KEGG   Camelina sativa (false flax): 104732771
Entry
104732771         CDS       T05044                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2 homolog 1-like isoform X1
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
csat  Camelina sativa (false flax)
Pathway
csat03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:csat00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    104732771
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:csat03019]
    104732771
   03041 Spliceosome [BR:csat03041]
    104732771
Messenger RNA biogenesis [BR:csat03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     104732771
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     104732771
Spliceosome [BR:csat03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    104732771
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 RRM_Nup35 SF3a60_bindingd
Other DBs
NCBI-GeneID: 104732771
NCBI-ProteinID: XP_010450655
UniProt: A0ABM0V4J9
LinkDB
Position
12:complement(28000887..28003303)
AA seq 423 aa
MDPYGTETVIEDEIQDPKPSDDVEDDDDKSQPHSSGGVDSAGKIFVGGLARETTSAEFVK
HFEKYGEITDSVIMKDRKTGQPRGFGFVTYADVSVVDKVMEDNHIIIGKQVEIKRTIPRG
SVSSNDFKTKKIFVGGIPSSVDDDEFKEFFMQFGELKEHQIMRDHSTGRSRGFGFVTYES
EDMVDHLLAKGNRIELSGTQVEIKKAEPKKPNSVTTPSKRFGDSRSNFGGGYGDGYGGGH
GGGYGGPGGPYKSGGAGYGGGRSGGYGGYGGEFGGYGGGGYGGGVGPYRGEPALGYSGRY
GGGGGGGYNRGGYGMGGGAGYGGGPGDMYGPPYGEPGGGYGGPSGSYGGGYGSSGIGGYG
GGMGAAGGGGYRGGGYDMGGLGGGGGGGYNGGGGSGGGSFYGGGGSRGGYGGGGSGRYHP
YGR
NT seq 1272 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatccttatggaacggaaacagttatcgaagatgaaatccaggatcctaaaccatcc
gatgatgttgaagacgatgacgacaaatctcagcctcactctagtggcggcgtcgatagt
gctggaaagatatttgttggaggtttagccagggagacaacttcagctgaattcgtcaag
cattttgagaagtatggagagatcactgattctgtcattatgaaggataggaaaactgga
cagcctcgtgggtttgggtttgtcacatatgctgatgtctctgtggtcgacaaagttatg
gaggacaatcacattatcattgggaagcaggttgaaattaagcggacaataccaagagga
tccgtgagctctaatgatttcaaaaccaagaagatatttgttggtgggattccttcatct
gtggatgatgatgagttcaaggaattctttatgcaatttggagagctgaaggaacatcag
attatgcgtgatcattcaactggaagatcacgtggctttgggtttgttacatatgaaagt
gaagatatggtagatcatctcttggccaaagggaacagaattgagctctcagggactcag
gttgagataaagaaggctgagccaaaaaaaccgaactcagttacaaccccgtcaaagcgg
tttggtgactctcgctctaactttggtggaggttatggagatggttatggtggcggacat
ggtggcggatatggtggtccaggtggtccttacaaatcaggtggtgccggctatggaggt
ggccggtctggtggttatggaggatatggaggagaattcggtgggtatggtggtggtgga
tacggtggtggcgtgggaccttatagaggagaaccagcacttggatattctggtcgttat
ggaggaggtggcggtggtggttacaacagaggtggttacggtatgggaggaggcgctggg
tacggtggtggacctggtgatatgtatggcccgccatacggtgaacctggaggtgggtat
ggtggaccaagtggcagttatggtggcggttatggtagtagcggtattggtggatatggg
ggtggaatgggtgctgctggtggcggaggctatagaggtggtggctatgacatgggtgga
cttggaggtggaggcggaggaggttacaatggaggtggaggaagcgggggaggctcattt
tatggaggaggaggaagtagaggtggatatggaggcggtggcagcggacggtaccatcct
tatggaaggtag

DBGET integrated database retrieval system