Candidatus Carsonella ruddii PV: CRP_177
Help
Entry
CRP_177 CDS
T00403
Name
(GenBank) diaminopimelate decarboxylase
KO
K01586
diaminopimelate decarboxylase [EC:
4.1.1.20
]
Organism
crp
Candidatus Carsonella ruddii PV
Pathway
crp00300
Lysine biosynthesis
crp00470
D-Amino acid metabolism
crp01100
Metabolic pathways
crp01110
Biosynthesis of secondary metabolites
crp01120
Microbial metabolism in diverse environments
crp01230
Biosynthesis of amino acids
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
crp00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00300 Lysine biosynthesis
CRP_177
09106 Metabolism of other amino acids
00470 D-Amino acid metabolism
CRP_177
Enzymes [BR:
crp01000
]
4. Lyases
4.1 Carbon-carbon lyases
4.1.1 Carboxy-lyases
4.1.1.20 diaminopimelate decarboxylase
CRP_177
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Orn_Arg_deC_N
Orn_DAP_Arg_deC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAF35208
UniProt:
Q05FG3
LinkDB
All DBs
Position
155213..156409
Genome browser
AA seq
398 aa
AA seq
DB search
MIETNKNIYINNINLKKIFKNFSLPIYIYDFKKILKNLYLIKKTKIFCFYSIKTNNNKFL
LKLISNIIKKFDIVSIEEFLNIIYINKKKTYIIFSGSGKSISEILISINLNIFSINIESI
QELFKIFFFCNKHKKNINLMIRLNPNIDSCSHNKISTGKNTNKFGINISNIKHFLLIIKI
TKLNFIGYDFHIGSQICRLSPLKKLFKTIKLINDYKKVNFVDIGGGKNINYYENNININF
NNYYRSIKKLIKKYNLSFKLIIELGRFFFGNSCIILSKVNYLKFNKIFKIAILNVGMNDI
MRPAIYNSYHKIESNNIGYKIKNVFGPICESSDKFYNSKYIKINSNSLIIVYSCGSYSKV
MSSNYNSKKKIFDIVVYKNKIKIVYKKEKFNNLISNYV
NT seq
1197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagaaactaataaaaatatttatataaataatataaatttaaaaaaaatatttaaa
aatttttctttaccaatatatatatatgattttaaaaaaatactaaaaaatttatattta
attaaaaaaacaaaaattttttgtttttattctataaaaacaaataataataaattttta
ttaaaattaataagtaatataattaaaaaattcgacattgtttcaattgaagaattttta
aacataatttatataaataaaaaaaaaacgtatataatattttctggtagtggaaaaagt
atatcggaaattttaatttcaataaatttaaatatttttagtattaatatagaatcaata
caagaattatttaaaattttttttttttgtaataaacataaaaaaaatataaatttaatg
atacgattaaaccctaatattgattcatgttcacataataaaatttcaactggtaaaaat
actaataaatttggaattaatatttcaaatattaaacattttttattaataattaaaatt
actaaattaaactttattggatatgattttcatattggatcacaaatatgtagattatca
ccattaaaaaagttatttaaaacaataaaattaattaatgattacaaaaaagttaatttt
gttgatattggtggaggaaaaaatataaattattatgaaaataatattaatattaatttt
aataattattatcgttcaataaaaaaattaatcaaaaaatataatttaagttttaaatta
attattgaattaggaaggtttttttttggaaattcttgtattattttatcaaaagttaat
tacttaaaatttaacaaaatttttaaaatagcaattttaaatgttggaatgaatgatatt
atgagacctgcaatatataattcatatcataaaattgaaagtaataatattggatacaaa
attaaaaatgtatttggcccaatatgtgaatcaagcgataaattttataattcaaaatat
ataaaaattaatagcaatagtttaattattgtttattcttgtggaagttatagtaaagtt
atgagttctaattataatagtaaaaaaaaaatttttgatattgttgtatataaaaataaa
attaaaatagtttataaaaaagaaaaatttaataatttaattagcaattatgtataa
DBGET
integrated database retrieval system