Chenopodium quinoa (quinoa): 110688526
Help
Entry
110688526 CDS
T05764
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cqi
Chenopodium quinoa (quinoa)
Pathway
cqi03015
mRNA surveillance pathway
cqi03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cqi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
110688526
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110688526
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cqi03041
]
110688526
Spliceosome [BR:
cqi03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
110688526
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
DUF7818
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110688526
NCBI-ProteinID:
XP_021720985
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
464 aa
AA seq
DB search
MYGGGGESNPPQGGSGYGGGYGGGSYGGGDRGSGYGGDRGGGYGGGGGGGGGGGGGGYGG
GGRGGGGGGYGGNSDSRGGGYQGGGDRGSRGGGRGGGGGGGGRGGSGRDGDWPCPNPGCG
NLNFARRTSCNKCGEPAPAGAGGGGGGDCRGGGGGGGGGGGGYNRGGSGGYGGDRGDRGR
DYDGGRGGGRDNNYEGGRSGGSRGGSYGDGHGRNDSGYGQAPPAAPSYGGAVPSPYGANP
VYGNDSAVPPPTSYTGGPGSYPPSYGAPAGGYGGDASGDYRGAGRGGPPSGGYGGGQRQS
SGGYGGDAPTSAEPPKVKQCDENCGDSCDNSRIYISNLPPDVAIEELRELFGSIGIVARI
KQKRGYKDQWPYSIKLYTDDSGKNKGDGVLSYEDPSAAHSARGFFNGYDIRGHKINVTMA
EKSAPRAPQSFGGGGRGGYGGGDRRRDYGGPDRHSHGGNRSRPY
NT seq
1395 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggcggtggcggtgaatccaatcctcctcaaggaggaagcggatacggcggtggt
tatggcggcggaagctatggaggcggtgacagaggtagcggatatggcggtgatagaggt
ggtggatatggcggtggtggtggtggtggtggaggaggaggaggaggaggttatggtggc
ggtggtagaggtggtggtggtggtggatatggcggtaattctgacagtcgaggtggtgga
tatcaaggaggaggagaccgaggcagtcgtggaggtggaagaggcggcggcggcggcggc
ggcggccgtggaggtagtggaagagatggcgattggccttgtcctaatcctggttgcggg
aatttgaactttgctagaagaacttcttgtaacaaatgtggggaacctgctcctgcgggt
gctggaggtggtggtggtggtgactgtagaggtggaggtggaggtggtggtggtggtggt
ggtggctacaatagaggaggcagtggaggatatggaggtgatagaggggataggggtagg
gattatgatggtggaagaggtggaggtagggataacaattatgaaggtggaagaagtgga
ggtagcagaggtggttcttatggtgatggtcatggtagaaatgacagtggatatggccag
gctcccccagctgcaccttcttatggtggagctgtaccgagcccttatggtgcaaaccct
gtctatgggaatgattctgctgtccctccgcctacaagttatactggtgggcctggttct
tatcctccatcatatggagcaccagcaggtggctatggtggtgatgcttctggagattat
cgtggtgctggccgtggtggaccccctagtggtgggtatggtggtggtcaaagacagtca
agtggtggttatggtggcgatgctcctacttctgctgaacctcctaaagtgaaacaatgt
gatgaaaactgcggagattcttgtgacaactccaggatttatatctcgaatttgccaccg
gatgtcgctattgaagaacttagagaactttttggaagcattggaattgttgcaagaatc
aagcaaaagaggggctacaaggatcagtggccgtacagtataaaactatacacagatgat
agtggaaagaacaagggtgatggtgttttgtcttatgaggacccatcagcagctcattct
gctaggggattttttaacggttatgatatcagagggcacaagataaatgttacaatggca
gagaagtctgctccgagggcacctcaatcttttggaggcggtggtagaggtggttatgga
ggtggagatcgtcgaagagactatggaggtccagataggcattctcatggtggaaatcgt
tctcgcccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
