KEGG   Capsella rubella (pink shepherd's-purse): 111829377
Entry
111829377         CDS       T02984                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, A2/B1 homolog
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
crb  Capsella rubella (pink shepherd's-purse)
Pathway
crb03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:crb00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    111829377
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:crb03019]
    111829377
   03041 Spliceosome [BR:crb03041]
    111829377
Messenger RNA biogenesis [BR:crb03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     111829377
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     111829377
Spliceosome [BR:crb03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    111829377
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 RRM_Nup35 SF3a60_bindingd
Other DBs
NCBI-GeneID: 111829377
NCBI-ProteinID: XP_023634128
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 422 aa
MDPYVTETVLEDEIQDAKPSEDVEDDDDKSQPHSGGGVDSAGKIFVGGLARETTSAEFVK
HFGKYGEITDSVIMKDRKTGQPRGFGFVTYADVSVVDKVMEDNHIIIGKQVEIKRTIPRG
SMSTNDFKTKKIFVGGIPSSVDDDEFKEFFMQFGELKEHQIMRDHSTGRSRGFGFVTYES
EDMVDHLLAKGNRIELSGTQVEIKKAEPKKPNSVTTPSKRFGDSRSNFGGGYGDGYGGGH
GGGYGGPGPYKSGGGSYGGGRSGGYGGYGGEFGGYGGGGYGGGVGPYREPALGYSGRYGG
GGGGGYNRGGYGMGGGGGYGGGPGDMYGGPYGEPGGGYGGPSGSYGGGYGSSGIGGYGSG
MGGAGGGGYRGGGGYDMGGLGGGGGGGYGGGGSGGGSFYGGGGGGSRGGYGGGSGRYHPY
GR
NT seq 1269 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatccttatgtaacggaaacagtcctcgaagatgaaatccaggatgctaaaccatcc
gaagatgttgaagacgatgacgacaaatctcagcctcactctggtggtggcgtcgatagt
gctggaaagatatttgttggaggtttagccagggagacaacttcagctgaattcgtcaag
cattttgggaaatatggagagattactgattctgtgattatgaaggataggaagactgga
cagccccgtgggtttgggtttgtgacatatgctgatgtctctgtggtcgacaaagttatg
gaggacaatcacattatcattgggaagcaggttgagattaagcggacaataccaagagga
tccatgagcactaacgatttcaaaaccaagaagatatttgttggtggaatcccttcatct
gtggatgatgatgagttcaaggaattttttatgcaatttggagagctcaaggaacatcag
attatgcgtgatcactcaactggaaggtcacgtggttttgggtttgttacgtatgaaagt
gaagatatggttgaccatctcttggcgaaagggaacagaattgagctctcagggactcag
gttgagataaagaaggcagagccaaaaaaaccaaactcagttacaaccccgtcaaagcgg
tttggtgactctcgctctaactttggtggaggttatggagatggttatggtggtggacac
ggtgggggatatggtggtccaggtccttacaaatcaggtggtggcagttatggaggtggc
cggtctggtggttatggaggttatggaggagaatttggtgggtacggcggcggtggatac
ggtggtggcgtgggaccttatagagaaccagcacttggatattctggtcgatatggagga
ggaggaggtggtggttacaacagagggggttacggtatgggaggagggggtgggtatggt
ggtggaccgggcgatatgtatggtgggccatatggtgaacctggtggtggttatggtgga
ccaagtggcagttatggaggcggttatggtagtagcggtattggtggatatggtagtgga
atgggtggtgctggtggcggaggctatagaggtggcggcggctatgacatgggtggactt
ggagggggaggcggaggaggttatggaggtggcggaagtggaggaggctcgttttatgga
ggaggaggtggaggaagtagaggcggatatggaggaggcagcggaaggtaccatccttat
ggaaggtag

DBGET integrated database retrieval system