Castanea sativa (European chestnut): 142619309
Help
Entry
142619309 CDS
T11266
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
csaa Castanea sativa (European chestnut)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csaa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
csaa01003
]
142619309
Glycosyltransferases [BR:
csaa01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
142619309
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
142619309
NCBI-ProteinID:
XP_075648486
LinkDB
All DBs
Position
12:21509674..21515594
Genome browser
AA seq
1146 aa
AA seq
DB search
MASKSFHMSRSNLSTSSDAVSESLNKPPLPPTVTFGRRTPSGRYISYSRDDLDSELGSGE
FMNYTVHIPPTPDNQPMDPMISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESDTSHPQ
MAGAKGSSCAIPGCDANVMSDERGSDILPCECDFKICRDCYIDAVKTGGGICPGCKEPYK
NTDLDEGAVDSSGRPLPLPPPNGMSKMERRLSLMKSTKSVLMRSQTGDFDHNRWLFETRG
TYGYGNAIWPKDGGFENGKDDETTEPTELMNKPWRPLTRKLKIPAAIISPYRLLIVIRMA
VLALFLMWRINHPNNDAMWLWGMSVVCEIWFAFSWLLDQLPKLCPINRATDLNVLKDKFE
TPSPSNPTGKSDLPGVDIFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDGGA
LLTFEAMAEAASFANIWVPFCRKHDIEPRNPESYFSLKRDPYKNKVKSDFVKDRRRVKRE
YDEFKVRINGLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKVQRQNRGDEQVEGVKISKATWMADGTHW
PGTWLQSSSEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDEPLLGIADDTKLIDVTDIDIRLPLLVYVSRE
KRPGYDHNKKAGAMNALVRASAIMSNGPFILNLDCDHYIYNSQAMREGMCFMMDRGGDRL
CYVQFPQRFEGIDPSDRYANHNTVFFDINMRALDGIMGPVYVGTGCLFRRIALYGFDPPR
SKEHHPGCCSCCFGRTKKHSSVANTPEENRSLRMGDSDDEEMNLSLLPKRFGNSTFLIDS
IPVAEFQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPRELLDASTVAEAISVISCWYEDKTEWGQRVG
WIYGSVTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFF
SRNNALLASPRMKLLQRIAYLNVGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVTFLV
YLLVITLTLCMLAILEIKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVLAGIEIS
FTLTSKSGGDDVDDEYADLYVVKWTSLMIPPITIMMVNLIAIAVGFSRTIYSTIPQWSKL
IGGVFFSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAISPPSSTDQIG
GSFQFP
NT seq
3441 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtccaagtcctttcacatgagtagatcaaatctatcgacgtcttctgatgcggtt
tctgaatctcttaacaagcctccattgcctccaactgtgacctttggccggagaactccc
tccggtcgttacatcagctactccagggatgatcttgatagtgagcttgggagtggtgaa
ttcatgaactatacagtacatataccgccaacccctgataaccagcctatggatccaatg
atatcgcaaaaggttgaagaacaatatgtgtcgaattcactctttacaggtgggtttaat
agtgttactagagctcatctcatggacaaggtgattgagtctgatacaagccatccccag
atggctggtgcaaaaggctcttcatgtgcaattcctgggtgtgatgcaaatgtgatgagt
gatgagcgtggctcggacattcttccttgtgagtgtgatttcaaaatatgtcgggactgt
tatattgatgcagtgaaaactgggggtgggatttgtccagggtgtaaggagccttataag
aacactgatttggatgaaggagctgtggatagtagtgggcggccacttccccttcctccg
ccaaatgggatgtcaaaaatggagaggaggttgtcgttgatgaagtcaacaaagtcggtg
ttgatgaggagtcaaactggggactttgatcacaatcggtggctgtttgaaaccaggggg
acttatggatatgggaatgccatatggccaaaggatgggggttttgaaaatgggaaagat
gatgaaactactgagccaacggagttgatgaacaaaccgtggaggccacttacacggaaa
ttgaagatacctgctgccattatcagcccatataggcttctaattgtcattcgtatggct
gttcttgcattgtttttgatgtggaggatcaaccaccccaacaatgatgcaatgtggcta
tggggaatgtctgtagtttgtgagatatggtttgctttttcttggctgcttgatcaactt
cccaaactctgcccaatcaatcgtgctacagatcttaatgttttaaaggacaaatttgaa
acacctagtcccagcaaccccactggaaaatctgatctcccaggcgtagatatctttgtc
tctactgcagatccagagaaagaaccaccactggtcactgcaaacactatcttatctatt
cttgcagctgattatccagttgaaaagcttgcttgctatgtttctgacgatggaggtgca
cttctaacctttgaggccatggccgaagctgcaagctttgctaatatatgggttccattc
tgtcgtaaacatgatattgagcccaggaatccagaatcttacttcagtttgaagagggat
ccttacaagaacaaagtaaagtcagattttgtcaaagatcgtagacgagtgaagcgtgag
tatgatgagttcaaggtccggatcaatggcttgcctgactctattcgccgccgttcagat
gcctatcatgctcgggaggaaatcaaggccatgaaggttcagagacagaacaggggcgat
gaacaagtagagggtgtgaagatctcaaaagcaacatggatggctgatggaactcattgg
ccagggacttggttgcaatcttcatctgagcactccaaaggagaccatgctggtataata
caggtgatgttgaaacctcccagtgatgaaccactactcggaattgctgatgataccaag
cttattgacgtcactgacattgatattcgtctcccgcttcttgtttatgtgtctcgtgag
aagcgtccaggctatgatcacaacaagaaggctggggccatgaatgccctggttcgagct
tcagccattatgtccaatggccctttcattctcaaccttgactgtgaccactacatctac
aactcccaagctatgagggagggcatgtgcttcatgatggacagaggaggtgatcgcctt
tgttatgttcagttcccccagaggtttgaggggattgatccatctgatcgatatgccaat
cacaacactgttttctttgatatcaacatgagagcccttgatgggattatgggccctgtc
tatgtcggaactggatgcctctttcgaaggatagccctttatggttttgatccacctaga
tctaaagaacaccaccccggctgctgcagttgctgctttggccgtaccaaaaagcattcc
tcagttgcaaacaccccagaagagaaccgatctctgagaatgggtgattctgatgatgaa
gagatgaacctctctttgcttcctaaaaggtttggaaactcaactttcctcattgattcc
atcccagtggcagagttccaaggtcgtcctcttgcagatcacccagctgtgaaaaatgga
cgcccacctggtgctctcactatcccccgtgagcttcttgatgcatcaactgttgcggag
gcaatcagtgttatctcatgttggtatgaagacaagacggagtggggacaacgtgttggt
tggatttatgggtcagttactgaagatgtggtcacagggtataggatgcacaataggggg
tggaaatcggtgtattgtgtgaccaagcgtgatgctttccgaggaacagctcctatcaat
cttaccgataggctccatcaggtcctgcggtgggctactggttcagttgagattttcttc
tcccgcaacaatgcccttcttgccagtccaagaatgaagcttctgcagagaatagcatac
cttaatgttggcatctacccctttacttccatcttcctgattgtatactgctttctccca
gcactctcgcttttctctggccagttcattgtccagaccctcaatgtcactttccttgtc
tacctccttgttatcactttgactctatgtatgcttgctattcttgagattaaatggtct
ggcattgagctagaggaatggtggaggaatgagcagttttggttgattggagggactagt
gctcaccttgctgctgtgcttcagggacttctaaaagtccttgctgggattgaaatttct
ttcactttgacatcaaaatcaggaggtgatgatgtggatgatgagtatgctgatctctat
gtagtcaaatggacatccttgatgataccaccaatcacaatcatgatggtcaacttaatt
gctattgctgttggatttagccgaacgatatacagtactataccacagtggagcaagtta
ataggtggtgttttcttcagtttttgggtcctggctcatctctaccctttcgccaaaggg
ctgatgggacgaagagggaggacaccgaccattgtttttgtatggtcaggactcattgca
atcacaatatccctcctttgggtggcaatcagtcccccttctagcactgatcaaattgga
ggctcattccagttcccctga
DBGET
integrated database retrieval system
