Cryptosporidium parvum: cgd7_5090
Help
Entry
cgd7_5090 CDS
T00168
Name
(RefSeq) SET domain protein with MYND insert (Skm/BOP family)
Organism
cpv
Cryptosporidium parvum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SET
zf-MYND
Abc1-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3371751
NCBI-ProteinID:
XP_628652
ApiDB_CryptoDB:
cgd7_5090
UniProt:
Q5CXS8
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(1177482..1179245)
Genome browser
AA seq
587 aa
AA seq
DB search
KFLIIIDDLYDLQMWNLPEKIEIKEDERKGRSIIAKEEIQIGESILMEEPYCRILFSDNI
EEICDTCFNYLRSEGSYSECILECQECKKIKFCSKKCMEESKTIHHFECGILKLDILQMI
SNKVGVSFDRSRLLTRFVIKLILELNDKNKSQREQNNSYLISNLNQINSLVDNQEKFLQS
IKDVYQELALEILKIPKLKAEIDKLESDIITDKLLVKISCIIDSNSFGIPKFPLKCNVNG
DSVSELVNPRQKAPNSSLELSNSLLNPSILGWGLFSYSSLFNHSCDPNCDFIGVNPIPNQ
SSVTINLIANRKIQKDEEITINYVEIYDTRRNRIKNLLKTKHFICHCERCTTSFLNCNDS
YIQGFCCSKCFNINDFDYKSNNIPIIQSESVSNLNQPENIMSIIDDQDYLISQLTESYHC
NSCGEIYYGSEVTSIQNEFLDTIQEAENMNIQKYDLQGAINLISSLIQKYHLPDSKSLLP
HPLNHLLYRCYKLLTFWNVIVKDWNSVNYYVSKMINSHLLLFQNQYNLEISNLYSTKAIA
LSHLGHVSESNTEWNKCLKIRQICSRNFSYPYNISSVNSLIGHKDAA
NT seq
1764 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
aaatttttaataataattgatgatttatatgatttgcaaatgtggaatttaccagaaaaa
attgaaataaaagaagatgagaggaaagggaggagtatcatagcaaaggaggaaatacag
attggagaaagcatattaatggaagaaccgtattgtagaatattatttagtgataatata
gaagaaatttgtgatacatgctttaattatttgagatcggaaggctcttattctgaatgc
attctagaatgtcaggaatgcaagaaaatcaagttttgttcaaagaaatgtatggaggag
tctaaaacaattcatcattttgaatgtggaatactaaagttggatattttgcaaatgatt
tctaataaagtaggagtttcttttgatagatctagacttttaacgagatttgttattaaa
ttaatacttgagcttaatgataaaaataagagccaaagagagcagaataatagttactta
atatcaaatttaaaccaaattaattctttagttgacaatcaagaaaagtttttacagagc
attaaggatgtttatcaagaattagcactcgagattctcaaaattccaaaactgaaagca
gaaattgataaattggaaagtgatattattacagataagttattggttaagatttcatgc
attatagatagtaatagttttggaatccctaaattccctttgaaatgcaatgtaaatgga
gattcagtatcagaattagtgaatccacgacaaaaagctccaaattcttctttagagttg
tctaactctttattaaacccaagcattcttggatggggacttttttcatattctagcctg
tttaaccatagctgtgatccaaattgtgacttcattggagtaaatcctattcctaatcaa
tcctctgtaacaattaatttaatagctaataggaagattcaaaaggatgaagaaattaca
attaattatgttgagatttatgatactaggagaaatcgaattaaaaatctacttaaaacc
aaacattttatatgccattgtgaaagatgcacaacatcttttcttaattgtaatgactca
tatatccaaggattttgttgttcaaaatgcttcaacattaatgattttgactataaaagt
aataatattccaataatccaatcagaatctgtttctaacttaaatcaaccagagaatatt
atgtctattattgatgatcaagactatctaatctcccaattaactgaatcatatcactgt
aattcatgtggtgaaatttattacggatctgaagttaccagtattcaaaatgaatttctt
gataccatacaagaagctgagaatatgaatattcaaaaatatgatctccaaggagcaatt
aatctaatatcaagcttaattcaaaaatatcatcttcctgactctaaatcactgttacct
catccattaaaccatttactctatagatgttataagttactcactttttggaatgttatt
gttaaagactggaattctgttaattattatgtttcaaaaatgatcaactctcatttatta
ttatttcagaaccaatataatttagaaatctccaatctatactccactaaagctattgct
ttatctcacctaggacatgtttcagaatccaatacagaatggaataaatgtcttaaaatc
agacaaatttgctccagaaatttctcttacccatataatatatcttcagtgaattctcta
attgggcataaagatgccgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
