Carnobacterium sp. 17-4: CAR_c15180 Help Entry CAR_c15180        CDS       T01452                                  Name (GenBank) collagen adhesion protein Organism crn  Carnobacterium sp. 17-4 SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  FctA Collagen_bind SpaA SdrD_B Big_8 Cna_B Gram_pos_anchor CarboxypepD_reg DUF5859 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AEB30177 UniProt:  F4BSA7 LinkDB All DBs Position complement(1559476..1569378) Genome browser AA seq 3300 aa AA seqDB search MLVTMMLLSTILTPQTVYAIGTAADEFAETSSDEAGSDTEAEDSVSGAEDPAGESEAVEL TDSSTEDEPIEDEKTALEDEPVVDEGLDTPKGESPPVETVPSEETVPSEEIEDAGSTIEP ATEAKTFAVAPRTAVEENLITSFEFTLNPGLANEKVVENGGSETVDINEMNAVLLDYVFI KPDDFIIAAGDTYTITLPEIFIGVEKKDQPITMSDGETVATYNIVGSQLVITFNELANNY DNVGMHVNLSAEFNKEIFETQEEFVVSVPYADGTSFEATIKANQQQYVGTDKKTAGAPYL LNADGTHQATDKNPTHVDWTVRVNDSAESFDKATIIDDLGDNLEIVEGSFVVEKIIRNYK NVETGREPVTDFTVTNTGNGFDLNLGDIEDAYEITYTTKLKRPDGGGSLTINNNARITLD GTETAVKDEIDVTWSSNIPEITKSGVLADSNTINWTVGYNYGKEDLGIVTLTDALSKGEI DLNSVEIYEVDTDIDGKVTSVSKEPVTITPVFDNDGNVQFPGLDADGKAYRIEFSSSVPV GLNESILNTITDNLELPNSANASVPVNTVPTGGKVGAQGVDGEGRPYIDWTVTMNSTKVD VPTINVKDVFSPLHLEFDVTDESLYTLTKDGETVENFDIKYYEHTDGRTGFELNINNAGT HEYKFVYRTYYTELGMKETEVANQAELVFEDGKGVGIGDIIRPDIGVEGPNAGITKSGKY VTNTAKTEQEIEWTINFNESKILLNADSTITDTFTSGNYDLITNSLSIKNTETNQILAVG TDYTLTSDTAGFVITLIKPTSAKLQITYRTTADDKSNKAQKNDVVLKWLGGEEPATATVG KRESDVSKAAKVNTDASGNKTIDWTVTFNKSKNVIYDFELVDTYVPATATISNIQVFKDG TKMTADAYSLIDPVNGVFTLGIDQLDAVPYTVTYTTSLSPEDERGLVRNEAAITYKGGDK KTGFTVPKPTLGVKKEAVGKVVQNEDSDLINWKTTANTDTANHYVNLVGAVLTDIIPSDQ RLIANTIKVVRVDNNKDVTDSVIIDKTDNTFSINLPDGPYQYIVTYQTEILEYPSANTKL DRYTNTTTLANTGHTPVSANAYIDFFVGGTNNNSTKTGLQNEDTENIDWTVTLNPLGLTI NNALITDKLDAQQTYVAGSIIITDQLGVVIPGATVTVADDNRSFEITFAGGTLNQPVKVT YSTRLNETMIGKYTVKNNIQILGGTEQTALHSVTTATTSSQWSFGGGGEGRTVTFTLNKQ HPNGTKIPDATFKLVRVKMNGSLVENQDISGTTVNGVFEITGARAGRYIVTEESVPEAYE KLTEPIYIIIGYASPEEKAAGAGEYIVQVTDSEWSPLVSDVASVNPDISNALIVNNDVKK GSITATKNWIGGSSSRPTVHFQLYRQIENGEAELVPEAELKTLTAGTTEVKWDKIDQYTA SGEKYVFSVKEVDAAGKDFTPAGYIKDEDGLTVYNTAINPAFDFTKNISGRTLKDKEFKF NLYGVDKKIAASANNDAQGKVTMSPTLTAEQLSTLKATGSVKVAYTLSEEKGSLGGVTYD TKELSVELTVTYDKTNHSYKAEFAYPDGTAIFNNEYATTNVSASLTASKTLTGGQTLTAG QFDFELVEDGKVIDTKSNNESGAVTFAAIDYSKTGTYSYKIREKIGIQGQDGIKYDTKEF NVDVVVTDDGAGKLVATSVYRDGPAAFTNEYVTTPDTVVIQGTKALSNKALLEGQFKFEL HDSEGGLVDTAYNSANGQINFKALTYTKAGDYKYTVREVAGSQTGYTYDETVFDVTVQVT DDKKGKLTASVQDIDGPIIFENAYQPNSDSVVITAAKELEGKVLVENQFEFILRDEDGTE IGKQKNNADGSINFAEIPYTVAGTYNYTIEEVDSEQNGIAYDTTPRKVVVKVYDVEGELE AKVEYVGGPVVFKNTYTAKPDSVVFEASKLLDGQIIRDGQFKFDLIDKSTDKVIQTVSNN AEGKIYFDEISYDTVGNYNYTIREVEGVQGGMAYDKEEFSVNVVVADDGEGQLTATETYS DGPAAFKNTYTTDPDTVVLEASKVLEGQILRNKQFIFELVDSTNQVIQTATNNANGQVLF NEISYTKVEEQTYTIREAKGSQLGVTYATNEITVKVTVTDNGEGKLTAKAVYDKPAVFTN SYTPEPSKVVIEAKKVLEGQELVNGQFSYQLVDESGDTVQTATNNADGQVIFDEINYKAV GKYTYIIREVQGIQGGMTYDDDTYAVVVDVADVEGQLVSTANYISGPATFTNTYKADPNS VVLEASKLLEGQTLVKDQFTFELLNDKGESIQTKKNNENGQVIFDEMSYSKVGTHTYTIR EVAGTQGGVEYDLSVFNVTVEVVDGREGQLIATESYSTGPAVFTNKYTTAPDKVVIEAEK VLEGQNLVAGQFEFELVNTDGDILQTVENNANGQIIFNEIIYSEADEHTYTIREVKGVQG GMAYDTTEFEVTVSVKDDGEGQLTATLDKGKTPLVFTNNYTAAADSVVFEAEKALDGQIL VAGQFEFELVDIDGNVLQTVENNTNGQIIFDQISYNETGKHTYTIREVKGTQGGVTYDTT KYEVVVTVTDDKEGNLHAEVVYSDENVVFTNSYSANDGVATIEASKELDGQKLRAEQFEF NLLNENKEVIQTVKNDSEGNISFTELTYTEPGEHVYFIEEVNDKLGGVTYDDIRYTATVK VTDNGNGQLETVIKYNEEPLFTNHYAAAPDSVDLSAKKILEGQKLVADQFAFELVNAKGD TLQTVKNDEAGQVDFDEITYTEIGEHTYTIREVKEDLGGVTYDGTSFVVNVIVTDNGEGQ LIATQRYVDGPAVFTNTYTTEPGSVIFEADKQLNGQKLSDGQFEFELVNSAEEVIQKVTN DATGQIIFDEIKYDKVGDHTYTIREVKGDQGGVTYDSAEFKVDVTVIDDKEGNLHAEIVY SDENVVFTNSYSANDGVATIEASKKLEGQKLRADQFEFNLLNENKEVIQTVSNNATGQII FDEISYAKVGKYTYTIREVKGNQKYITYDATDYTVIVDVIDDSEGNLVTTVTYTNGSANF TNKYVPAKVSVGDYVWFDKNKDGLRDKTDVPLKGVVLTITDKDGNPVTDVYGNLVGATTT DKNGFYIFKNLPINKEYRVFIDRVASAKVLEGYVPTIEVGDDNSIDSSTWEVASRLLTKD GEHDPTLDFGFVLSSPVVPVDPEEPGETAETTEPKYPLDPTEPVEQEDPTESKDPSNSAG PTDPLESTDPVETKNSEEENLPKTGEAATYTGLAAVLLLAGVSLFYYERKSAKEKLISKR NT seq 9903 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt gtgcttgtaacaatgatgttattaagtacgattttaactccacaaacggtctatgctata ggaacagctgcggatgaatttgcagagacaagttcagatgaagctggatctgacacagag gcagaagacagtgtaagtggtgcagaagacccagcaggagaaagtgaagccgttgagtta actgactcgtctactgaagacgaacctattgaagatgaaaaaacagctctagaagatgag cctgtagtagatgaaggattagatacgccaaaaggtgaaagcccacctgtggaaactgtt ccttcagaagaaactgttccttctgaagaaatagaagacgcaggaagtactatagaacca gctacagaagctaagacattcgctgtggcaccacgtactgcagtagaggaaaacctaata acatcatttgagtttactcttaatcctggtcttgctaatgaaaaagttgtagaaaatggt ggatctgaaacagtagatataaatgaaatgaatgctgttctcctagattatgtatttatt aagccagatgattttattattgcagcaggcgatacttatacaattactttacctgaaatt tttattggagttgaaaaaaaagatcaacctattactatgagtgatggagagacagtcgca acatataatattgtaggtagtcagttagttattacatttaatgaattagctaataattat gataatgttggaatgcatgtaaatttatcagcggaatttaataaagaaatatttgagaca caagaagaatttgttgtgtctgttccgtatgcggatggcacttcatttgaagcgacaatt aaagctaaccaacaacaatatgtgggaacagataaaaaaactgccggtgctccttaccta ttaaatgcggatggtacccatcaagcaacagataaaaatcctactcatgttgattggaca gtaagagttaatgattctgctgagagctttgacaaggcgacgattatcgatgatttaggg gataatttagaaatcgttgaaggcagcttcgtagtagaaaaaattattcgtaattataaa aatgtcgaaactggtcgtgaaccagttactgattttacagtaacaaatacgggaaatggt tttgatcttaacctaggtgacattgaagatgcctatgaaataacgtatacgacaaaatta aaacgtcctgatggtggtggctcgcttactatcaataataatgctcgtattactttagat ggcaccgagacagcagtaaaagatgaaattgacgttacttggtcaagtaatatacctgaa attactaagagtggagtacttgctgatagtaatacgataaactggactgtagggtacaac tatggaaaggaagacctgggaatagtgactttaacagatgcactttctaaaggtgaaatt gatttaaactcagttgaaatttatgaagtggacacagatattgatgggaaagttacgtca gtatcaaaagaacctgtcacaataacgccagtatttgataacgatggcaatgttcaattt cctggtcttgatgcagacggaaaagcgtatcgaattgagttttcttcatcagtaccagta ggtcttaatgaaagtatccttaatacaatcacagacaatttagaactacctaactcggca aatgcatctgtcccagttaacacggttcctacaggtggtaaggtaggagcgcaaggtgtt gatggtgaaggtcgtccatatattgactggacggttacaatgaatagtactaaagttgat gtacctactatcaatgtaaaagacgtttttagtccactgcatctagaatttgatgttact gatgagtctttatatactttaactaaagatggagaaacggtagaaaactttgatataaaa tattacgaacatactgatggtcgtactggttttgaattaaatatcaataacgctggaacc catgaatataaattcgtttacagaacttattacacagaacttggtatgaaggagactgaa gttgccaatcaagctgagctagtctttgaagacggtaaaggtgtggggattggtgatata atcagacctgacataggagtagaaggtccaaacgctggaattaccaaatccgggaaatat gttaccaatactgctaaaacagaacaagaaattgaatggacaattaattttaatgaaagt aaaattttattaaatgcagattcaacaattacagatacgtttacatctggtaactatgat ctaattacaaactctctttctattaaaaataccgaaactaatcaaatattagcagtagga actgattatacattaactagtgacacagctggctttgtaataacgcttatcaaaccgacg agtgctaaattacagattacctatcgcacaacagcggatgataaaagtaacaaggctcaa aaaaatgacgttgttttaaaatggctaggtggcgaagaaccagctacagctacagtggga aaacgtgaatcagacgtttctaaagcagctaaagtaaacacggatgcttcaggtaacaag acgatcgattggaccgttacttttaacaaatcaaaaaatgttatctatgattttgagtta gtagatacttatgtgcctgcaactgcaacaatcagcaatattcaagtatttaaagacggt acaaaaatgacagctgatgcgtacagcttaatagatccagtcaatggtgtttttacactt gggattgatcaattagacgctgttccatatacagttacttacacgacctcactgtcacca gaagatgagcgaggattagtgagaaatgaagcagcaatcacttataaaggcggagataag aaaacaggattcactgttccaaaaccaacattaggtgttaaaaaagaagcagttggtaaa gttgttcaaaatgaagattcagatcttataaactggaaaactacagcaaatacagatact gctaatcattatgttaacttagtcggtgctgtgttgacggatattattccttcagaccaa cgactgattgcaaatacaattaaagttgttcgtgttgataacaataaagatgttacagat tctgtgatcattgataaaacggacaatacgttcagtattaatttaccggatggtccttat cagtatatcgtgacttatcaaacagaaatattagagtatccgtctgctaacacaaagcta gatagatatacaaatacgacaacgttagctaataccggtcatactccagtatcagctaat gcatatatcgatttttttgtaggtggtacaaataataacagtactaaaacaggtcttcaa aatgaggatactgaaaatatcgattggaccgttacgttaaacccattaggattaaccatt aataacgcattaattacagacaaattagatgctcaacaaacatatgttgcaggtagcatc ataatcactgaccaattaggtgttgtgatacctggagcaactgtaactgttgctgacgat aatcgtagctttgagattacctttgctggtggtacgttaaatcaaccagtaaaggttact tattcaacccgattgaatgaaaccatgattggtaaatatacggtcaaaaacaatatccaa attctcggcggtactgaacaaacagcattacactcagtaacaacagctacaacatcaagc caatggtcatttggtggtggtggagaaggtcgtacggttacttttacgcttaataagcaa catccaaatggaacaaaaattcctgatgcaacatttaaattggtacgtgtaaaaatgaat ggctctctagtagagaatcaggacatttcaggaactactgtaaatggtgtttttgaaata acaggtgctagagcaggtcgctatattgtgaccgaagaaagtgttccagaagcttatgag aaactaaccgaaccaatttatattattattggttacgcatctcctgaagaaaaagcagct ggagctggggagtatatcgtgcaagtaacggattctgaatggagtccactggttagtgat gttgcatcagttaacccagatattagcaatgccttaattgttaataatgatgtgaaaaaa ggctctattactgcaactaaaaactggatcggtgggtcaagtagtagaccgacagttcat ttccaactttatcgtcaaattgagaacggtgaagcagaactagttcctgaagcagaacta aaaacattaactgcgggtactactgaagttaaatgggacaagattgatcaatatacagct agtggagaaaaatatgtgttctctgttaaggaagtagatgcggcgggtaaagattttaca ccagctggttatattaaagatgaagacggactgacagtttataatactgctatcaatcct gctttcgattttacaaaaaatataagtggtcgtactttgaaagataaagaattcaaattt aatttgtacggagtagataaaaaaatagctgcttcggctaataacgatgctcaagggaaa gtaaccatgagcccaacgttaacagctgaacaactgagtactttgaaagctactggttcg gttaaagtagcctatacgctttctgaggaaaaaggaagtttgggaggagtaacttatgat acgaaagaattgtcagttgagctgacagtaacttatgataaaacaaatcatagttataaa gctgaattcgcatacccagatggaacagcaatatttaacaatgaatatgcaacaaccaat gtttcagctagtttaacagcgagtaaaacgttaactggcggtcaaacactaaccgcagga caatttgactttgagctagttgaagatggaaaagtgattgatactaagagcaataacgaa tccggagcggtaacgtttgctgcaattgactacagtaaaactggaacctactcatacaaa attcgggaaaaaataggcatacaagggcaagatggtatcaaatatgatacgaaagaattt aatgtcgatgttgttgttacggatgatggagcagggaaattagtagctacctcggtctat cgtgatggcccagcagcattcactaatgagtatgtcactactccggacactgttgtaatt caaggaacaaaagcgttatctaataaagctttattagaaggacagtttaaatttgaatta cacgatagtgaaggtggacttgtggacactgcttataacagtgccaatggtcaaattaat tttaaggcattaacttatactaaagcgggagactataaatacacggttcgtgaagtagca ggaagtcagacgggctacacatacgatgaaacggtatttgatgttaccgttcaggttact gatgataaaaaagggaagcttacggcaagtgttcaggatatcgatggaccgattatattt gaaaatgcatatcaacctaattctgatagtgttgtgattacagcagctaaagaattggaa ggtaaagttttagttgaaaatcaatttgaatttatcttacgcgatgaagatggaacagaa attgggaaacaaaagaacaatgcagatggttcaataaactttgctgaaattccttatact gttgcaggaacgtacaattatacaattgaagaagtagattcagaacagaatggcattgct tacgatactacacctaggaaagtcgttgttaaggtttatgatgtcgaaggtgagttagaa gccaaggttgagtacgttggtggtccagtcgtgtttaaaaacacttatactgctaaacca gacagcgtagtgtttgaagcaagtaaactattagatggtcaaataattagagatggtcaa tttaaatttgacttaattgacaaaagcacggacaaagtaatccaaacggtatcgaacaat gctgagggtaagatttactttgatgaaatttcttatgatacagtaggtaattataactat acgattcgtgaggttgaaggtgtccaagggggcatggcttacgataaggaagaatttagt gttaacgttgtagtagcagatgatggtgaaggtcaattaacagcaaccgaaacttattca gatggcccagctgcatttaagaatacttatacaactgatcctgatacggttgtacttgaa gcaagtaaagtattagaggggcaaatactcagaaacaaacaatttatatttgagcttgtc gattcaacgaatcaagtaatccaaacagcaacaaataacgcaaatggtcaagtgctattc aatgaaatttcatatactaaagttgaagaacaaacgtacactattcgtgaggctaaagga tctcaattaggcgtaacttatgcgactaatgaaattaccgttaaagtaactgtaacggat aacggtgaaggaaaattaacagccaaagcagtttatgataagccggcagtctttacaaat agctacactcctgaaccaagtaaagtcgttattgaagctaaaaaagtgctagaagggcaa gaattagtaaatggacaatttagttatcagctggtagatgaatctggagataccgttcaa accgcaacgaacaatgcggatggacaagttatctttgatgaaattaattataaagctgta ggaaaatacacctatattatccgtgaggttcaaggtatccaaggtggtatgacgtatgat gatgatacgtatgcagttgtggttgatgtggcagatgtagaaggtcagttagtttctaca gctaactacattagtggtccagctacgtttacaaatacgtataaagctgatccaaatagt gttgtacttgaagcaagtaaacttttagaaggacaaactctagttaaagatcaatttact tttgaactattaaatgacaagggtgaatctattcaaacgaaaaaaaataacgaaaatggt caagtcatctttgatgaaatgtcctatagtaaagttggaactcacacttacacgattcgt gaagttgcaggcactcaaggtggagttgaatatgacttatcagtgtttaatgtaacagtt gaagttgttgatggaagagaaggtcaattgattgctactgaaagctatagcactggcccg gcagtctttactaataaatatactacggcaccagataaagttgtgattgaggcagaaaaa gtcttagaaggacaaaatttagtcgcaggacaatttgaatttgagttagtaaatactgat ggagatattcttcaaacagtagaaaataatgcaaatggccaaattatctttaatgaaatc atctatagtgaagcggatgaacacacgtataccattcgtgaggttaaaggtgttcaaggt ggtatggcttatgatacgactgagtttgaagtaacggtatccgttaaggatgatggcgaa ggtcaattaacagctactttagataaaggcaagacaccattagtatttaccaataactat acagcagcagcagatagtgttgtatttgaagctgaaaaagccttagatggtcaaattcta gtcgcaggacaatttgaatttgaattagtggatattgatggaaatgttcttcaaacagta gaaaataatacgaatggtcaaatcatctttgatcaaatcagctataacgaaacaggcaaa cacacgtacacgattcgtgaagttaaaggtactcagggtggcgtaacttatgacacaact aagtatgaagttgttgtaacggtaacagatgataaagaaggtaatttgcacgcggaagtt gtatacagtgatgaaaatgttgtgttcactaatagctatagcgcaaatgatggcgttgca acaatcgaagcttctaaggaattagacggacaaaagttacgtgctgaacagtttgaattt aacttgttgaatgaaaataaagaagttattcaaacagtaaaaaatgattcagaaggcaac attagctttactgaattaacgtatacagaaccgggcgagcatgtttactttattgaagaa gtaaatgacaagctaggtggcgtaacgtacgatgatatacgttacactgcaacggttaag gtaacagacaatggaaatggtcaactagaaacagttattaaatataatgaagaacctcta tttacgaaccattacgcagcagcaccagacagtgttgatttaagtgctaaaaaaatattg gaaggtcaaaagctagtagcggatcaatttgcatttgaattagtaaatgctaaaggagat actcttcaaaccgtaaaaaatgatgaagcaggtcaagttgactttgacgaaatcacttat actgaaataggagaacacacttatacgattcgtgaagtcaaagaagacctcggtggtgtg acgtatgatggaacttcattcgtagttaatgtgatagttacagacaatggtgagggacaa ttgatagctactcagagatatgttgacggtccagcagtatttacaaatacgtatacaact gaaccaggcagcgtaatttttgaagcagacaaacaattaaatggacaaaaactttctgac ggtcaatttgaatttgaactagtaaatagtgcagaagaagttattcaaaaagtaactaat gatgcaacaggtcaaattatctttgacgaaatcaagtatgacaaagtaggcgaccatact tatacgattcgtgaagtcaaaggcgatcaaggtggagtaacttatgactcagctgaattt aaagttgatgtaacagtaatagatgataaagaaggcaatttgcacgcagaaattgtatac agtgatgaaaatgttgttttcactaacagctatagtgcaaatgatggcgttgcaacaata gaagcttctaagaaattagaaggacaaaagctacgtgctgatcagtttgaatttaacttg ttgaatgaaaataaagaagttattcaaacagtaagcaataacgcaacaggtcaaatcatc tttgatgaaatcagttatgctaaagttgggaaatatacgtataccatccgtgaagttaaa ggcaaccaaaagtatataacgtatgacgctactgattatacagttattgtggatgttata gatgatagcgaaggaaatttagtaactactgtaacctatactaatggatcagctaatttt actaataaatatgttccagctaaagttagcgtcggcgattatgtctggtttgacaagaac aaagacggtctacgagacaaaacagatgtaccacttaaaggagtagtcttaacgattact gacaaagatggcaatccagtaacggatgtttatggtaatctagtaggagcaaccacaaca gacaaaaatggcttctatatctttaagaatttgccaatcaataaagaatacagagtcttc attgatcgtgttgcttctgcgaaggttttggaaggatatgttccaacaatcgaagttggc gatgacaattctattgactcttcaacatgggaagtcgcgtcacgcctgttaactaaagat ggagagcatgatccaacgctagacttcggatttgtcttatcatcaccggttgttcctgtg gaccctgaagaaccaggtgagacagcagaaacgacagaaccaaagtatcctttagaccca acggaaccagtagaacaagaggacccgacggaatcaaaggatccatcaaattcagcggga cctacagatccattagaatcaactgatccagtggaaaccaaaaattctgaagaagagaat ttaccaaaaactggtgaagcagcaacatacactggtttagcggcagtattgcttctagca ggtgtaagtctgttttactatgaaagaaaatcggcaaaagaaaagctaataagtaagcga tag

DBGET integrated database retrieval system