Candidatus Carsonella ruddii CE: A33U_0216
Help
Entry
A33U_0216 CDS
T02194
Symbol
lysA
Name
(GenBank) diaminopimelate decarboxylase
KO
K01586
diaminopimelate decarboxylase [EC:
4.1.1.20
]
Organism
cru
Candidatus Carsonella ruddii CE
Pathway
cru00300
Lysine biosynthesis
cru00470
D-Amino acid metabolism
cru01100
Metabolic pathways
cru01110
Biosynthesis of secondary metabolites
cru01120
Microbial metabolism in diverse environments
cru01230
Biosynthesis of amino acids
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cru00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00300 Lysine biosynthesis
A33U_0216 (lysA)
09106 Metabolism of other amino acids
00470 D-Amino acid metabolism
A33U_0216 (lysA)
Enzymes [BR:
cru01000
]
4. Lyases
4.1 Carbon-carbon lyases
4.1.1 Carboxy-lyases
4.1.1.20 diaminopimelate decarboxylase
A33U_0216 (lysA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Orn_Arg_deC_N
Orn_DAP_Arg_deC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFP83660
UniProt:
J7H050
LinkDB
All DBs
Position
158076..159272
Genome browser
AA seq
398 aa
AA seq
DB search
MIEYKKIICINNVSLKLIEKKFFLPIYIYNYNKIMTNIFNSKIINFFFFYSMKSNDNLFL
LKIINYTLNKFDIVSLNELNKLILISINKPKIIFSGSGKNLSELLLSINLNIFCINFESF
QEIFKLIFLFNLYKKNIKLMIRINPNIDALTHKKISTGKITNKFGICLYNIKQIFILLKI
VKLKIIGYDFHIGSQIITLKPIKKLLYFFKNILNIKNYRYLDIGGGLGIDYYNHVKKFNI
FNYYSYIKKYINKNKINLKIITELGRYFFCNTCYILSKINYLKYNNLYNLAILNLGMNDL
LRPSLYDSYHKIESYNIGINFKNFFGPICESSDYYYNKKNIKIKNNSLIIFHSTGSYCKV
LSNNYNSKIKIYEILIYNNKIKIIYNKENFSNLIKNYE
NT seq
1197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaatataaaaaaataatatgtattaataatgtaagtttaaaattaatagaaaaa
aaattttttttacctatttatatttataattataataaaattatgacaaatatttttaat
tcaaaaataataaattttttttttttttattctatgaaatctaatgataatttattttta
ttaaaaataattaattatactttaaataaatttgatattgtttctttaaacgaattaaat
aaattaattttaatttcaataaataaaccaaaaataatattttctggtagtggaaaaaat
ttatcagaattattattatcaataaatttaaatatattttgtattaattttgaatcattt
caggaaatatttaaattaatttttttatttaatttgtataaaaaaaatattaaattaatg
ataagaattaatccaaatattgatgcattaacacataaaaaaatttctacaggaaaaata
acaaataaatttggtatttgtttatacaatataaaacaaatttttattttattaaaaatt
gttaaattaaaaattataggttatgattttcatattggttcacaaataataactttaaaa
cctataaaaaaattattgtatttttttaaaaatattttaaatattaaaaattatagatat
ttagacattggaggtggtttaggaattgattattataatcatgttaaaaaatttaacata
tttaattattatagttatataaaaaaatatataaataaaaataaaattaatttaaaaata
ataacagaattaggtagatattttttttgtaatacttgttatattttatctaaaattaat
tatttaaaatataataatttatataatttagctattttaaatttaggaatgaatgattta
ttaagaccatctttatatgattcttatcataaaattgaaagttataatataggtataaat
tttaaaaatttttttggtcctatttgtgaatctagtgattattattataataaaaaaaat
ataaaaattaaaaataattctttaataatttttcattctactggtagttattgtaaagta
ttaagtaacaattataattctaaaataaaaatatatgaaatattaatttataataataaa
ataaaaattatttataataaagaaaatttttctaatttaataaaaaattatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system