgggtatttaaa
ccattattatcaaatagaagaataagacatgaagacaattttgattatacaatatcaatt
gaagttatttcaagattatgtttattaatcaataaaattactcctgcacaatatacatta
gtatatgtaatggaatcttgcaatgaatttgtttgcatttatggaccaggacaatttatt
ggattacgactttgttcaaaaaattatttaatttcaaatattcttaaaaataagtgtgtt
aatatatggaatgagtttaaggatttttcaaatattttcataaattattctgataataat
aataataataataataacaagtttacaaattctcaaataaattttaagaatactgcattt
atacccatttttaataagaatgataatattaatatattaatacaattaattaatagaaca
agagatggttattgtttgagtaataattttgataaaaagaaattaaatcatggattatca
gaaaagaaatttaataatcatacaatggaaaagaataatttatttgatgataaatcaatt
ggtattaataacaattcaaatatattatcagagattgaatttggtaaacacagattatct
actggtaatagtaatagtaatggcattggcactggtaatggtaatggtattggccataat
catttgtcaataagaagagtaaatacaatatcttctgatgattatattaattcattaaat
aattcaagtattgatttaacaaaatcttcaaattcttcatttaattctgtaaataatggt
catacaaaagatgaagaaagattattgattatgaataataatttattaccaaatttaaga
caaagagtattagcatcgacaaaagctttttctttttcatcatcatcatcatcaatatca
tcatctttattggttaatcgtgttaatacaattgaatatttatctccaaataatgataat
aatgttgaagttaaagaaaaagagtcatatgaaacagaatctttggttaattcaaatatt
aataataataataataatattatagatttttctcaaaaagatatgtatatttatttaata
ttaattaatcaaataatgcaagaatttcatcaacaattattaacattaaatattcattta
ttttataaatctttaagaaatccaaattttaatcatttatataaaagtaatcaaattatg
ttaaattcattaaataatttttttggaattaaatttgagcaaagatataacaataataat
aataataataataataataatagtaataacaataataatattaattcaatagaatccaca
ttttcatcatcatcatcatcatcttcttcttcttcaccaatggataattcaaatatgaat
aatcatcatcatgaaggaaataaaataatcttggataatttattacatgaaaacaataat
tattcaacaaatctcgatcaatttgataaaaatattaaagatgagtataataattataaa
aatataaataaaaatagatatcgaaatttaatatataaaaaaaaatcaattgaaaaagaa
agatgttatcaaagtgaaaatgagtatctaaaacaaaataatcaaaaatgtgaagaatat
ttcaatttaaataataattattataaagaagaagaagaagaagaagaagaaatacaagaa
gaaccaaaacaagaagaagaactagaattagaattagaagaactagagcatgaagaaaaa
caacaaaaagaagaagaagaagaagaagaagaacaacaacaacaacaacaacaaaattat
gagagattattctgtagaatgagttctgttgatgaatttaaaaaagaaataaaattatat
aatacaaaagaaaaattaataattgattcatcattaagtttatatagagaatggggattt
ccaatatgggctcatggatggtcagtacatagagaatttttattaaatttattcaaatat
tatggatttgatagtaaatggaattggagtaataaacaattattaacattatttgattta
atacatgattcttataattctgatataccatatcataatatatttcatgcattacaagtt
gtacaagtatgttatataatattaagaaattttggtataatgttggtattaaatgattta
aataaattcatattattatttgcagctttatgtcatgatattgatcatcctggtgtaaat
aattgttttttaacaatttctaattcaaaattagcattaaagtataatgataattcaatt
ttagaaaatcatcattgtaattatatattttcattattagataaatgtcaagatttggat
ataagaaagaattttaatgattttgaaaagaagaattttagaagaatatttattagatca
gttttatcaacagatatgagttatcataatactttattatctaatttagaagaatttatt
tcaactaataataataataataataacattaataataataattattattattgtcataat
caaaatttaatttttgatgaagaagaattaaataataataatattaatataaaaatgttg
ggagaaattgatgagaattctttattaataaaaatggataaagaatttttgatagaaaca
ttattacatgctgcagatatatctaatccaattacaccatttccaatatgtgctaaatgg
tcatcattaatagtagaagaatttaattatcaatcaaaattagaatcacaatttggttta
cctattacaccttttatggatttaaaagatgatataacaaaaatagaagcacaaataggt
tttttagaatttattataataccacaatggaaattattatcaagaattataccaaaaagt
attatattacttaaacaagctgaaaaaaatagagaattatggttaaatcagaataatatt
attattaataataataataataataataacaataatgataataattcttgtgaattattt
aaatttactctggattatttaaaaaataatacaattggtggaaaagatgtattagaaaaa
acaagcaaaaataagagaagaattacaattaacaataaatataataaaataattaatcaa
attaaatgtgataaatttttgttattaaaacaagagaaagattgtaataataatagtaat
agtaatattggaaatgatattgataaaaaagattacagcaaatattatatagaagttgaa
gattcagtaaaaatagagtatttgaagaattatggtttaatgaaaatgtttactttgact
ttaaatgatatgatatttgattag
DBGET
integrated database retrieval system
