KEGG   Lachnoclostridium phytofermentans: Cphy_1612
Entry
Cphy_1612         CDS       T00619                                 
Name
(GenBank) Pectate lyase/Amb allergen
Organism
cpy  Lachnoclostridium phytofermentans
SSDB
Motif
Pfam: CBM77 Pectate_lyase_4 Pel9A-like_beta_helix Beta_helix Trypan_PARP Big_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABX41986
UniProt: A9KQS3
LinkDB
Position
1985551..1989780
AA seq 1409 aa
MQKLNLKRWIAMFLTALMLLITIIPSPLSMVAKASSTNIDLIESSGWLESAYVKWMPMDG
VDGYVAYVKGAYEEDTAYVKLDNELIRKYPTYYRADAVGLAAGIYVIKVVPVISGIEVEE
SAEVTGTLFVSAHTREGFAFSEFSTYKTGSGGYNNDGTVRDGAQIVYLTNENKDTVTLGV
NTGSKEETCTGIVDILSKREKGKDLRPLIIRIIGKVETPAGVSGSLLNIKKTSNVTLEGI
GDDATVYGWGILVREGKNIEIRNLGIMWFGDDAVSLDTKNENIWVHNNDLFYGKPGSDSD
QVKGDGSIDVKAFSTNVTVSYNHFWDSGKSSLAGMSESQEFFITYHHNWFDHSDSRHPRI
RLGSIHIYNNYFDGVSKYGVGVTMGASAFVENNYFRNCQYPMLSSGQGTDKYDSNTGNYT
NKGTFSGENGGIIKEFGNFMVGEKRFVNQYTTPDAGQIDAYTVENREEQIPADVVTVQGG
TSYNNFDTNPSRIYSYSVDSAEVAKIKVESFAGRNNGGDFKWYLSEAEDTNSEVIPELQV
AIMNYTSRLVSVGGLGDNNEGPTTEPTQSPTEPTIAPTQPPTSEDYSHNFTTQRLTSSFY
SFPGLANLANNKGTVTYNGMNLTDCLKMETGTQIVFTSPADGIYTMVFNPSTGKVNAKVN
GAKYTGDDQTGILTIPVLAGTKYTIDKADTANLFYMSLSLDDKEVPTVTPTIVPTEAPKP
TEIPTVIPTITPTIVPTGTPTPPESVVEGDIFVSPNASETGEGTFDDPIKLIVALTKVKA
GNTIWMLPGNYKYSEPIVVEKWNSGSAGAYKTVRNYMGGKVILDFSEQEYLPSNRGLVQD
ADYWKWYGIEFKGAGDNGMLLSGNHNIIEMCQFYENRDTGLQLSRYDTTAATIDLWPSYN
LIKNSTSFNNSDATGENADGFAAKLTCGEGNVFDGCMSYNNSDDGWDLYAKSETGPIGVI
TIRNCIAFRNGKLTNGSGSASGDMNGFKLGGSGIATPHIVENCMAFKNGAHGFTDNNNPA
PLTFKNITAFNNSNLSGSKKANFQIDRANRPTVYNAIGISTRKIASDKITSAIGSKIVYM
NSDKYYEYEGSIGGTFDSTSKSGTVITPVATDIFVSIVAPDLSTDFHTAWRNSDGSINTH
GFLQIKENSKYATFSTNGGFIGAVFKDEVIVEPTPEPTPTPEVTPKPTPEVKPSPTPGGK
PDPVPDVKPSPTPEPTPKVALIDQINVNSEKNIYIGGTMDWEWVGLRYPSTLKVVKDFTS
SNTNISEGEMMLSYKSGNTKIAIVSQTGKIVGKSKGKTIIYITVTLSDGKTKQLQQQVTV
NEASITFKRAASSMVIGDKNSFTLEVNGYRNEEIVWKTTKRDIAIVGKNNGKLTAVVSAK
SVGEDYVVVSVKDKNGKLLSIKTKVQVYK
NT seq 4230 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaaagttgaatttgaaacgatggatagcgatgttcttaactgcattaatgttgcta
ataacaattataccatcgccgttaagtatggttgctaaagcatctagtactaacattgac
ctaatcgaaagtagtggatggttagaatccgcatatgtgaagtggatgcctatggacggg
gtagacggatatgtagcgtatgttaagggtgcttatgaagaggataccgcttatgttaag
ttagataatgaattaataagaaaatatccaacttactatagggcggatgccgtagggctt
gcagcaggtatttatgtcattaaagttgtccctgttatatctgggatagaagttgaggag
agtgcagaggtaactggtactttatttgtatcagcacatacaagagaaggttttgcattt
tcagagttttcaacgtacaaaacaggatccggtggttataataacgatggaactgttaga
gatggtgcacagattgtttatctaaccaatgaaaataaggatactgttaccttgggcgta
aacacaggtagcaaggaggaaacttgtaccggtattgttgacattttgtcaaagagagaa
aagggaaaagatttaaggccacttatcatacgtatcattggaaaagtagaaactcctgct
ggagtgagtggttctttgttaaatataaagaaaacttccaacgtaacattagaaggtatc
ggagacgatgcaacagtctatggctggggtattctagttcgagaaggtaaaaacattgag
attagaaacttaggaatcatgtggtttggtgatgatgcagtttcattggacactaaaaat
gagaatatatgggttcataacaatgatttattttatggaaaaccagggagcgattctgac
caggttaagggagacggttccatagatgtaaaagctttttctaccaatgtaacggtttct
tacaatcacttttgggattcaggtaagtctagtctagcaggaatgagtgaaagtcaggaa
ttttttattacttatcatcacaattggtttgaccattcagattcacgtcatccacgaatc
agacttggaagtatacatatctataataactattttgatggcgtttcaaaatacggtgtt
ggagttacaatgggagcttctgcatttgtagaaaataattattttaggaattgtcaatat
ccaatgctttcttctggacaaggtaccgataaatacgattctaatacaggtaactatacc
aataagggaactttctctggagaaaatggtggtataattaaagaatttggaaacttcatg
gtcggtgagaaacgatttgtaaatcaatatacaacaccagatgcgggacaaattgatgcc
tatacagtggagaacagagaggagcaaatcccagctgatgtagtaactgtacaaggggga
acaagttacaataactttgataccaatccaagtagaatatattcttattcagtagattct
gcagaagtggcaaaaattaaggttgaatcttttgcaggacgtaacaacggtggagatttt
aaatggtatttgagtgaagcagaagatacgaattctgaagtaattcctgagctacaagtg
gcaattatgaattatacgtctaggttagtttccgttggtggattaggagacaataatgaa
gggccaactacagaacccacacaatcaccaacagaaccaaccatagcaccaacacaaccg
ccaacgagcgaagattattcacataatttcacaacacaaagacttacaagttctttctat
tcgtttccaggattagctaatttggcaaataataaaggaaccgttacatacaatggtatg
aatcttacggattgtttaaagatggaaacgggaacacagatagtttttacctcaccggca
gatggtatttataccatggtctttaatccttcaactggtaaggtgaatgcaaaagtgaat
ggtgcaaagtatacaggtgatgatcaaacaggtattctaacaattcctgttttagctgga
acaaaatatacaatagataaagcagataccgctaatttattttatatgagtttatctttg
gatgataaagaagtaccaacagtaacaccaaccatagtaccaacggaagcacctaagcca
acagaaataccaacagtaataccaacaataacaccaactatagtgcctacaggaacacca
acacctcctgaatctgttgtagagggagacatctttgtatcaccaaacgcatcagaaact
ggagaaggtacatttgatgatccaattaagcttatcgttgctctaaccaaagtaaaagct
ggtaatactatctggatgttgccaggaaactataagtacagtgaaccgattgttgtagaa
aaatggaacagtggtagtgctggtgcttataagacagtaagaaactatatgggtggtaag
gttattttagatttttcggagcaggagtatttacctagcaaccgtggtctagtacaagat
gcagattactggaaatggtatggaatcgaatttaaaggcgccggagataatggtatgtta
ctctctggaaatcataacataattgaaatgtgccagttttatgagaatagagatactggt
ttacaattaagtcgttatgatactacagctgcaaccatagatctatggccaagttataac
ttaataaagaatagcacatcctttaacaacagcgatgcaacaggagaaaatgcagatggc
tttgcagcaaagttaacttgtggtgaaggtaacgtatttgatggttgcatgtcttataat
aacagtgatgatggatgggatttatatgctaagtcagaaactggtccaataggagtaatc
actattagaaattgtattgcttttagaaatggtaaattaacgaacggatcaggtagtgca
agcggagatatgaacggatttaaacttggtggttcgggaattgctacaccacacatagtt
gaaaattgtatggcatttaaaaatggtgcacatggttttacagataacaataatcctgca
ccgctcacatttaaaaacattacagcatttaataacagcaatcttagtggaagtaaaaag
gctaatttccagattgatcgtgcaaacagaccaactgtttacaatgcaatcggaataagc
acgagaaaaatcgcttcggataagattacatcagcgattggatcaaaaatcgtatatatg
aacagtgataaatattacgaatatgaaggaagtataggtggaaccttcgattcaacgagt
aaaagtggaacagtgattacaccagttgctactgatatttttgtgagtatcgttgcacca
gatctatctactgatttccatactgcatggagaaactcagatggttccattaatactcat
ggttttctgcaaattaaggagaatagtaaatatgcaacattctcaacgaatggcggtttt
attggtgcagtttttaaagatgaggttattgtagagcctacccctgaaccaacgccaacc
cctgaagtaacaccaaaaccaacaccagaggtaaagccaagtccaacaccaggggggaaa
ccagatccagtaccagacgtaaaaccaagtccaacacctgaaccaacaccgaaagtggcg
ttaattgatcagattaatgtaaattccgaaaaaaatatttatattggaggaacaatggat
tgggaatgggtaggcttacgttacccaagtacactaaaagttgtaaaggactttacaagc
tccaatactaatatttccgaaggtgaaatgatgcttagttataagtctggtaataccaag
attgctatagtaagtcaaactggaaagattgttggtaagagtaaaggaaaaaccataatt
tatattacagttactttgtcagacggtaaaacaaagcaattacaacaacaagtcacagta
aatgaagcgagcattacgtttaagagggcagcttcatccatggtgataggtgataaaaac
tcatttacattggaagtcaatggctatagaaatgaagaaattgtatggaaaactacaaag
cgagatattgctatcgttggcaaaaataatggtaaattaaccgctgtagtatcagcaaaa
tctgtaggggaagattatgtcgttgttagtgtgaaagataaaaatggcaaattactttct
atcaaaaccaaagtgcaagtttataaatag

DBGET integrated database retrieval system