Candidatus Carsonella ruddii (Diaphorina cf. continua): CRDco_1240
Help
Entry
CRDco_1240 CDS
T09287
Symbol
valS
Name
(GenBank) valine--tRNA ligase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
crr
Candidatus Carsonella ruddii (Diaphorina cf. continua)
Pathway
crr00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
crr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
CRDco_1240 (valS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
crr01007
]
CRDco_1240 (valS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
crr03016
]
CRDco_1240 (valS)
Enzymes [BR:
crr01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
CRDco_1240 (valS)
Amino acid related enzymes [BR:
crr01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
CRDco_1240 (valS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
crr03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
CRDco_1240 (valS)
Prokaryotic type
CRDco_1240 (valS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
tRNA-synt_1g
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCG49348
UniProt:
A0A7R6VZN3
LinkDB
All DBs
Position
115636..117507
Genome browser
AA seq
623 aa
AA seq
DB search
MIKIHNFCFKKHFLIVLPPPNITGELHIGHFFQYFIIDIIIKLKILQGYIIKFILGFDHA
GLSAIIKFKSKKKILVQKKYLIKRYLYQLKYINFLLKKTKINFTLNKNYENIVKNGFNYY
YKKKLIIVKKQFLNCCKNKIISDCEIEKKIFTKYLYYIKYKIKTKTIIISTSNLKSLFYN
TFLISKIKFYNDKESISPFKFKIKIYSEQINNLSNFKKYSPNINNFDFLMFLKKKASIII
NYQKKSNLYNSEKFNFRKKSILFYKKKNKNNIFKFLLKNNYIVCIKKYKSFLKVKKYDNE
KINNLLFDQWFLNIKKILSFKKIKKNIFIKNKKYEKIFFIWIKNISNWCISRQINWGTKI
PIFLDKEKNIYQKKEYKFVKYYNNKDVFDTWFNSSFWIIFVYNKLKKTNNIIVSGFDIIF
FWIIKMLINNIFIYKKPLIKKIIIHGLIKDSTKKISKSTNNVLNFNQIKKNINKIRLYLI
KDIFNDINISIFKFQTNKKYFINTILDIKINIFFFYVIKKLIIKKYLNYEFERNNQNILK
KNIICKKIFILITKIFFPIKKIFISENWNFSLNFYINKLFDFKFLIIIKINNKILLIKTH
TNYFVIFFKIKLIFYVKQKNKTI
NT seq
1872 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaattcataatttttgtttcaaaaaacattttttgattgttttaccgcctcct
aatattactggtgaattacacataggtcattttttccaatattttataattgatataata
ataaaattaaaaattttacaaggatatataataaagtttattttaggctttgatcacgcc
gggttatctgctattataaaatttaaaagtaaaaaaaaaatattagtacaaaaaaaatat
ttaatcaaaagatatttgtaccaactaaaatatataaattttcttttaaaaaaaaccaaa
ataaattttactttaaataaaaattatgaaaatattgttaaaaatggatttaattactat
tataaaaaaaaattaataatagtaaaaaaacaatttttaaattgttgcaaaaataaaatt
atttcagattgtgaaatagaaaaaaaaatttttacaaagtatttatattatataaaatat
aaaataaaaacaaaaacaattataatttctacatctaatttaaaatcattattttataat
acttttttaatttccaaaataaaattttataatgataaggaatcaatatctccttttaaa
tttaaaataaaaatttattccgaacaaattaataatttatcaaattttaaaaaatattct
ccaaatataaataattttgattttttaatgtttttaaaaaaaaaagcaagtataataata
aattatcaaaaaaaatctaatttatataattcagaaaaatttaattttagaaaaaaatct
attttattttataaaaaaaaaaataaaaataatatatttaaatttttactaaaaaataat
tatatagtttgtattaaaaaatacaaatcttttttaaaagtaaaaaaatacgataatgaa
aaaataaataatttattatttgatcaatggtttttaaacataaaaaaaattttatctttt
aaaaaaataaaaaaaaatatattcattaaaaacaaaaaatacgaaaaaatattttttatt
tggataaaaaatatttctaattggtgtatatctagacaaattaattggggaacaaaaata
cctatatttttagacaaagaaaaaaatatataccaaaaaaaagaatataaatttgtaaaa
tattacaataataaagatgtttttgacacttggttcaattcctcattttggataattttt
gtttataacaaattaaaaaaaacaaataacataattgtatcgggtttcgatattattttt
ttttggataattaaaatgttaattaacaatatttttatatataagaaaccattaataaaa
aaaataattatacacggattgataaaagattctactaaaaaaatatcaaaatcaactaat
aacgttttaaattttaaccaaataaaaaaaaatataaacaaaataagattatacttaatt
aaagacattttcaatgatataaatatttctatttttaaatttcaaacaaataaaaaatat
tttattaacactattctggatataaaaatcaatattttttttttttatgtaattaaaaaa
ttaattataaaaaaatatttaaattatgaatttgaaagaaacaatcaaaatattttaaaa
aaaaatataatttgtaaaaaaatttttattttgataacaaaaatattttttccaataaaa
aaaatttttatttctgaaaattggaatttttcattaaatttttatataaataaattattt
gattttaaatttttaataattataaaaattaataataaaatattattaataaaaactcac
acaaattattttgtaatattttttaaaataaaattaattttttatgttaaacaaaaaaat
aaaaccatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
