Candidatus Carsonella ruddii DC: CRDC_00205
Help
Entry
CRDC_00205 CDS
T02774
Name
(GenBank) selenocysteine lyase/cysteine desulfurase
KO
K11717
cysteine desulfurase / selenocysteine lyase [EC:
2.8.1.7
4.4.1.16
]
Organism
cri
Candidatus Carsonella ruddii DC
Pathway
cri00450
Selenocompound metabolism
cri01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cri00001
]
09100 Metabolism
09106 Metabolism of other amino acids
00450 Selenocompound metabolism
CRDC_00205
Enzymes [BR:
cri01000
]
2. Transferases
2.8 Transferring sulfur-containing groups
2.8.1 Sulfurtransferases
2.8.1.7 cysteine desulfurase
CRDC_00205
4. Lyases
4.4 Carbon-sulfur lyases
4.4.1 Carbon-sulfur lyases (only sub-subclass identified to date)
4.4.1.16 selenocysteine lyase
CRDC_00205
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_5
Cys_Met_Meta_PP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGS06529
LinkDB
All DBs
Position
35100..36245
Genome browser
AA seq
381 aa
AA seq
DB search
MFLFLKRFKKYIYFDNSSTNQKPKILYKSTINTIQKKNFNLNRGEYNFSNKNDILFKKLK
FLFKKLIKINFIEEIFFFYNSTFSINFIIINLINFLKNTNEILISKTEHNSVLIPLLKLT
KNKKIVIIICPIIKLLIFKNIFCNYINNNTIIFAISHISNNYGIIVKIKNLLNICRYNNI
LSIVDSTQSISYINTNLKKINSDFLFFSFHKLYSLTGVSVLYCNINFINKLNPYFLGGGS
SILKKYTLKLKKLDEKFYFGTQNIFSLFSSYYSIKWFIKNKKYIFCINYFLKKNLFYFLK
KRNKNCVNTILICSKNGFFFNYYLNLNKIILRCDKLCNYMKNMFINKKNNCRLSLNFFNK
IKETFKIKFLIHFFNFKIRNY
NT seq
1146 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttatttttaaaaagatttaaaaaatatatttacttcgataattcatccactaat
caaaaaccaaaaattctttataaatctactataaatactattcaaaaaaaaaattttaat
ttaaatagaggagaatataatttttcgaataaaaacgatattttatttaaaaaattaaaa
tttttatttaaaaaattaataaaaattaattttatagaagaaattttttttttttataat
tcaacattttcaataaactttataattataaatttaataaattttttaaaaaacacaaat
gagattttaatatcaaaaactgaacataattcagtcttaattccattattaaaattaact
aaaaataaaaaaattgtaataataatttgtccaattattaaattattaatttttaaaaat
attttttgtaattatattaataataatactataatttttgcaataagtcatatttctaat
aattatggaattattgtaaagataaaaaatttattaaatatttgtagatataataatatt
ttatctattgtcgattcaactcaatcaatatcatatatcaatactaatttaaaaaaaatc
aattctgattttctctttttttcttttcataaattgtattcattaacaggagtatcggtt
ttatattgtaatataaattttattaataaattaaatccatattttttaggaggaggttct
tctattcttaaaaaatatactttaaagttgaaaaaattagatgaaaaattttattttgga
acacaaaatattttttctttattttcaagttattattctataaaatggtttataaaaaat
aaaaaatatattttttgcataaattattttttaaaaaaaaatttattttattttttgaaa
aaacgtaataaaaattgtgtaaatactattttaatatgttctaaaaacggattttttttt
aattattatttaaatttaaataaaattatattaagatgcgataaattgtgtaattatatg
aaaaatatgtttataaacaaaaaaaataattgtagattatcattaaatttttttaataaa
attaaagaaacttttaaaattaaatttttaatacatttttttaattttaagattagaaat
tattaa
DBGET
integrated database retrieval system