KEGG   Castanea sativa (European chestnut): 142630567
Entry
142630567         CDS       T11266                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC142630567
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
csaa  Castanea sativa (European chestnut)
Pathway
csaa03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:csaa00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    142630567
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:csaa03019]
    142630567
   03041 Spliceosome [BR:csaa03041]
    142630567
Messenger RNA biogenesis [BR:csaa03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     142630567
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     142630567
Spliceosome [BR:csaa03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    142630567
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 Mit_ribos_Mrp51
Other DBs
NCBI-GeneID: 142630567
NCBI-ProteinID: XP_075660691
LinkDB
Position
4:34531091..34535595
AA seq 314 aa
MAFLSKVGNLLRQAASKQISSEFGASKPSFFQAIRCMSSMSSSKLFIGGLSYGTDEQSLK
EAFAKYGEVVEARIIMDRETGRSRGFGFVTYVSSEEASSAIQALDGQDLHGRRVRVNYAT
DRARPSYGGGGYGGGGYGGDGGYGNNAYGGGGGGGYGNNAYGGSGGSGGSGGGYGNNSYD
GAASGGYGTGSSGYGSGGNYQGGGGGTGSGYSGGGVGYSSGGNYASGNSGGYGNTGGNFD
VSGGSGNFASGDGSSIAGSGFEGSTGQGFGGVDQFGTNEGSSVDGAAGDFDKDASLEGNF
RDEDDDTGDFAKRA
NT seq 945 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctttcttaagtaaagttggaaatctgcttagacaggctgcgagcaagcagatcagc
tcagaatttggtgcctcaaaaccgtctttctttcaagccatacgatgcatgtcatccatg
tcaagctcaaaactttttattggaggtctttcatatggcacagatgagcaaagtttgaag
gaagcttttgctaagtatggagaagttgttgaagcaagaatcattatggatcgtgagact
ggtagatccagaggatttggctttgttacatatgtttcaagtgaggaggcctccagtgct
atccaggccttagatggacaggatctccatggtcgtcgggtaagggtgaattatgctact
gatagggctcgtcctagctatggaggtggtggctatggtggtggtggctatggtggtgat
ggcggctatggtaacaatgcttatggcggtggtggtggtggcggctatggtaacaatgca
tacggtggcagtggcggcagtggcggcagtggcggcggctatggtaacaattcttatgat
ggtgctgccagtggaggctatggcactggtagtagcggatatggttcgggtgggaattat
caaggaggtggtggtggcactggtagtggctacagtggaggtggtgttggttacagcagt
ggtggcaattatgccagtgggaacagtggaggctatggcaatactggtgggaattttgat
gtttctggcggtagtggtaactttgcctctggggatggcagtagcatagctggtagtgga
tttgaaggaagtactggacagggctttggtggtgttgatcaatttggtaccaatgagggc
agcagtgtggatggtgcagctggagactttgacaaagatgcttctttggaaggaaacttc
agggatgaggacgatgacactggtgattttgccaaaagggcctga

DBGET integrated database retrieval system