KEGG   Castanea sativa (European chestnut): 142640290
Entry
142640290         CDS       T11266                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X1
  KO
K14411  RNA-binding protein Musashi
Organism
csaa  Castanea sativa (European chestnut)
Pathway
csaa03015  mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:csaa00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    142640290
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:csaa03019]
    142640290
Messenger RNA biogenesis [BR:csaa03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     142640290
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 RRM_11
Other DBs
NCBI-GeneID: 142640290
NCBI-ProteinID: XP_075670470
LinkDB
Position
6:28620017..28627193
AA seq 477 aa
MQSDSGKLFIGGISWDTNEERLKEYFSSYGEVVEAVIMKDRTTGRARGFGFVVFADPTVA
DRVIKEKHNIDGRMVEAKKAVPRDDQNILSRSSGSIHGSPGPGRTRKIFVGGLASTVTES
DFKKYFDQFGTITDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYDSEEAVDKVLIKSFHELNGKMVEVKR
AVPKELSPGPSRSPLGNYYGLNRVNNLLNGYPQGYTPTTVGGYGLRMDGRFSPVAGGRSG
AFPPFGSGYGMGVNFEPGLSPGFGGSANFSSNLSYGRGLNPYYGNSNRFTSPLAYDGGNG
GSTSFFSSMTRNLWGSGGLNYGTSSASSSAYLGSGSGSIGGSTFGNTGVNWGSLGISAQG
GGSNAPNNSGNFGYGGGDDSYGLGTGGYGRNSGTNTAPTSSYAASTGGFDGDFADFYNSG
SVYGDTTWRSSNAERDGSGPFGYGLGSAAPDVSAKTSPSYVGGYSVNKRQSNRGIAA
NT seq 1434 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaatctgatagtggcaagttatttattggtgggatatcttgggacacaaatgaagag
cgtctcaaggagtattttagttcatatggtgaggtggtagaagctgttattatgaaggat
cggaccacaggtcgtgctcgaggttttgggtttgttgtttttgccgacccgactgttgcg
gatagagtcataaaggagaagcacaacatagatggaaggatggttgaggcaaaaaaggct
gttcctagggatgaccaaaacattttgagtagaagcagtggtagcatccatggctctccg
ggtcctggccgcactagaaagatatttgttggaggtttagcatccacagtcacagagagt
gacttcaagaagtattttgatcagtttgggacaatcactgatgttgtggtgatgtatgat
cacaacacccagaggcctagaggctttggattcatcacttatgattcagaggaagcagtg
gacaaggttttgatcaagagttttcatgaactaaatggtaaaatggttgaggtcaagcgt
gcagttcccaaagagttatcacctggtcccagtcgcagtccacttggtaactactatggt
ttgaatagggtcaataacttacttaatggctaccctcaaggatatactccaactacagtt
ggaggatatggacttaggatggatggtagattcagtccagttgctggtggccgaagtggt
gcttttcctccatttggttctggttatggaatgggtgtgaattttgagccagggttgagc
ccaggttttggggggagtgcaaattttagtagtaatctcagctatggacggggattgaac
ccttattatggtaattcaaataggtttactagtccacttgcatatgatggtggtaatgga
ggaagcacttcctttttcagctctatgactcggaatctgtggggtagtggggggcttaat
tatggcacaagctctgcaagttccagtgcatacctgggatcaggaagtgggagcattggg
ggaagcacatttggtaatactggagttaattggggttctttgggaatctctgctcaaggt
ggaggtagcaatgcccctaacaatagtggaaattttggttatggaggtggtgatgacagt
tatggtttgggaacgggagggtatggaagaaacagtggtaccaatacagccccaacatca
tcttatgctgcatcaacaggtggttttgatggggactttgcagacttctataatagtggt
tctgtatatggggacaccacttggcgatcatcaaatgctgaacgagatgggtctggtccc
tttggttatggacttggcagtgcagctcctgatgtttctgctaaaacttcacctagttat
gttggtggttatagtgttaataagagacagtcaaatagaggaattgctgcgtag

DBGET integrated database retrieval system