Cherax quadricarinatus (Australian red claw crayfish): 128696998
Help
Entry
128696998 CDS
T09502
Name
(RefSeq) macrophage mannose receptor 1 isoform X1
Organism
cqd
Cherax quadricarinatus (Australian red claw crayfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Lectin_C
Clec-141-158
UL45
Xlink
DUF4006
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128696998
NCBI-ProteinID:
XP_069951284
LinkDB
All DBs
Position
49:complement(9983267..10274960)
Genome browser
AA seq
2087 aa
AA seq
DB search
MASLTVAPSLFLLFFLFHTGGSMMVARCPVKWQQRGGTDQCYLIHSTGQARTFSDARDYC
KAYNGDLVIIGSVAMKNWLSLAVAETGDVGQAAYVWVGAQYVDNAWKWIEIGEDVDTNVV
QFEGTGEGSCAAFTANSKLIKQDCSQKLNFVCHRNITVPPPCDYDTGWEEMNKYCYKKSE
VKNSWYDSLVNCEIEGGSLLTIETNIEQQMAIDLALDARDNVWIGLNEQGHAGQFTWVDG
EESNYTHWKEGQPDLSYNGFGAAVVDKSDDDGHWVVEKVTDQYHYICKKVQGSCLPGWEV
FEDSCYYFNTEEVDSLVWEDAKGICESVGASLVVLDTVAEDAFFYDHIPENDQLWLGLYS
KPQDNLYWTDGTVMSSKNFSYMTTKDMNDAIQADEQQCVFFQIGESDLTTPISSWVPTDC
HIPRHYACEVPAGQPVILIPPSNERYCPEGWEKESDHCYMFSTQEMSWSAAASSCASQDS
SLVSILSWREQDFVKLYQQGGSWIGLNDRKTENAWIWSDGSSVTITNWNVGEPTGGGENC
AQMLADTGKWNDIPCDLQLVFSCKKKASSTPIGTLTTTTAEPDTSACGIDWTENPVTGEC
YRLELEELSFADARSHCTELFYYSGQSKPDLISIYSSQEQTFVYDLVTRQHLSQTSLWLG
MKNDVDGARWMDGTPAAYFNWDDGEPNGYFTENCIVMYLESGKWNDNVCDLRAAFICEKK
GTNYVGPQPPPPPAVTCPEGWSYWNNHCYFFSDTTTDWDSAHDACNNNMGSELVSIASED
EDNYLASVLSSAYKLAWIGLHDDNNGANWHWVDGTPLDYTNWYYTEPNDQDGNEHCAEKR
YDYGNQWNDMRCSETNYYICKITVTTCPQTWAYKNGKCYFASDFEITWNEARDKCKEYNT
EADLVSIHSDEENAFFTEQLTHKSDATWLGLSYNQISDQWIWSDGQVNNYTNWNEGEPNS
DTENCVECIDYPTDPAHGKWNNLDCTASRAFACELFPTHTVGCEEGWFNFDNYCYWASDS
YNWVSFSSARADCQSKGGDLASIHSAEENDYIVSQVNSDYYYNTYWWIGMTDSGHEGTYQ
WSDGTSVTYTNWDILSYYSFRGESNCALLGDNFGDNLWSLDLCDSYNSYVCKKPQESTPI
TPSQDGCNTDDAAYKGSCYNLPDMEYSWSDAKAYCESHSAHLLVLNDRYESAFVSAMLGD
LDSWAWLGLSGAVGDDGAITFSWVNADPVDFTNWDEFEPDASHGLCVMASGKKSNPGLWI
VRSCDNTYNFLCEYDRSGYTTPPVPTTLAPSDFCAYGWTLKDEHCYQVVSDAMSWGQGEE
FCMSMGGHLASVGSAEEETIIQQLPGMSDHTFYKSVWVGLRMGSESGFEWSDGTAFDYVN
WDEDQPDNHYERENCVSANMLTMKLSDSVCGAYFPFICEAPQGMMVTTLAPPTRGPDILC
DEDPSWYLHGDYCYQFNSVSDEDPQTWWESHIFCRNEGAELASIHTFDDNYWIESKIYNM
SDNMFWIGGQASLDSGYMWIDETAFDFDNWAKGEPNNEYDQEDCISMYNHQQGYWNDANC
AHTMGCICRKLHGQTFPPPKTTKIPDGHCPDGWLHTGRKCIKSFKDKMNFTSARSSCKAL
DDKADLVSIHSSAEQAYLTALLGSIQEEVWLGMQYMGEFLWLDQSSLSYTNWSPGEPSGG
PDWNLCVQASPATGQWNDVFCFGEYSYICMMNQDPNVFDHHPPPTCHPPFNEYLAYNDAC
YKPMNTTKSWQEAESACVNEGAHLASVHDLSEDALMWVLTQESAVDDAWLGFNNLQSQQV
YKWCDGWPTMYTNWDRDQPNATSSDNNCVRVNVHNGRWSAENCEEVRPFICKFYNGTVPT
PDPPIIGHCPDSRWLDLGGGYCYLIITDLKSWSDANMGCLQEDASLASIHSEEEMKLITM
AVKNYQLPFWIGLVQKAYGDFGWSDGSGFDFFNWQSGQPNSDEEQCTEISPTSGLWNDAV
CSNIRFSICKILKIQDEKPTKPVPTGSVTTNSPHGGNGKLDAGGIIGIIVAVLFVMVAVG
FVGYNLVQRQPKPVENHENLSFSYVTSSQGKRGGHINVNVPNEGSDA
NT seq
6264 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcatcactaactgtggctcccagcctcttcctcctcttcttcctcttccatactggt
ggtagcatgatggtagcaaggtgtcccgttaagtggcagcagcgtggaggcacagaccag
tgctacttgattcacagcacaggtcaagctaggaccttcagtgacgctagggactactgc
aaagcctacaacggggacctggttattatcggcagtgtcgccatgaaaaattggttatcg
ctagcggtagctgagacgggagacgtgggtcaagctgcctacgtgtgggttggggctcag
tacgttgataacgcttggaaatggattgaaatcggggaggatgtagacacgaacgtggtg
caatttgaaggcacgggtgaaggcagttgtgctgcctttactgctaactccaaactcatc
aagcaagactgttcacagaaactcaatttcgtctgtcacagaaacatcactgtaccccct
ccttgtgactacgacactggctgggaagagatgaataaatactgctacaagaaatccgag
gttaagaactcttggtatgatagtctggtgaactgtgagatagagggaggttcacttctc
actatcgagaccaacattgagcagcagatggccatagatctcgctctcgacgcccgggat
aatgtttggattggactcaacgagcagggtcatgctggacagttcacttgggttgacggt
gaggagagtaactacactcactggaaggaaggtcagcctgatctatcctacaacgggttt
ggcgctgctgtggtggataagtcagatgatgatggtcactgggtggtagagaaagtcacc
gaccagtaccactacatctgtaagaaagtccaaggatcatgtctcccggggtgggaggtg
ttcgaggattcctgctactatttcaacacggaagaggtggactccttggtgtgggaggac
gccaagggcatctgtgagagcgtcggtgcctccctggtagtcttagacactgtggcagaa
gacgccttcttctacgaccatatcccagagaacgaccagctctggctcggtctttacagc
aagcctcaggataacctctactggacggatggaactgtaatgtctagcaaaaacttcagt
tacatgaccacgaaagacatgaatgatgctatccaagcggatgaacaacagtgtgtcttc
ttccagattggtgagtctgacctgaccacaccgatatcttcgtgggtgccaactgactgt
catatcccaaggcactatgcctgcgaggtgccagccggccagcctgtcatcttgatccct
ccgtccaatgaaaggtactgcccagagggatgggagaaggagagtgaccactgttacatg
ttcagtacacaggagatgtcatggtcagcagcagcatccagctgtgcctctcaagactca
tcactcgtctctatcctctcctggagagaacaagactttgtcaagttgtaccagcagggt
ggaagttggattggtttaaatgaccgtaagacagaaaacgcttggatctggagtgatgga
tctagtgtcactatcacaaactggaatgttggtgagcctactggtggtggtgagaattgt
gcacagatgctggcagacacaggcaagtggaatgacattccctgtgaccttcagttggta
ttcagctgcaagaagaaagcatcttctacgccaattggcacactaaccaccaccactgct
gagccagacacctcagcatgtggcatagattggacagaaaatccggtgactggagagtgc
taccgtctggagctggaggagttaagtttcgctgatgctcgttcccactgcacagaacta
ttttactacagtggccagtccaagccagacctcatctccatctactcatcccaagaacaa
acttttgtctatgatctggtgactaggcagcacctgagccagacatcattatggctgggc
atgaagaacgatgttgatggcgctagatggatggatggcacacctgctgcatacttcaac
tgggatgatggtgaacccaatgggtatttcactgaaaactgcatagtaatgtacttggag
tctggcaagtggaatgacaatgtctgcgatcttcgtgctgcttttatatgtgagaaaaaa
gggacaaactacgtgggtcctcagccacctcctccacctgctgtgacgtgtcccgagggc
tggtcatactggaacaatcactgttacttcttctctgataccaccactgactgggactct
gctcatgatgcttgtaacaacaacatgggcagtgaacttgtctcaatagcaagtgaagat
gaagataactacttggcttctgtgctatctagtgcatacaaacttgcttggataggtcta
catgatgacaacaatggcgctaactggcactgggtggatggcactcccttggactacact
aattggtattatactgagcccaacgatcaagatggaaatgagcactgtgcagagaaaagg
tatgactatggcaaccagtggaatgatatgcgctgttccgaaaccaactattatatatgt
aaaattactgtcacaacatgtccacaaacatgggcatacaagaatgggaagtgttatttt
gctagtgactttgagattacttggaatgaggcgagagacaagtgtaaagaatataatact
gaggctgacctcgtcagtatccactccgatgaagaaaatgctttcttcactgagcagtta
acacacaagagtgatgctacttggctaggcctctcttacaaccaaatatctgaccagtgg
atctggagtgatggccaggtcaataactacactaactggaatgagggagaacccaacagt
gacactgagaattgtgttgagtgcattgactaccctactgatcctgctcatggcaagtgg
aacaacttggattgtactgcatccagggcatttgcatgtgaattattcccaacacacacg
gtgggctgtgaggagggttggttcaacttcgacaactactgttattgggcatctgactca
tataactgggtaagcttcagcagtgcccgagcagactgtcaaagcaaaggtggggacctc
gcctccattcacagtgctgaagagaatgactatatcgtgtcccaagtcaattctgattat
tattataacacctattggtggattggtatgacagatagtggtcatgaaggcacctaccag
tggtctgatggtacctctgtcacctataccaactgggatatattaagctattattctttc
cgaggagaatctaattgtgctctccttggtgacaattttggggacaacctgtggtcgctg
gatctgtgtgatagctataatagttatgtgtgcaagaagcctcaggaaagtacacctatc
accccttcacaggatggatgtaacacggatgatgcagcatataaaggctcttgctacaac
ttgcctgacatggaatactcatggagtgatgccaaggcttattgtgagtctcatagtgca
cacctgctagtcctcaatgacaggtatgagagtgcttttgtatcagctatgttgggtgac
ctagacagctgggcatggctgggtctctctggtgctgtgggcgatgatggtgctatcact
ttctcgtgggtcaacgcagatcctgtcgacttcacaaactgggatgaatttgaacctgat
gcaagccatggactgtgtgtgatggcgtctgggaagaagagtaaccctggattgtggatt
gttaggagttgtgacaacacgtacaattttctttgtgagtatgatcggagtgggtacact
accccacctgtgccaaccaccctcgctcctagtgacttttgtgcctatggctggactctc
aaggatgaacattgttatcaggtggtgtctgatgcgatgtcatggggccagggagaggag
ttctgtatgtctatgggtggccatcttgctagcgtgggaagtgccgaggaggaaacaatc
attcaacaattgcctggcatgagtgaccacaccttctacaagtctgtgtgggtcggcctt
aggatggggtcagagtcaggttttgaatggtcagatggaacagcatttgactatgtgaac
tgggatgaggatcagccagacaaccactatgagagggagaactgtgtttctgcaaacatg
ttaaccatgaagctttcagacagtgtatgtggtgcctactttcccttcatttgtgaggcc
cctcaaggaatgatggtaacaacattagcaccgccaacaagaggtccggacatactgtgt
gatgaggatccctcctggtacttacatggagattattgctaccagttcaattctgtatct
gatgaagaccctcagacctggtgggaatctcacatcttctgtaggaatgaaggtgcagag
ctagcatctatccacacttttgatgataactactggattgaatcaaagatctacaatatg
tctgataatatgttctggattggaggccaagctagtcttgactctgggtacatgtggatt
gatgaaactgcctttgactttgacaactgggcaaagggtgaacccaacaatgagtatgac
caagaagactgcataagcatgtacaaccatcaacaagggtactggaatgatgccaactgt
gcccacacaatgggatgcatctgtaggaagctgcatggtcaaaccttcccacccccaaag
accactaaaattcctgatggtcattgtccagatggctggctccacacaggtagaaaatgc
ataaaatcctttaaagacaagatgaacttcacatctgctcggtcatcttgtaaagccttg
gatgataaagctgatttggtcagtatacactcatctgcagaacaagcctacctgacagct
ctgctaggtagcattcaagaagaagtgtggttggggatgcaatatatgggagagttcttg
tggcttgaccagtcctctctctcctacactaactggtctccaggagagcccagtggtgga
ccagactggaacctgtgtgtgcaagcctcgccagcgactggtcagtggaatgatgtcttt
tgctttggagagtacagttacatctgcatgatgaatcaagatccaaatgtatttgatcat
catccaccccctacctgccatcctcccttcaacgagtatcttgcttacaatgatgcatgt
tacaagcccatgaacacaaccaaatcctggcaagaagccgagtcagcttgtgtgaacgag
ggagctcacttggcctcggtccatgacctctcagaggatgccttgatgtgggtcctcact
caggaaagtgctgttgatgatgcctggcttggcttcaacaatttacagagccaacaggtg
tacaagtggtgtgatgggtggccaaccatgtacactaactgggacagagatcaacctaat
gctacctccagcgacaacaactgtgtccgggtgaatgtccacaatggtcgctggtcggca
gagaactgtgaagaagtgaggcctttcatctgcaagttttacaatgggacagtcccaacc
ccagacccacccatcataggtcactgtccagattctcgctggctggaccttggtggtggt
tactgctacctcatcatcactgacctgaagtcctggagtgatgctaatatgggttgcttg
caagaggatgccagcctagcatcaatacattcagaagaagagatgaagcttatcaccatg
gcagtaaaaaattatcaactgccattctggattggtcttgtacaaaaagcatatggtgac
tttggctggagtgatggcagtgggttcgacttcttcaactggcagagtggtcagccaaac
agtgatgaggaacagtgtacagagatcagtcctacttctggcctctggaatgatgctgtg
tgctccaatattagattttctatctgcaaaattttgaaaattcaggatgagaagcctacc
aagcctgttcccacaggctcagtgaccacaaactctcctcatggagggaatggaaagctt
gacgcaggtggcataattggcatcatcgtagcagtgctttttgtgatggttgctgtcggc
tttgttggatataatcttgtccagaggcaaccaaaacccgttgaaaaccatgaaaattta
tctttcagctatgttacctcttctcagggtaaaagaggaggccatatcaatgtgaatgta
ccaaatgaaggatcagatgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
