Camelina sativa (false flax): 104728116
Help
Entry
104728116 CDS
T05044
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
csat
Camelina sativa (false flax)
Pathway
csat03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csat00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
104728116
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
csat03019
]
104728116
Messenger RNA biogenesis [BR:
csat03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
104728116
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104728116
NCBI-ProteinID:
XP_019087447
UniProt:
A0ABM1QL09
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(18805047..18806910)
Genome browser
AA seq
334 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFVGGISWETDEDKLKEHFSNYGEVSQAIVMRDKLTGRPKDEEFRQYFEVYGP
VTDVAIIYDQATNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTFHDLSGKQVEVKRALPKDANPGGA
GRSMGGGGSGGYQGYGGNESNYDGRMDSNRFMQHQNVGNGLPSYGSSGYGAGYGNGSNGT
GYGGFGYTGSAGGYGAGAAAAYGATSIPGAGYGSSTGVAQRNSWDNPAPSGYGNPGYGSG
AAHSGYGVPGAAPPAQSPSGFSNQGYGYGGYSGNDSGYGNQASYGAVGGRPSGGASNNPG
SGGYMGGGYGDGSWRSDPSQGYGGGYNDGQGRQG
NT seq
1005 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaaggaaagctttttgtcggtggtatctcatgggaaactgatgaagac
aagctcaaagaacatttcagcaactatggagaggtttctcaggccattgtgatgagagac
aagcttactggccgacctaaggatgaagagtttcgccagtactttgaagtctatggccct
gtgactgatgttgcgatcatatatgaccaggctactaaccgacctcgtggttttggattt
atttccttcgactctgaagatgctgtagaccgtgtgttgcacaagactttccatgatttg
agcggtaagcaagttgaggtaaagcgtgctcttcctaaagatgccaatcctggaggtgct
ggacgatcaatgggtggtggtggctctggcggttaccagggttatggtggcaatgaaagc
aattatgatggacgtatggattccaataggtttatgcagcaccaaaatgttggaaatggt
ttaccatcttatgggtcttctggttatggtgctgggtatggaaatggtagtaatggtacc
gggtatggtggctttggatacactggttctgctggaggttatggtgcaggtgctgctgct
gcatatggagcgaccagcatcccaggtgccggttatggaagtagtactggagttgcccag
agaaactcatgggacaatccagctcctagtggttatgggaacccaggttatgggagtggt
gctgctcatagtggatatggagttcctggtgcagctcctcctgcgcagtcaccatctggc
tttagtaaccaaggctacggatatggagggtacagtggaaatgattctggttatggaaat
caagcttcatatggtgcagttggtgggcgtcctagtggtggcgcttcaaacaaccctggt
agtggtggctacatgggaggcggttatggtgatggatcttggcgatctgacccgtcacaa
ggttatggtggtgggtacaatgatggtcagggtcgacaaggctag
DBGET
integrated database retrieval system
