Chenopodium quinoa (quinoa): 110711628
Help
Entry
110711628 CDS
T05764
Name
(RefSeq) small subunit processome component 20 homolog
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
cqi
Chenopodium quinoa (quinoa)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cqi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
cqi03009
]
110711628
Ribosome biogenesis [BR:
cqi03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
110711628
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
UTP20
UTP20_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110711628
NCBI-ProteinID:
XP_021745735
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2690 aa
AA seq
DB search
MASANEAQAVKSLNTTPGLRNRRFVFKSCAQQIDELEINVFRNLETVKAKPSSGSYFFLD
CLIHWRELNTAEDFISLYEELMPLVQTLSLALLHKDMIIARLLSRLQMKARLSLEAIFRL
IAELSRDLGEEFIPFLPRIIESYLGLLKDKADREPEIIEQMFTSLSYIMMYLQRYLTQKV
VHILEVTVKLRYYPKDFVQEFMAKALSFLLRNAPTPQLKEGVSKILHEAARKPSEAKKFG
ASALLWHIMRGTSSNFHSRASRVLVLLTDSGFLSIGDKFNQGSDTVTEIVIASLERCMEL
DVSELQLIWNNLYEAVANSLSGGYSQHLSCLLSVLISIISVDHGQKVGDYKQMQKLVDLL
MWKFILPFSSGETKGLVSEAADKTFQLLLCVLDGICNNNNSTGIPELALQWAPVFQLKSS
SLLTLLKDLVMKDYAILAFQSNILSGCLNVLEIAKGEALHLMLAYCERFQAKTGCFNVLE
GMPKELVVKSRCFFQETICYWIGVIKNMTHRDTIIDEVVDEDTLALLWGTICCIPYFLSV
EGNEYLMNLVDEVDRLLITETDFVAGVPKRIWQGLIGAALQSYHGAGRLERFEQEHTSKI
LHLGKSYKSSQQILSAVAEYLDLKYGESLQKNKGVSIRHLKLEAADGMDALNVFSENLFH
PDKELRVSTLKILCHYELLNYESQQMDAEDSEEDHVGTQCYNVFNLLLTIEQTPISVATG
RKVTLLVSRIRTSLSAPGVTEAHVLPAFYGTIGLLYNQYMDLSNAALECLSAMISTYPGL
LWNKFICFFEQCQTISIKAHGLDNSNMIACSDKTDLVEHFRSFCSTSSDRSGLSITPLLL
QALQRIPTVTESHSRQIVPLFLKFLGYSDENPRLESFDSHACAGKDWKVVLMEWLNLFKL
MKNPRSFYCSQLLKEVLVNRLLDNNDVEIQIRVLDCLLNWKDRFLLPYEKHLKNLVSSKC
LREEIATWSLSEDSNLVEEEHRAQLVPLVIRLLMPKVRSLKTLASRKHASVSNRKAVLGF
IAEFTVAELPLFFQLLLKSLQITDLGNEEIESCAWVSEKCNLDEFELPTLLNLFSVERIL
AIPLKKRFGFLHVVEEIFRIFDASRVSPFLDLLLGCVVRILDSCASSILNRSPKQPAQLD
GSSDITLQESRKEAMSHTSSAVKQFKDMRSLCLKIISSILNNYEDHDFGSTFWDIFFKAV
KPLVHGFKQEGSSSEKPSSLFFCFLAMSQSPRLVSLLCREKNLIPDIFSILSVPTASEAI
IYSVLKFTENLLTVKDELGIDGYVIDDVFCSNLDGLVDSLHHLCHSFTEKKRKLLKHPGE
TLLRVLKLLSKFINDQSGARKFVDILLLLASDGIKNSDLCMEALQILRDIVSVLRSEANT
KILKAVSPILISAERGVRSSICNLLGALAENDSSIRSMVNLVCELNATTSAMELDDLDFD
IIINAYDRITADYFFGVSEDQAIVILSHCIYDIKSDELILRQCAYKSLLSFVEFSALIIG
EEVKNQDVPARTMAIDDPYWTDNHIQHIVNKFLLKHMGDAMTKITTMQKEWIDLLHEMVL
KLSGIPNLGSLKVLCSEDAEVDFFNNIVHLQKHRKARALSRFRNIVATGQLSEFMLKKVF
IPLFFSMLYDLQAGKGEHIRSACLDAIASISGQLGWKSYYALLMRCFRDMEKKLDREKVL
LRLVCSILDQFHFSETYSSPDLVFPRNDVTENDPEDKTNSATIPKGASYMFSATQACLTG
TVLPKLQKLLVSDPQKVNVNISVAILKVLKKLPGDTLDTHLSSIIHRISNFLKNRLQSIR
DEARCALVACLKELGFEYLKLVVKALSATLKRGFELHVLGYTINFILSKGLPDTVGGMLD
FCLDELLRAVDNDIFSEVAEQKEVEKVAFKMKETRKQMSFDTLRLIAQNVTFKSHGLKLL
SPVTAHMQKHLTPKVKLKLETMLTHIAEGFERNSSVEQIDLFIFIYGLIDDWLSEDKRRR
ETKLVKGLKIEKHLEASSNIVMKCYVGTEPQCSYLIAVFALRLLHNRLRNIKLHKGDDHL
ISLLDPFIKLLTSCLSSKYEEIVDVALKCIFPLTRLPLPSLESQADMIKVTLLGIAQSTS
NVNSPVMQSCLKLLIALLQSTKITLSADQLHVLIRFPLFVDLEKNPSFVALTLLKAIVRR
KLVVLEIYDLMDQVAKLMVTSQEEAFRRKCSQILLQFLLNYQLSQKRRQEHLDFLVIHLR
YEHATGRSAVLDMLKTIIKRFPESVICEQSTIFFLTLVRALANDPDNQVRSLIGIVIKHL
LGRINSQPLESILNMCLTWYLGEQQQLRSLSFQALGFVVEVMKRGFRKHINDVLPVMKMT
VQSAIDVLNGGQLNLSDPETIPFWKDAYYSFVLLEKILTQIPELFFVGDIEDIWQAVSEL
LVHPHPWICNISSRLVALYFEQMVKKGGKIGTTCLTSTSRMFLIASSLCSRLKVQLPDKG
VRRIVKCNLAFAICGIQSLLRQTEFQDPCTFWSSLGSRDQGCFLKACQLLDTKSGRNITE
VFTCGFDDDNFDQKIDNLSSLLVSGLLNTMGKTALQTEDTQTKMILGSFRLVAEQTTQED
CLQYAYLLLFPIYKLCEGFSGKVVSDDVKQRAEKVRQKIQDKLGTQNFVQVYNQMRNDLG
EKRFKRKQEEKLMAVINPVRNAKRKMGVSAKHQAHKKRKMMATKMGRWMR
NT seq
8073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtcggccaatgaagctcaggccgttaaatctctcaatactactcctggcctccgc
aaccgccgctttgtgttcaaatcatgtgctcaacaaatcgacgagctggaaatcaatgta
tttcgaaatctcgaaaccgtcaaggctaagccctcttctggctcttatttcttcttggat
tgtctaatacattggagggagttaaatacagccgaggatttcatttcgttatatgaagaa
ttgatgccccttgtacaaaccttgtctttggctctattacacaaggatatgataatcgca
agactcttgtctaggttgcaaatgaaagcgcggctttcactggaggctattttcaggttg
attgcggagttatcaagagatctaggtgaagagtttataccctttcttccgaggattatt
gagtcttacttgggtcttctcaaagataaagctgaccgagaaccagagattattgagcag
atgtttacctcgttgtcatatataatgatgtatttgcagaggtatctcacccaaaaagtt
gttcacattctcgaggttacagtcaaactaagatattatcccaaagattttgtccaggag
tttatggctaaagcgctgtcatttttgctgagaaatgcacctactccacaacttaaagaa
ggtgttagtaaaattctgcatgaagctgcaagaaaaccatctgaggccaaaaaatttgga
gctagtgcgttgctgtggcatattatgagaggaacatcatctaactttcattcacgtgca
tctcgagtgctggtcttattaacagatagtggcttcttaagtataggtgacaagtttaac
caaggttctgacactgttactgaaattgtgattgcgtctcttgaaagatgtatggagctg
gatgtcagtgagctgcagcttatatggaataacttgtatgaagctgttgctaattctcta
tctggcggatattctcaacatttatcctgcctgttatcagtgcttatatcaataatttct
gtcgatcatggccaaaaagttggtgactacaagcagatgcagaagctagtagatttgctc
atgtggaaatttattcttccatttagcagtggtgaaacaaagggactggtatctgaggct
gctgataagacttttcagctcctgttgtgcgttcttgatggtatttgcaataacaacaat
tcgactggtattcctgaacttgccttgcagtgggctcctgtctttcaattaaagagctca
agtttgcttacgctcttgaaagatttagtcatgaaggactatgctatacttgcgttccaa
agcaatattttaagtggttgtttgaatgtactggaaatagctaagggagaagctctacat
ttgatgctggcttattgtgaaagatttcaagctaaaacaggatgttttaatgttctagaa
ggaatgccaaaggaattggttgtaaagtccagatgtttttttcaagagacaatttgctac
tggataggagtgataaaaaatatgacgcacagggatacaataattgatgaagtagtagat
gaggacactttggctttactttggggaaccatttgttgcatcccttatttcttatctgtc
gaggggaatgagtatctgatgaatttggttgatgaggttgatcggcttttaataactgaa
acagattttgttgctggagttcccaaacgtatatggcagggcctaattggtgctgcttta
caaagttatcatggtgcaggaagacttgaaagatttgaacaagaacatacaagcaagatt
ttgcatctaggaaaaagttataaatcatcacagcaaatactgtctgctgtagcagagtat
ttggatttgaaatatggggagagtctccaaaaaaacaaaggtgtctcgataagacatcta
aagcttgaagcagcagatgggatggatgctttgaatgtattttcagagaacctatttcat
cctgacaaggaacttcgtgtttcgacccttaaaatattgtgtcattatgagcttttgaat
tatgaatcacaacagatggatgcagaagattcagaagaagatcacgttggcacccaatgc
tacaatgtatttaacctgcttcttactattgagcaaacacccatctcagttgccactggt
agaaaggtcactttgctagtttctagaatacggacttctctatctgctcctggggtaact
gaagcccatgtactgccagctttttatggcactatcgggcttctgtataaccaatacatg
gatttatcaaatgcagctttagagtgcctttctgctatgatcagcacatatcctgggctc
ttgtggaataagtttatctgctttttcgagcaatgccagaccatttctataaaggctcat
gggttagacaactccaacatgatagcatgtagcgataaaactgatttggtggaacatttc
cgttccttttgtagcacatcttctgatagatctggcttgtctataactcctttgctactc
caagccttacaaaggattccaaccgttaccgagtcacattctcgccaaatagttccatta
tttttgaaatttctgggctacagtgatgaaaacccgcggttggaatcgtttgattcacat
gcttgtgctggtaaggattggaaagttgtactcatggagtggcttaacctatttaagttg
atgaagaatcctaggtcattttactgcagtcaactattgaaagaagtcttggtgaatagg
ttgcttgataacaatgatgttgagatacaaataagggttttggattgtctcttaaattgg
aaggataggttcttgctcccttatgagaagcatctgaagaatcttgtcagttcaaaatgt
ttgagagaagaaattgctacttggagtttatccgaagactctaatttggttgaagaagag
cacagagcccaacttgtcccgttagttattcgattgctgatgccaaaagttagaagcctt
aagacacttgcctcaagaaagcatgcaagtgtaagcaatcgaaaggctgtgctgggattt
attgctgaattcactgttgctgagcttcctcttttctttcaactattgttgaagtctttg
caaattactgatcttggtaatgaagaaatagaaagttgtgcttgggtttcagagaaatgc
aatttggatgaatttgaattgccaactttattgaatttattctctgtggagagaatattg
gccattcccttgaaaaagagatttgggtttttgcacgtggttgaagagatttttagaatt
tttgatgcttcacgtgtcagcccatttctcgatcttctcttgggttgtgttgtccgtatt
ctcgacagctgtgcttcaagtattctgaatagaagtcctaagcaacctgctcaacttgat
ggttcgtccgatattaccttgcaagaaagtagaaaggaagctatgagccataccagctcg
gcggtcaagcaatttaaagatatgagatcattatgcctgaagatcatttcttccattctt
aataattacgaggaccatgattttggctctacattttgggatatattcttcaaggcagtg
aagcctttagtacatggattcaagcaggagggctcaagtagcgaaaagccaagctctttg
ttcttttgctttcttgcaatgagccagagtccgagacttgtttctcttttatgcagagaa
aagaacctaattccagatatcttttcaatcttatctgttccaacagcttctgaagccata
atttatagcgttctcaagttcactgagaaccttctaactgttaaagatgagcttgggatt
gatggatatgttattgatgacgttttttgttcaaaccttgatggtcttgttgacagcctg
caccatctatgtcactctttcactgagaaaaaaaggaagttgctcaaacatcctggggaa
actttgctgagagttctgaaattgctatcaaagttcataaacgatcaatcaggagcaaga
aagtttgtggatatcttgcttttgcttgcgtcagatggcataaaaaattctgatttgtgt
atggaagctttgcagatcctcagggatatagtttcagtattacgaagtgaagctaacact
aaaatcttgaaagctgtatctcccattcttatatctgctgaaaggggtgttcggtcgtca
atctgtaatcttttgggtgctcttgctgagaatgattcatccattcgctctatggttaat
ctcgtttgtgaattaaatgccaccacttctgcaatggaattggatgaccttgactttgat
attatcatcaacgcttatgacagaattacagcagattacttcttcggtgttagtgaggat
caagctatagtgatattatcccactgtatttatgacatcaaatctgatgagttaatttta
agacaatgtgcatataagtcactcctctcatttgtcgaattctctgcactaataattggg
gaagaagtaaagaaccaggatgttcctgcacgaacaatggcaattgatgacccttattgg
actgataatcacattcagcatattgtaaataaattccttttgaagcacatgggagatgca
atgactaaaataacaactatgcaaaaggaatggattgatttgttacatgagatggtcctg
aagctttcaggaattccaaatcttggaagtttaaaggtcctttgcagtgaagatgctgaa
gtagacttctttaacaacatcgttcatttacagaaacataggaaagccagagcattgtca
cgctttagaaatattgttgccactgggcagctttccgagttcatgttgaagaaagtgttc
atacccctttttttcagtatgttgtatgacttgcaagcaggaaagggggagcatattaga
agtgcttgtcttgatgccattgcttctatttctggtcaattgggatggaaatcatactat
gctttactaatgagatgtttcagggatatggaaaaaaagctcgatagggaaaaggtcctg
ttacgacttgtttgctctatacttgaccaatttcatttttctgagacctattcctcacct
gacctggtatttccaagaaatgatgtaacagaaaatgatcctgaagacaaaactaattca
gctactatacccaaaggtgccagctatatgttttctgcgacacaggcctgtcttactggt
actgtgcttccaaagttgcaaaaactgcttgtttctgatccacagaaagtgaatgttaat
attagtgttgccatcctaaaagttttaaagaaacttcctggtgacaccttggacactcat
ctttcaagtattattcatcgaatatcaaacttccttaaaaatcgtctgcaaagcattcgt
gatgaagccagatgtgctttggttgcatgtttgaaggaactcggatttgagtatcttaaa
cttgtagtcaaggctttgagtgcgacattgaaacgaggatttgagcttcatgttttggga
tatactattaacttcatcttgtcaaaaggccttccagatactgtaggtggtatgctagac
ttttgtttggatgagctgcttcgtgcagtagataatgacatttttagtgaggtagctgag
caaaaagaggtggaaaaggttgcttttaaaatgaaagagactagaaaacaaatgtctttt
gatacacttaggttgattgcccaaaatgtgactttcaaatcccatggtttgaagctgctc
tctccagtaactgcgcatatgcagaagcatttgacaccaaaagtaaaattaaaattggag
actatgttgactcacattgctgaaggatttgaaagaaactcctctgttgagcagattgat
ctctttatcttcatatatggcctaattgatgattggctttctgaggataaacgtagaaga
gaaactaagttagtgaaggggttaaaaatagaaaaacatcttgaggcaagtagtaatatt
gttatgaaatgttatgttgggactgaaccacagtgctcatatcttattgcagtctttgct
cttcgacttctccacaatcgtttgagaaatattaaacttcacaagggtgatgatcatctg
atctctctgttggatccctttataaagcttctgacatcttgcctgagttctaagtatgaa
gagatagtagatgttgccctcaagtgtatattccctttgacaaggctgcctcttccctcc
ttggaatctcaagctgacatgataaaagtgacgttattgggcattgcgcaaagtacatct
aatgtaaatagtcctgtaatgcagtcctgtttaaaattattgattgccctgctacagagc
accaaaattaccctttcagctgatcaattgcatgtattgatcaggtttcctctttttgtt
gaccttgaaaaaaacccctcttttgttgccttgacacttttaaaggcaattgtgcggcgc
aaacttgttgtccttgaaatatatgatctgatggatcaagttgcaaaattaatggtaacc
agtcaagaggaagctttccgcagaaaatgcagtcaaatattgttacaattcttgcttaac
tatcaactttctcagaaacgaaggcaggagcatcttgatttccttgtgattcatctaagg
tatgaacatgccactgggagatcagctgtgttggatatgcttaagacaattattaagagg
tttccggagagcgtaatttgtgagcagtcaacgattttttttctcactttggttcgtgct
ttggccaacgatcctgataatcaagttcgctccttaattggcattgttataaagcatctt
cttggccgcataaactcacaaccactcgagtccattttaaatatgtgtcttacttggtat
ttgggggagcaacaacagctacggagcctatcatttcaggcccttggatttgttgttgaa
gtgatgaagagaggatttcggaagcacataaatgatgtgctgcctgttatgaaaatgacc
gtgcagtctgctattgatgtgttgaatggtgggcagctaaatctgtcagatccggaaaca
attcccttttggaaggatgcatattattcttttgttttgttggagaaaattcttacacag
attccagaattattctttgttggggatattgaagatatatggcaggcagtctctgagctt
cttgtgcatccacacccatggatttgtaacatatccagccgtcttgttgcattgtacttt
gaacaaatggtaaagaaagggggtaaaatcggaacaacttgccttacaagcacgagtagg
atgttcctgattgcttcatctctatgcagtcgattaaaggttcaactccctgataaaggt
gtaagaagaattgttaaatgcaatcttgcatttgcaatctgtggtatacagtctctgttg
cgtcaaacagaatttcaggatccctgtacattttggtcctccctaggttcacgcgatcaa
ggatgttttcttaaagcttgtcagttgcttgatacaaaaagtggaaggaatatcacagaa
gtgttcacttgtggatttgatgacgataattttgatcagaaaattgataatcttagttct
ttgctcgtgtctggtttactaaacacaatgggaaaaactgcccttcaaactgaggatact
cagacgaagatgattcttggtagttttagactggtggctgagcagaccactcaagaagat
tgcctgcagtatgcctatttgttgttgttcccaatttacaaactttgcgaggggttttct
ggaaaagtagtttcagatgatgtaaagcaacgtgcagaaaaagttcgtcaaaagatacag
gacaaacttggtacacagaacttcgtacaagtttacaaccagatgaggaatgatcttgga
gaaaaaaggttcaagaggaagcaagaggagaagctcatggctgttattaatcctgtcaga
aatgccaagaggaaaatgggggtttctgccaagcatcaagcccataagaagagaaaaatg
atggctaccaagatgggtagatggatgcgctag
DBGET
integrated database retrieval system
