Candidatus Carsonella ruddii CE: A33U_0197 Help Entry A33U_0197         CDS       T02194                                  Symbol rpoC Name (GenBank) RNA polymerase beta' subunit   KO K03046   DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6] Organism cru  Candidatus Carsonella ruddii CE Pathway cru03020   RNA polymerase Brite KEGG Orthology (KO) [BR:cru00001]  09120 Genetic Information Processing   09121 Transcription    03020 RNA polymerase     A33U_0197 (rpoC)  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03021 Transcription machinery [BR:cru03021]     A33U_0197 (rpoC)    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:cru03400]     A33U_0197 (rpoC) Enzymes [BR:cru01000]  2. Transferases   2.7  Transferring phosphorus-containing groups    2.7.7  Nucleotidyltransferases     2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase      A33U_0197 (rpoC) Transcription machinery [BR:cru03021]  Prokaryotic type   Bacterial type    RNA polymerase     Core subunits      A33U_0197 (rpoC) DNA repair and recombination proteins [BR:cru03400]  Prokaryotic type   SSBR (single strand breaks repair)    NER (nucleotide excision repair)     TCR (transcription coupled repair) factors      DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)       A33U_0197 (rpoC) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AFP83644 UniProt:  J7GT19 LinkDB All DBs Position complement(140205..144059) Genome browser AA seq 1284 aa AA seqDB search MKNNFTKITIKIASSSKIINWSYGEVKSSQFINYKNLKPEKNGLFCLNIFSDCKICCNKK NCYCNKNDKFLNLKKSHIGYKMGHILLKYPVYHIWFFKSNNLSNILNFSNKILEKIFNFK LNIILRSFEKKYKKYDFFLTERKILNIVYLSGAKSIKFFFSDNEILLDCKLMKKKILKCF SYIKLFYYLKKINKIYIFYLSGNKLSWCILKNIPVIPPRMRPLVPLNLEKFASSDINELY KKIIDRNLRIYKLIILGIPKQILINERILLQEAVNALYDNEKIKNPILSSNKRILKSLSS SIKGKYGRFRQNLLGKRVDFSGRSVIVVDPSLLIYQCKIPILICLELFKPFLFYELKKKN LITTISFIEYFYKKNKKITLFYLNKIIKNHTILLNRAPTLHRMGFQSFEIILTEDKVIKL HPLMCLSYNADFDGDQMAIHLPLTVNSQLESKFLLLSINNIISPSNGEFIIIPSQDIIMG IYYLTFNFNNFNNFFNLKKIIYLYNIDKIDIYYNVLTFIKKKKFNTSVGRIIFYFILNCD VNFLFLNKIFKKKDIVYLIKYLFNKYNFKKFILFLDKIKKMGFFFATISGLTISYEDLSF IQNKNNIFKIFKKLKYNNLFNNVEIFNSIFLNLILKNIKNLKFLNNFNQVNNLFVMLDSG SRGSMIQIKQLIAFRGFFSKSNGELIFSPVLNNLKFGLTMKDYFISTYGARKGLTDTSLK TANSGYLTRKLIDVMQDLVVYKIDCMTKCGIELFIFNYKKIKNLYKKIYGRLLSKNIFNK KNIYFIKNTFINNKVIYLLIKKNINKIYIRSVLFCISIRGVCICCYGIDLSTNNIVKIGT PIGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVASYFFEKDELVINTNGFIYIKNCKCILNKLGKL IILSLKGIIIIKKNFFKNECYKIIYGDIISIRNGIFIKNRLVINNDNNFNIYSENNGNIY YNLKNLEKKFCINDKKYYFKTLKVCILFINEKKYFIPKNYFIINENKFYLYHGDIIAKII KSNIIKSNILGGLPRISELFEARIPKKKAILSELDGFIHIKLNIKNDYILSIISKFYVQK KYILNCNRKIYVNNGDYVKIGDILTDGKIDLNDIIKFIGINYLLFFFIKEINDIYTPQGV YINDKHLELVLKQMTKKIKIIYPGDCCFMINDSLYLEDVLIENILTLKNSKKICLYEKII TGITKASLESNSFFSAASFQETNKILIDSAIKNRSDYLLGLKENVVVGKPIPAGTGLEYH ILNFKKKSKMYKEFIKRKSFKLYI NT seq 3855 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaaataattttactaaaataactattaaaatagcttcttcttcaaaaataataaat tggtcttatggagaagtaaaaagttcacaatttataaattataaaaatttaaaacctgaa aaaaatggtttattttgtttaaatatatttagtgattgtaaaatatgttgtaataaaaaa aattgttattgtaataaaaatgataaatttttaaatttaaaaaaatctcatataggatat aaaatgggacatattttattaaaatatccagtatatcatatatggttttttaaaagtaat aatttatctaatatattaaatttttctaataaaatattagaaaaaatttttaattttaaa ttaaacataatattaagatcttttgaaaaaaaatataaaaaatatgatttttttttaaca gaaagaaaaattttaaatatagtatatttatctggagctaaatcaataaaattttttttt tcagataatgaaatattattagattgcaaattaatgaaaaaaaaaattttaaaatgtttt tcatatataaaattattttattatttaaaaaaaataaataaaatttatatattttattta tctggtaataaattatcttggtgtatacttaaaaatattccagttattcctcctagaatg agaccattagttcctttaaatttagaaaaatttgcttcttctgatataaacgaattatat 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DBGET integrated database retrieval system