Candidatus Carsonella ruddii PV: CRP_161 Help Entry CRP_161           CDS       T00403                                  Name (GenBank) RNA polymerase beta' subunit   KO K03046   DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6] Organism crp  Candidatus Carsonella ruddii PV Pathway crp03020   RNA polymerase Brite KEGG Orthology (KO) [BR:crp00001]  09120 Genetic Information Processing   09121 Transcription    03020 RNA polymerase     CRP_161  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03021 Transcription machinery [BR:crp03021]     CRP_161    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:crp03400]     CRP_161 Enzymes [BR:crp01000]  2. Transferases   2.7  Transferring phosphorus-containing groups    2.7.7  Nucleotidyltransferases     2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase      CRP_161 Transcription machinery [BR:crp03021]  Prokaryotic type   Bacterial type    RNA polymerase     Core subunits      CRP_161 DNA repair and recombination proteins [BR:crp03400]  Prokaryotic type   SSBR (single strand breaks repair)    NER (nucleotide excision repair)     TCR (transcription coupled repair) factors      DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)       CRP_161 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BAF35192 UniProt:  Q05FH9 LinkDB All DBs Position complement(137484..141362) Genome browser AA seq 1292 aa AA seqDB search MIKSIFKKVSIKMASSSKILSWSFGEVTHSNFINFKNLKPEPNGLFCLKIFSDFELCCLK KKCFCHNDKFLNLKKAHTGYKVGHIKLFYPAVHIWYIKSSHSNISNILNLSYKILEKIIN FKLKVVIKSYDIKIKKFNLFIFDKKIKNIIFTLSGAKALKKLLSDRELFIDCLILKIKIK KCNSFSKLFSILKHINKILIFYYSGNKPSWMVLKKIPVLPPRMRPLIALSEKKFASSDIN ELYKIVLERNYKLKKMTTYLDPKQLLINERISLQESIYALFDNEKLINPILTSSKRVLKS FSSLIKGKYGRFRQNLLGKRVDFSGRTVITVEPNLFLYECKIPIYIALELFKPILYYELK KKKIITTISFIDDYYKKNKKQIILLLKNKVKSYFIMLNRAPTLHRMNFQSFKILLTEDKT IKIHPLVCLCYNADFDGDQMAIHLPLTNNAKVESNYLLLSINNIISPSNGNAIIIPTQDI IMGIYYFTFDFKNKSISLNDINDIINFFEFNNYNFQINIKFNNKKKINTTLGRIIINYLF FKNFDYFLNIVFKKKILTYLIKYLFDFNQLSKIIIILEKLKKIGFLISTYSGITISYFDL IEVKNTFLINKVVFKLKYNNNIFSIVELLNNFFVKIIIKKIQINKTGLKKTNNLFIMLDS GSRGSMLQIKQLIAFRGFFSKSNGDIIKDPIFDNLKNGLNMKNYFISTFGARKGLTDTSL KTANSGYLTRKLIDVSHDLVIYKIDCKTKTGIKIFLNSYFTLVELYKNLYGRLLLFSVSL KNKILLKENTLIDNKVLFLLIKKKINTIFVRSVLFCISNRGVCCFCYGIDLSTNKIVLIG VSVGIISAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVASYFFYSDNLIISNSGFVKFKKCKCVINKFGE VIIVSLYGEFMIFNKIILEKYKFYYGTKIKFRNGFLIKKNTKLINFNDNNFYIYSENIGY VYFKKENNIVKNYCLEDNKFYYKTLKNFKITIINKSIKKNYFIPKNFNIVVYCYDYIFPG EIIAKLVSVTILKSSIIGGLPRLSELFEARIPKLKALLSEIDGVCKIKFSHLNYIITIIS KFGFYKEYTLSCLRKLYINNGDYVKIGDILSDGKPDLNEIINLISINYLLSYFVNEINSI YFPQNIYVNCKHIELILKQMTKKVKIIFSGESSCQQGDILFLEDAINENFSTLVNSRRLS YYKRIVTGITKTSLESLSFFSAASFQETNKILVNSAIKNRTDYLLGLKENVLVGRLIPAG TGLIKYFKKKSKSSKNNLDFKNRKKKFYINYF NT seq 3879 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgataaaatcaatttttaaaaaagtttcaattaaaatggcttcttcttctaaaatttta agttggtcatttggagaagttacacattctaattttattaattttaaaaatttaaaacca gaacctaatggtttattttgtttaaaaatatttagcgattttgaattatgttgtttaaaa aaaaaatgtttttgtcataatgataaatttttaaatttaaaaaaagcacacacaggatat aaagtaggacatataaaacttttttatccagcagtacatatatggtatattaaatcttcg catagtaatataagtaatattttaaatttgagttataaaatattagaaaaaataattaat ttcaaattaaaagttgtaataaagtcatatgacataaaaattaaaaaatttaatttattt atatttgataaaaaaataaaaaatataatttttacattgtctggtgcaaaagctttaaaa aaattattatctgatcgtgaattatttattgattgtttaattttaaaaattaaaattaaa aaatgcaattcatttagtaaattattttctatattaaaacatattaacaaaattttaatt ttttattattccggaaataaaccatcttggatggtactaaaaaaaataccagttttacct cctagaatgagaccgctcattgctctaagtgaaaaaaaatttgcttcttctgatattaat gaattatacaaaatagttttagaaagaaattataaattaaaaaaaatgactacttactta gatccaaaacaattattaataaatgaaagaatttcattacaagaatctatttatgcatta tttgataatgaaaaattaataaatcctatcttaacttcttcaaaaagagtattaaaatct ttttctagtttaataaaaggaaagtatggaagatttagacaaaatcttttaggtaagaga gttgatttttcaggaagaacagtaattactgttgaaccaaatttgtttttatatgaatgt aaaattccaatttatatagcattagaattatttaaaccaattttatattatgaactaaaa aaaaaaaaaataattactactataagtttcatagatgattattataaaaaaaataaaaaa caaataattttattattaaaaaataaagttaaaagttatttcataatgctaaatagagca cctactttgcatagaatgaattttcaatcttttaaaattttattaactgaagataaaact attaaaatacatccacttgtttgtttatgttataatgcagattttgatggagatcaaatg gcaattcatttaccactaacaaataatgcaaaagtagaatctaattatttattattatca attaataatattatttcgccatcaaatggtaatgcaattattattccaactcaagatata attatgggaatatactattttacttttgattttaaaaataaaagtattagtttaaatgat attaacgatattataaacttttttgaatttaataattacaattttcaaataaatattaaa tttaataataaaaaaaaaataaatacaaccttaggtagaattataattaattatttgttt tttaaaaattttgattattttttaaatatagtttttaaaaaaaaaattttaacttattta attaaatatttattcgattttaatcaactaagtaagataattattattttagaaaaatta aaaaaaataggatttttaatatcaacatattcaggaataactattagttattttgattta atagaagttaaaaacacttttttaattaataaagttgtttttaaattaaaatataataat aatattttttctattgttgaattattaaacaatttttttgttaaaataataattaaaaaa atacaaataaataaaacaggtttaaaaaaaacaaataatttatttataatgttagattct ggatctagaggttctatgcttcaaattaaacaattaattgcatttagaggatttttttca aaatcaaatggagatattatcaaagatccgatttttgataatttaaaaaatggtttaaat atgaaaaactatttcatttctacttttggtgctagaaaaggtctaactgatacttctctt aaaactgcaaattctggttatttaacaagaaaattaattgatgtatctcatgatttagta atttataaaattgattgtaaaactaaaactggaataaaaatatttttaaattcttatttt actttagttgaattatataaaaatttatacgggagactattacttttttctgtatcactt aaaaataaaatattattaaaagaaaatacgttaatagataataaagttttgtttctttta ataaaaaaaaaaataaatacgatttttgttagaagtgtattattttgtatttcaaataga ggtgtttgttgtttttgttatggaatagacttatcaactaataaaatagtattaattggt gtttctgttggtattatttctgctcaatcaataggagaacctggtacccaattaacaatg agaacatttcatacaggtggtgttgcaagttattttttttacagcgataatttaattatt agtaattctggatttgtaaaatttaaaaaatgtaaatgtgtaattaataaatttggagaa gtaattattgtttctctttatggagaatttatgatttttaacaaaattatattggaaaaa tataaattttattatggtacaaaaataaagtttagaaatggatttttaattaaaaaaaac actaaattaataaatttcaacgataataatttttatatatattcagaaaatattggttac gtgtattttaaaaaagaaaataatattgttaaaaattattgtttagaagacaataaattt tactataaaactttaaaaaattttaaaataacaattattaataaaagtataaaaaaaaat tattttattccaaaaaactttaacatagttgtttattgttatgattatatttttcctgga gaaattatagcaaaattagttagtgttactattttaaaatcaagtataattggtggttta cctcgtttaagtgaattgttcgaagcaagaataccaaaattgaaagctttactttcagaa attgatggagtttgtaaaattaaattttctcatttaaattatataatcactattatttca aaatttggtttttataaagaatatactttaagctgtttgagaaaattatatattaataat ggagattatgttaaaataggagatattttgtctgatggtaaaccagatttaaatgaaatt attaacttaataagtataaattatttactttcttattttgttaacgaaataaattcaatt tattttccgcaaaatatttatgttaattgtaaacatattgaattaattttaaaacaaatg acaaaaaaagtaaaaattattttttcaggagaaagttcttgtcaacaaggagatattttg tttcttgaagatgctataaacgagaatttttctactttagtaaattcaagaagattgtct tattataaaagaatagttacaggtattactaaaacatctttagaatctttatcgtttttt tctgctgcttcttttcaagaaacaaataaaattttagttaattctgctattaaaaataga acagactatttattaggattaaaagaaaatgttttagtaggaagattaatacctgctggt acaggattaattaaatactttaaaaaaaaatctaaaagtagtaaaaataatcttgatttt aaaaatagaaaaaaaaaattttatataaattatttttaa

DBGET integrated database retrieval system