Lachnoclostridium phytofermentans: Cphy_1857
Help
Entry
Cphy_1857 CDS
T00619
Name
(GenBank) ABC transporter related
KO
K02003
putative ABC transport system ATP-binding protein
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
cpy
Lachnoclostridium phytofermentans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cpy02000
]
Cphy_1857
Transporters [BR:
cpy02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
Cphy_1857
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
FtsX
AAA_21
SMC_N
nSTAND3
AAA_29
DUF2480
nSTAND1
AAA_23
RsgA_GTPase
Rad17
AAA_22
ATPase_2
AAA_16
DUF5734
DO-GTPase2
RNA_helicase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABX42226
UniProt:
A9KT15
LinkDB
All DBs
Position
complement(2284398..2287055)
Genome browser
AA seq
885 aa
AA seq
DB search
MLQIKNISKKYATKYLVQSALDDVSLTLRDNEFVAILGPSGSGKTTLLNIIGGLDRYDSG
DLIINGISTKKYKDRDWDSYRNHTIGFVFQSYNLIPHQSILSNVELALTISGISKKERKR
LSTEALEKVGLGNQIHKKPNQLSGGQMQRVAIARALVNNPDILLADEPTGALDTETSILV
MDLLKEIAKDRLVIMVTHNPELAEHYATRTVKLRDGKIIDDSDPYQENQQDVTKPEHKSM
GKTSMSFLTALSLSLNNLKTKKARTILTAFAGSIGIIGIALILALSSGINNYIENVQKDT
LSTYPISIERESIDMTSMMSTMMEHNRSNGITHDLDKIYSNNIVTGMFSTLSEEKKANDL
GAFKEYIEREDSKINDYVSTIQYGYDLDLQIYSSDTTNGVTQLNPSKLFNRSGMSGMSGM
SGMGGMSAQSMGMMSSNVFSEMLGNKELLESQYDVLAGRFPDEGAYNEVVLVVDKNNEIS
DFALYTMDFMNQEDFKNIQKSLAKGEDVKEPDQASFTYDEALNKTFKFVLNTDYYVYNKE
TGVWKDMREDKSFMTKLVDDSLELKIVGILKPNPEASASSINGAVGYTSALTEYIINKIN
NSDITKAQLADKETNVFTNMPFDMNGYMENITMAEINDFVKTLSEEEQQQFKVLSSTMTE
DQIIATFGEQIRSAAGKETTYEDNIAQLGIVNLDQPSTINLYPINFEAKDAIAKIVEDYN
TIQKDAGHEDMTISYTDLVGLMMSSITTIIDMISYVLIGFVAISLVVSSIMIGIITYISV
LERTKEIGILRSIGASKRNISSIFNAETLIIGFTSGMLGIVISLLLLIPINAIIASLSGI
SKIAILPWGYAIVLVVISMILTLIAGLIPSKKAAKKDPVTALRSE
NT seq
2658 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctacaaattaaaaacatatcaaaaaaatacgctacgaagtatctggttcagtctgcg
cttgatgacgtcagcttaacacttcgtgacaatgaatttgttgcaatccttggaccaagt
ggttctggtaaaacaacattattaaatatcattggtggtttagaccgttatgatagcggt
gatttaatcattaatggtatctcaacgaaaaaatataaggaccgtgattgggattcctat
agaaatcataccattggttttgtttttcaaagttataacttaatccctcatcaatccatc
ttatccaatgtagaattagccctcactatttcgggtatctctaaaaaggaaagaaaaaga
ttatcaacggaagctttagaaaaagtaggccttggaaatcagattcataagaaaccaaat
caactctccggtggacagatgcagcgtgtagcgattgctagagcacttgtcaataatcct
gatatccttttagcagacgaaccaacaggagcactggatacagaaacaagtattcttgtt
atggatttattaaaagaaattgcgaaagatcgattggttattatggttacccataatcct
gaacttgcagaacattatgctacaagaacagtaaaacttcgtgatggtaagataatcgat
gattccgatccatatcaagagaatcaacaggatgtaacaaagccagaacataaatcaatg
ggaaaaacttcaatgtcattccttaccgcactatctcttagcttaaataacctaaaaacc
aaaaaggcaagaacaattcttactgcatttgctggaagtattggtattattggtattgct
cttatactagctctttcgagtggtattaataattatattgaaaatgtacaaaaagatacc
ctatccacttatccaatcagtattgagagagaaagtatcgatatgacatcgatgatgtct
acgatgatggagcataatcgctcaaatggtatcacacatgatctggataaaatttattcg
aataatattgttaccggtatgttttctaccttaagtgaagaaaagaaagcgaatgattta
ggtgcatttaaagaatatatcgaacgtgaagattcgaagataaacgattatgtatctacc
attcaatacggttatgatttggatttacaaatctatagttcagatacaactaacggtgta
acacaattaaatccaagcaaattgtttaacagatctggaatgagtggaatgagtggaatg
agtggaatgggcggaatgagtgctcaaagcatgggtatgatgtcttccaatgtattttca
gagatgttaggaaataaagaactattagaatctcaatatgatgttcttgcaggacgtttc
ccagatgaaggtgcttataacgaagttgtgcttgtagttgataaaaataatgaaatcagt
gacttcgctctttacaccatggattttatgaatcaggaagactttaaaaatattcaaaaa
tcattagccaaaggtgaagatgtcaaagaacctgaccaggcgtcgtttacttacgatgaa
gcgttgaataagacttttaaatttgtccttaatacagattactatgtatataacaaggaa
actggtgtttggaaggatatgcgcgaagataaatcatttatgaccaaattggtggatgac
tcattggaattaaaaattgttggtatcctaaagccaaatccagaagcaagtgcatcctcc
attaatggtgcagttggatatacctccgctttaaccgaatatatcattaataaaatcaat
aacagtgacattacaaaagctcaacttgcagataaggaaacaaatgtctttacgaatatg
ccttttgatatgaatggatatatggaaaacataacaatggcagaaatcaatgatttcgta
aaaacattgtctgaggaagaacaacagcagtttaaagtgcttagctctacaatgacagaa
gatcaaataattgctacctttggagaacaaattcgttctgcagccggtaaggaaactacc
tatgaagataacatagcacagttaggaattgtaaatcttgaccagccttctacaatcaac
ctctaccctattaactttgaagcaaaagatgctatagcaaaaattgttgaagattataat
acaatccaaaaagacgctggccatgaagatatgaccattagctataccgatctcgttggt
ttaatgatgtcttctatcacaaccatcatcgatatgattagttatgttttaattggcttt
gtagcaatttcacttgtcgtttcctccatcatgattggaattatcacctatatatctgtt
ttggagagaacaaaagagattggtatcttacgaagtattggagcttcaaaacgtaatatt
tccagtatctttaacgctgaaacattaattattggatttacttcaggtatgcttggtatc
gttatttcgctcttactattaataccgattaatgctattattgcttccttatccggtatt
tctaaaattgcaatattaccatggggctatgcaatcgtacttgtggttattagtatgata
ttaacattaattgcaggtttgattccttctaagaaagcagctaagaaagatcctgtaaca
gcacttagatcagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
