Chenopodium quinoa (quinoa): 110684173
Help
Entry
110684173 CDS
T05764
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cqi
Chenopodium quinoa (quinoa)
Pathway
cqi03015
mRNA surveillance pathway
cqi03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cqi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
110684173
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110684173
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cqi03041
]
110684173
Spliceosome [BR:
cqi03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
110684173
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
DUF7818
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110684173
NCBI-ProteinID:
XP_021716275
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MYGCGGESNPPPSGGGYGGGYGGGSYGGGDRGGGYGGDRGGGYSGGRGGGGGGGGGGYGG
GGRGGGGGYGGNSDSRGGGYQGGGDRGSRGGGRGGGGGGGGRGGSGRDGDWPCPNPGCGN
LNFARRTSCNKCGEPAPAGAGGGGGGGGGDRRGGGGGGGYNRGGSGGYRGDRGDRGRDYD
GGRGGGRDNNYEGGRSGGSRGGSYGDGQGRNDSGYGQAPPAAPSYGGAVPSPYGANPVYG
NDSAVPPPTSYTGGPGSYPPSYGAPAGGYGGDASGDYRGAGRGGPPSGGYGGGQRQSSGG
YGGDAPTSAEPPKVKQCDENCGDSCDNSRIYISNLPPDVAIEELRELFGSIGIVARIKQK
RGYKDQWPYSIKLYTDDSGKNKGDGVLSYEDPSAAHSARGFFNGYDIRGHKINVTMAEKS
APRAPQSFGGGARGGYGGGDRRRDYGGPDRHSHGGNRSRPY
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggctgtggtggtgaatccaatcctcctccttccggaggcggatacggcggtggt
tatggcggcggaagctatggaggcggtgacagaggtggcggatatggcggtgacagaggt
ggcggttatagcggtgggagaggtggtggcggtggtggtggaggaggaggttatggtggc
ggtggtagaggtggtggtggtggatatggcggtaattctgatagtcgaggtggtggatat
caaggaggaggagatcgaggcagtcgtggaggtggaagaggcggtggtggcggcggcggt
ggccgtggaggaagtggaagagatggcgattggccctgtcctaatcctggttgtgggaat
ttgaactttgctagaagaacttcttgtaacaaatgcggggaacctgctcctgcgggtgct
ggaggcggtggtggtgggggtggtggtgaccgtagaggtgggggtggaggtggtggctac
aatagaggaggcagtggaggatatagaggtgatagaggggataggggtagggattatgac
ggtggaaggggtggaggtagggataacaattatgaaggtggaagaagtggaggtagcaga
ggtggttcttatggtgatggtcagggtagaaatgacagtggatatggccaggctccccca
gctgcaccttcttatggtggagctgtaccgagcccttatggagcaaaccctgtctatggg
aatgattctgctgtccctcctcctacaagttatactggtgggcctggttcctatcctcca
tcatatggagcaccagcaggtggctatggtggtgatgcttctggagattatcgtggtgct
ggccgcggtggaccccctagtggtggctacggtggtggtcaaagacagtctagtggtggt
tatggtggcgatgctcctacttctgctgaacctcctaaagtgaagcaatgtgatgaaaac
tgcggagattcatgtgacaactccaggatttatatctcgaatttgccaccggatgtcgct
attgaagaacttagagaactttttggaagcattggaattgttgcaagaatcaagcaaaag
aggggctacaaggatcagtggccgtacagtataaaactgtacacagatgatagtggaaag
aacaagggtgatggtgttttgtcatatgaggacccatcagcagctcattctgctagggga
ttttttaacggctatgatatcagagggcacaagatcaatgttacaatggcagagaagtct
gctccaagggcacctcaatcttttggaggcggtgctagaggtgggtatggaggtggagat
cgtcgaagagactatggaggtccagataggcattctcatggtggaaatcgttctcgccca
tactga
DBGET
integrated database retrieval system
