Chryseobacterium rhizoplanae: KB553_06150
Help
Entry
KB553_06150 CDS
T08349
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
crhi
Chryseobacterium rhizoplanae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCA61109
LinkDB
All DBs
Position
complement(1344227..1347082)
Genome browser
AA seq
951 aa
AA seq
DB search
MKQSNLKYPCLIAVLYFGMNVNAQVTKDSAKVQKIDEVVMIGYGSRKKVDNTTSISSISA
EEVTKTKVLNASQAIQGKAAGVQVVASDMPGSTPTVTIRGLGTVLGGRTPLYVVDGMYVN
NINNINTNDILTYDILKDAAALAIYGNRAANGVIIITTKTGKGKLNVTYDGLIGVRTPLK
TVKMANSQQFVPYNNIGLAAEKKGLLNPDQPYNTNWFKEITRTGIYNQHNVAISGSSDAV
KYFLSFSNYDEQSILKGTDYNRTTVRTNNEYKISKGIRLSQNLSVTFTHDTPKSLGVFTT
AYKQSPLVPVYYPNGQWGQPIYDAQGNISYTGGRFNNVGNPVQQLFFDNQNGKSFILQGG
LKLDVDIINGLRFTSQFNGEYGTSKYYNFTDSRAIWLASDPMRTIAQYSSTDPINRLMNK
NIDYFNWVLSNYFTYTKKIDNHDFEIVAGTEASVNSGLSTLIMNRKDLPAQADYWNTSNT
DYYGYLFSDDKTKALESIQGDKNTTISYFGRLQYKFMNRYLLSATVRRDGSSQFADGHKW
GTFPSFGAGWIISEEDFMKNSFFKTLKLRGGWGRIANQKVPLNYLPLLSGATYNYGFGAS
AVSNGVTVNKGYDPELGWEVTDEASVGLDFGLFNNRLTGTFDLYNRETKNIILAVKPYMT
TGISEDNYSHMGSVVNKGTEISLNWADKIGQDFTYSIGANYSYNKNELTSMNTSKPVSQV
VGGGLGNGQDTKYFNAQTVGNPLGSFFLWEFDGYDANGNMKFKDLNGNGVTGSADAGDRR
FVGSYIPKSTLGINISMTYKNWDFALNGYGAFGFSVYNGKKAQRISGENIEASVADNYWT
AYNTNASNPAPNTKIPIASTFFLEKGDYFRINNISVGYTFKNITDYFKSVKLYVSAINPV
VFQKYSGYTSELSGYNPADPTAEGNPYKGAGVELDNYPTLRSFVFGVNLNF
NT seq
2856 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaagtaatttaaagtatccatgtctcatcgctgttttatacttcgggatgaac
gtgaatgcacaggttacaaaagattctgccaaagttcagaagattgacgaggtagtcatg
atcggatatggtagccgtaagaaagtggataatacaacatccatcagctccatcagtgca
gaagaagtaaccaaaaccaaagttttgaatgcctcccaggctattcaggggaaagcagca
ggggtgcaggttgtagcttctgatatgccagggtctacgcctacagtaactattagggga
ttgggaactgtattaggaggaagaacaccattgtatgttgtggatggaatgtatgtaaat
aatattaataatatcaatacaaatgatattttaacttatgacattcttaaagatgctgct
gctctagcaatttatggtaatagagctgcgaacggtgttattattattactacgaagaca
gggaaaggaaaacttaatgtaacttatgacggcttaataggagttagaactcctttgaaa
actgtaaaaatggcgaatagccaacagtttgttccttataacaatattgggctagctgca
gaaaaaaaaggacttttaaatccagatcagccatataatacaaattggtttaaagaaata
acaagaacaggtatttataatcagcataatgtggccatttcaggatcttctgatgctgtg
aaatacttcttaagttttagtaattatgatgaacagtcaattcttaaaggaacagattat
aatagaactacagtaagaacaaataatgaatataaaatttctaaagggatccgtttatca
cagaatctaagtgtgacgtttactcatgataccccaaaatctttaggtgtttttacaaca
gcttacaaacagtctcctttggttcctgtatattatccaaacggacagtgggggcaacct
atttatgatgctcaaggaaatatcagctatacgggggggcgttttaataacgtaggaaat
cctgtgcaacaactgttctttgataatcagaatggaaaaagctttattcttcaaggtggt
ctaaaactagatgttgatattataaatgggctgaggtttacttctcaatttaatggagaa
tatggaacttctaaatattataatttcacagatagcagagccatatggttggcaagtgat
cctatgagaacaattgctcagtattcatctacagatccgattaataggctgatgaacaag
aatattgactattttaattgggtgttaagtaattattttacatatactaagaagatcgat
aatcatgattttgagatcgtagctggtactgaagcttctgtaaatagtggattgagtaca
ttgattatgaacaggaaagatcttccagcccaagcagattattggaatacttcaaatacg
gattactatggctatctatttagtgatgataaaactaaagcactagagtctattcaagga
gataaaaatactaccatctcatatttcggaagattacagtacaaatttatgaatcgctat
cttttaagtgctacagtaaggcgtgatggatcttctcagtttgctgatggtcacaaatgg
ggtacatttccttctttcggagccggatggattatttcagaagaagattttatgaaaaat
agctttttcaagactttgaaattacgaggtggatggggtaggattgcaaaccaaaaagtt
ccacttaattatttacctctattatccggagctacatataattatggttttggagcttct
gcagtaagtaatggagttacagtaaataaaggttatgatcctgaattaggttgggaggtt
actgatgaagcatctgtgggattggattttggcttattcaataatagattgacaggtaca
ttcgacctttataatagagaaaccaaaaatattattcttgcagttaaaccttatatgaca
acaggtatttctgaggataattattctcacatgggaagtgttgttaataaaggaactgag
attagtcttaactgggctgataagattggtcaagatttcacttattcaattggagccaat
tattcatacaataaaaatgagcttacaagtatgaatacttctaagccagtatctcaggtt
gtaggtggaggtttaggaaatggacaggatactaaatattttaatgcacagactgtaggc
aatcctttaggaagtttcttcctatgggagtttgatggatatgatgctaacggaaatatg
aaatttaaagatctgaatggaaatggagttactggaagtgcggatgctggtgacagacgt
tttgtgggatcatatatcccaaaatctactttaggtattaatatttcaatgacttataaa
aactgggattttgctctgaacggttatggagcatttggttttagtgtatataatggtaaa
aaggcgcagaggatcagtggtgaaaatattgaagcttcagtagctgataattactggact
gcttataatacaaatgcttctaatcctgcaccaaatactaaaattcctattgcctcaacc
ttctttttagaaaaaggagattattttagaatcaataatatctcagtaggatatacattt
aaaaatataaccgattattttaaatccgtgaagctatatgtaagtgcaattaatccggta
gtatttcaaaagtactcaggatatacttctgaattgtcaggatataacccagcagatcct
acagctgaaggaaatccttataaaggagcaggagttgaattagataattaccctacttta
agatcttttgtatttggtgtaaacctaaacttttag
DBGET
integrated database retrieval system
