Chroicocephalus ridibundus (black-headed gull): 134526149
Help
Entry
134526149 CDS
T10910
Symbol
HNRNPM
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M isoform X1
KO
K12887
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M
Organism
crid Chroicocephalus ridibundus (black-headed gull)
Pathway
crid03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
crid00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
134526149 (HNRNPM)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
crid03041
]
134526149 (HNRNPM)
Spliceosome [BR:
crid03041
]
Common components
Common spliceosomal components
hnRNP proteins
134526149 (HNRNPM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_MARF1
RRM_5
Collagen_mid
RRM_3
RBD_DEAH11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
134526149
NCBI-ProteinID:
XP_063213738
LinkDB
All DBs
Position
22:4630678..4644289
Genome browser
AA seq
619 aa
AA seq
DB search
MEESMKKAAEVLNKHSLGGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKVMAAAGGMGIGPGPGGPGMIN
IPPSILNNPNIPNEIIHALQAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGVVVRADILED
KDGKSRGIGTVTFEQAIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERAFPKGDFFPPERPQQLP
HGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGMGMGNMGPGGMGMEGMGFGMNKMGGMEGPFGGMEN
IGRFPAGMNMGRMSEMDRAMGGGFEREFGRNEMGMSRSFGETLERGIGGGNASIPGIERM
APGIDRMGSGIERIPSGMGHGMERVGSEIDRMGLVLDRMSSNVERMGSGIDRMAPLGIDH
IAPNIERMGPAIERMGSGIERMGSGIGFGIERMGAAIDRVGTTMDRMGSGVERMGSGMDR
MGIGMERMVPAGMGTGMGQVIERMPAGLDRIGATPMERIGIDRMGAAGMERMGLERIGAT
NMERMGPAMGQGMGAGIDRMGLAMGSNFERTMDMERGNFAGNFAGSLGGTGGPAAGVARK
ACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVRFESPEVAERACRM
MNGIQLRGREIDVRIDRNA
NT seq
1860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaaagcatgaaaaaggctgcagaggttttgaacaagcatagtcttggtggaaga
ccattgaaagtgaaagaagatcccgacggcgagcatgccaggagagcaatgcagaaggtg
atggcagcagctggtggaatgggtattggtccaggcccaggcggccccggcatgatcaat
atcccacccagtatactcaacaatcccaacatacccaacgagatcattcatgccctacag
gcagggagacttggaagcactgtctttgttgcaaatttggattacaaggttggttggaag
aaactgaaagaagtattcagcatggctggcgtcgtggttcgggctgacattctagaagat
aaagatggcaaaagtcgtgggatcggcaccgtcacttttgagcaagctatagaggctgtt
caggctatatcgatgtttaatgggcagctgctgtttgacagaccgatgcatgtaaaaatg
gatgaacgagcctttcccaaaggagacttctttcctccagagcgaccccaacaacttcct
catggtcttggtggtattggcatgggattaggacctggaggtcaacctattgatgcaaat
catttaaacaaaggcatgggaatgggcaacatgggacctggaggaatgggaatggaaggc
atgggctttggaatgaataaaatgggaggaatggaaggtcctttcggtggcatggaaaac
attggtcgcttcccagctggaatgaacatgggcagaatgagtgagatggatcgtgccatg
ggtggaggatttgaaagagaatttggaagaaatgaaatgggaatgtctcgtagttttgga
gagaccttggagagaggaataggtggtggaaatgccagcattcctgggattgagaggatg
gcacctggcattgatcgtatgggctcgggaatagaaagaataccttctgggatggggcat
gggatggagagagtagggtcagaaatagacaggatggggctcgttttggatcgcatgagt
tccaatgtggagcgaatgggttcaggaattgaccgaatggcccctctgggcatagatcac
atcgctcctaacatcgagaggatgggcccagctatcgagagaatggggtctggcatagag
aggatggggtctggcataggctttggtattgagagaatgggtgctgccatcgaccgcgtc
ggcaccactatggacagaatgggatcaggtgtagaacgtatgggttctggcatggatagg
atgggtatagggatggagcgtatggtccctgctggaatgggaactggaatgggtcaggtg
atagagagaatgccagctggtttggatcgcataggtgccactcctatggaaagaatagga
atagatcgtatgggtgctgctggcatggagagaatgggcttggagcgcattggagccact
aatatggagagaatgggtcctgctatgggacagggcatgggagcaggcatagatcgaatg
ggacttgcaatgggaagcaattttgaaagaacaatggacatggaacgtggaaactttgca
ggcaattttgcaggctcccttggaggaactggaggacctgcagctggggtggccagaaaa
gcctgtcagatatttgtgagaaacctgccttttgattttacatggaaaatgctgaaagat
aaatttaatgaatgtggtcatgtgctgtatgctgatatcaagatggagaatgggaagtca
aaaggctgtggtgtggttagatttgagtccccagaagtagctgagcgagcctgccgtatg
atgaatgggatacagctccgtgggagggagattgatgtgcgaattgatagaaatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
