Candidatus Carsonella ruddii PC: A357_079
Help
Entry
A357_079 CDS
T02198
Symbol
carB
Name
(GenBank) carbamoylphosphate synthase large subunit
KO
K01955
carbamoyl-phosphate synthase large subunit [EC:
6.3.5.5
]
Organism
crv
Candidatus Carsonella ruddii PC
Pathway
crv00220
Arginine biosynthesis
crv00240
Pyrimidine metabolism
crv00250
Alanine, aspartate and glutamate metabolism
crv01100
Metabolic pathways
crv01110
Biosynthesis of secondary metabolites
crv01240
Biosynthesis of cofactors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
crv00001
]
09100 Metabolism
09104 Nucleotide metabolism
00240 Pyrimidine metabolism
A357_079 (carB)
09105 Amino acid metabolism
00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
A357_079 (carB)
00220 Arginine biosynthesis
A357_079 (carB)
Enzymes [BR:
crv01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.5 Carbon-nitrogen ligases with glutamine as amido-N-donor
6.3.5.5 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolysing)
A357_079 (carB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CPSase_L_D2
CPSase_L_D3
ATP-grasp_3
ATPgrasp_Ter
Dala_Dala_lig_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFP84294
UniProt:
J3Z209
LinkDB
All DBs
Position
58589..61489
Genome browser
AA seq
966 aa
AA seq
DB search
MNKKILVIGAGPILVGQACEFDYSGSQSCKTLKEENFKVILLNSNPATIMTDYEIADTIY
IEKINKNNLIKIVQIEKPDFILPTMGGQTALNCIFDFINSKYNFSEKKILGINKKILINA
ESRLVFSKLIGNLNLKCPDSIIIKSTSDIKKIDNVSYPCIIRPSFTLGGLGSGIAYNKNS
LYFILKNAFLFSNEVSLDKSIIGWKEYELELLIDNYNNIIVICCIENIDPVGIHTGDSIT
ITPAQTISDKEYQNMRDSSFIILKSVGLKGGGANIQFAINPINGDLIVIEMNPRISRSAA
LSSKATGYSIAKISTKLSIGYSLLKLFNNSKFINLPSGYEPCIDYIAIKIPKFNFEKYLE
LNFLNTIMKSIGEVLGIGFSFQEAFLKAIYSIFEINIIPSLIKNKFYNSYKNKLIKKIIN
PNSTRIFYILDLFRLNTNIKIIFCLSKIDPWFLFNIKNIIENEKFYFHINNKKFYYKKID
SCSNEFEKNSLYYYSSKNLYFNELRYSIKKKIIIIGSGSNRIGQSIEFDYCCTKFSKLIK
KIGIISTIINCNPETVSTDYDISNYLFFEPITNVYINNIINIIKPILIICQIGGQSPINY
LFNNKKINKIFFGFNKNSILFGKKKFFNKLLFILKLNKIKNYNCINIKDLIFYFNIFNKT
IITRLPNIIGGSLMKIIYNNKEFLNFINLNKLINIYIEEFLFNSKELDIDILIENGKIIL
LNIIEHIENTGIHSGDSNMIFPNYSLSVKIIKKIFFIISIFCFKLNLNGIINFQICFKKK
IYIIECNPRASRTIPFSSKSNKYPIIYNYVLILLGYNVCFINKKSNFYFIKSSIFPFNKF
KISKLSPEMKSTGEEMNSGLSIQECFYKLFLLTNKIIFFNTKNIYIYIKYLKKINFLLKT
NSFNKNINFDLHINSYVSKKKKDKYIISDKINVFNNKTSFSSKSIIIFFFSSFDKEFLLV
RKLNKI
NT seq
2901 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaaatcttagtaataggagctggaccaattttagtaggacaagcatgtgaa
tttgattattcaggaagtcaatcttgcaaaactttaaaagaagaaaattttaaagtaatt
ttattaaattctaatcctgctacaataatgactgattatgaaattgcagatactatatat
attgaaaaaataaataaaaacaatttaattaaaatagttcaaattgaaaaaccagatttt
attttaccaacaatgggtgggcaaactgcattaaattgcatatttgattttattaattcg
aaatataatttttcagaaaaaaaaattttaggaataaataaaaaaatattaattaatgct
gaaagcagacttgttttcagtaagttaattggtaatttaaatttaaaatgtccagattca
attataattaaaagtactagtgacattaaaaaaattgataatgtaagttatccatgtatt
ataagaccttcttttacattgggaggattaggtagtggaattgcttataataaaaatagt
ttatattttatattaaaaaatgcatttttgttttcaaatgaagtttcattagataaatct
attataggatggaaagaatatgaattagaattattaatagataattataataatataata
gttatatgttgtattgaaaatatagatccagttggaattcatacaggtgattctataacc
attactccagctcaaactatttctgataaagaatatcaaaatatgagagattcttcattt
attattttaaaatcagtaggattaaaaggaggaggagcaaatattcaatttgctattaat
ccaattaatggtgatttaatcgttatagaaatgaatcctagaatttcaagatctgctgca
ctatcatctaaagctactggatattctatagcaaaaatttcaactaaattatctatagga
tacagtttgttaaaattatttaataattccaaatttattaatttaccatctggttatgaa
ccttgtatagattatattgctataaaaattcctaaatttaattttgaaaaatatttagaa
ttaaattttttaaataccataatgaaatcaataggagaagttttaggaataggattttct
tttcaagaagcttttttaaaagctatatattcaatttttgaaataaatataataccatca
cttattaaaaataaattttataattcttataaaaataaattaattaaaaaaataataaat
ccaaatagtacaagaattttttatatattagatttatttagattaaatacaaacattaaa
attattttttgtttatcaaaaattgatccatggtttttgtttaatattaaaaatattatt
gaaaacgaaaaattttattttcatataaataataaaaaattttattataaaaaaatagat
tcatgttcaaatgaatttgaaaaaaattctttatattattattcaagtaaaaatttatat
tttaatgaattaagatattcaattaaaaaaaaaattattataattggcagcggtagtaat
agaataggacaaagtatagaatttgattattgttgtacaaaattttctaaattaattaaa
aaaataggtataatttctacaattattaattgtaatcctgaaacagtttctactgattat
gatatatctaattatttgttttttgaaccaataactaatgtttacataaataatataatc
aatattattaaaccaatattaattatttgtcaaataggtggacaatcaccaataaattat
ttatttaataataaaaaaattaacaaaattttttttggttttaataaaaatagtatttta
tttggaaaaaaaaaattttttaataaattattgtttattttaaaattaaataaaataaaa
aattataattgtataaatataaaagatttaatattttattttaatatttttaataaaaca
attataacaagattaccgaatattattggtggatcattaatgaaaatcatatataataat
aaagaatttttaaattttattaatttaaataaattaattaatatttacatagaagaattt
ttattcaattcaaaagaattagatatagatattttaatagaaaacggaaaaataattttg
ttaaatataatagaacatattgaaaatacaggaattcattctggtgattctaatatgata
tttcctaattattctttatctgtaaaaataattaaaaaaattttttttattattagtata
ttttgttttaaacttaatttaaacggaataataaattttcaaatttgttttaaaaaaaaa
atttatattattgaatgtaatccaagagcatcaagaactataccttttagttctaaatca
aataaatatccaataatatataattatgttttaattttgttaggatataatgtatgtttt
ataaataaaaaaagtaatttttattttattaaatcttcaatatttccatttaataaattt
aaaatatctaaattatctcctgaaatgaaatctacgggtgaagaaatgaattctggttta
agtatacaagaatgtttttataaattatttttattaacaaataaaataatattttttaat
acaaaaaatatttatatatatataaaatatttaaaaaaaataaattttttactaaaaaca
aatagttttaataaaaacataaattttgatttgcatataaattcatatgtttcaaaaaaa
aaaaaagataaatatataatatctgataaaattaatgttttcaataataaaacatctttt
tctagtaaaagtattataatattttttttttcttcttttgacaaagaatttttattagtt
agaaaattaaataaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
