Candidatus Carsonella ruddii PV: CRP_013
Help
Entry
CRP_013 CDS
T00403
Name
(GenBank) transketolase
KO
K00615
transketolase [EC:
2.2.1.1
]
Organism
crp
Candidatus Carsonella ruddii PV
Pathway
crp00030
Pentose phosphate pathway
crp00710
Carbon fixation by Calvin cycle
crp01100
Metabolic pathways
crp01110
Biosynthesis of secondary metabolites
crp01120
Microbial metabolism in diverse environments
crp01200
Carbon metabolism
crp01230
Biosynthesis of amino acids
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
crp00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00030 Pentose phosphate pathway
CRP_013
09102 Energy metabolism
00710 Carbon fixation by Calvin cycle
CRP_013
09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
01051 Biosynthesis of ansamycins
CRP_013
Enzymes [BR:
crp01000
]
2. Transferases
2.2 Transferring aldehyde or ketonic groups
2.2.1 Transketolases and transaldolases
2.2.1.1 transketolase
CRP_013
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transketolase_N
Transket_pyr
Transketolase_C_1
DXP_synthase_N
TPP_enzyme_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAF35044
UniProt:
Q05FX7
LinkDB
All DBs
Position
complement(9497..11407)
Genome browser
AA seq
636 aa
AA seq
DB search
MLYNIINNIRLICIKSISKANSGHPGMPLGICDVFTIFFLNFYKINFNNLKSINKDKLII
SNGHGIIINYVLLYLYNVYKIKDLINFRRFNSNTPGHPEIGNFIDASTGPLGQGIGIGIG
IGLKSKKYKNKFNNFFNIFNNKVWIFCGDGCLMEGVSSESCSFCGCYNINNIILLYDSNN
ISIDGNVKNYFNENIKLKFISLNWNVIGPINGHCYFSIIKSLLKAKKSYFPTIIIYNTII
GFISPCKSYNENSHGNIFTKFEFLEILKNFTLTYDYVKKMFFDNKKKYLIYYKKKYKKYF
FELIRIFNNIIPKINFLKLYFKYYKINLNKSTRFVCSNILKNIYAINETFGGSADLTNSN
LTKNNFINSIRYKNFKNRYINYGVREFTMGLINYGLSSDKIGINYCSTFLVFSNYMYSAI
RNFCLSKLKNIFIFTHDSILVGEDGPSHQPIEQLHSIRIIPRNYIFRPYNYIELILCWIL
ILKFLNNCSSLILSRQNFKNNFIKIYNIKNIITGTYSCFYKKKIELIIVSNGSDLEICFE
CYFFLKKYFIIQIISLFCNKLFDKQKKIYKNKILNCKKIIFVESSNDDFWYKYKKYFTYV
LNIKKFGYSSNELELKKKTNLNKKFLIKLCLFVIKL
NT seq
1911 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatataacataataaataatattagattaatttgtattaaatcaatttcaaaagct
aattctggacatcccggtatgcctcttggaatttgtgatgtatttacgatttttttttta
aatttttataaaataaattttaacaatttaaaatcaattaataaagataaacttataatt
tcaaatgggcatggaataattataaattatgtattactttatttatacaatgtatataaa
ataaaagatttaataaattttagaaggtttaattctaatacaccaggtcatcctgaaatt
ggaaattttattgatgcttcaactggtccattaggacaaggaattggaattggaattgga
attggtttaaaaagtaaaaagtataaaaataaatttaataatttttttaatatattcaat
aataaagtttggatattttgtggagatggatgtttaatggaaggagtgtcctccgaatca
tgttctttttgtggatgctataatattaacaatattatattattatatgatagtaataat
atttcaatagatggaaatgttaaaaattattttaatgaaaatattaagttaaaatttatt
tcattaaattggaatgttattggaccaataaatggacattgctatttttcaataattaaa
tctttattaaaagcaaaaaaaagttattttccaacaattataatttacaatactataata
ggatttatttctccatgtaaatcatataatgaaaattctcatggaaatatttttacaaaa
tttgaatttttagaaattttaaaaaattttacattaacatatgattatgttaaaaaaatg
ttttttgataataaaaaaaaatatttaatatactacaaaaaaaaatataaaaaatatttt
tttgagttaataagaatttttaataacattataccaaaaataaattttttaaaattatat
tttaaatactataaaataaatttaaataagtctactagatttgtttgttctaatatatta
aaaaatatatatgcaataaatgaaacatttggaggaagcgcagatttaacaaattctaac
ttaacaaaaaacaattttattaattctattagatataaaaattttaaaaatagatatata
aattatggagtacgagaatttacaatgggattaataaattacgggttatcttctgataaa
ataggaataaattattgttctacttttttagttttttcaaattatatgtatagtgcaata
agaaatttttgtttatctaaacttaaaaatatttttatatttacacatgattcaatttta
gttggtgaagatggaccatcacatcaaccaattgaacaattacattcaattagaataata
ccaagaaattatatatttagaccatataattatatagaattaattctatgttggatatta
attttgaaatttttaaataattgttcgtctctaattttatcaagacaaaattttaaaaac
aattttattaaaatatataatattaaaaatattataactggtacttattcatgtttttat
aaaaaaaaaatagaattaataattgtttctaatggatcagatttagaaatctgttttgaa
tgttattttttcttaaaaaaatattttattattcaaataatttcattattctgcaataaa
ttatttgataaacaaaaaaaaatatataaaaacaaaattttaaattgtaaaaaaataatt
tttgttgaatcttcaaatgatgatttttggtataaatataaaaaatactttacgtatgtg
ttaaacataaaaaaatttggatattctagtaacgaactagaactaaaaaaaaaaactaat
ttaaacaaaaaatttttaattaaactatgtttgtttgtaataaaattataa
DBGET
integrated database retrieval system