KEGG   Camelina sativa (false flax): 104747709
Entry
104747709         CDS       T05044                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC104747709
  KO
K12825  splicing factor 3A subunit 1
Organism
csat  Camelina sativa (false flax)
Pathway
csat03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:csat00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    104747709
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome [BR:csat03041]
    104747709
Spliceosome [BR:csat03041]
 Complex A
  U2 snRNP components
   U2 snRNP specific factors
    104747709
 Complex B
    104747709
 Complex C
   U2 SnRNP specific factors
    104747709
SSDB
Motif
Pfam: Surp
Other DBs
NCBI-GeneID: 104747709
NCBI-ProteinID: XP_010467694
LinkDB
Position
15:complement(27565060..27567748)
AA seq 756 aa
MDLNMDNNIFGYMKNSEHPCHALYQLKLAGYRSQQNQGGGSQEPVCDAKSYLEPLPLKEP
PGCASPFPKEIELGVIKFTALFVARYGDIFRESLMETVVMSPRFDFMKPSDSNFALYDAL
VVSYSGVLKPSSNGAMVDSLLDCYFNSLQLEELEEGVETAAIDLHAFVGGLDCFAHMDDA
VSPPERRSMMMQWPMQPQPDGLATHECLGDAETDLPPRPPIRITLKELGIIKLTSQFVAR
YGMRFCRALMMRVAMNPLFEFMFFRPSLRKKTVLMNPPFEFMDPTEIRFNIFTVLVDAYS
RVLVRSKKLKKSDACTRAVLLKDFFNCLQLERLENGVEETALIDLHAFVAGVDCFAHMDV
ADYSATMPPPERLSVMMNRLTQQSQPPDMLLQLPLGSQLANLGVGKQYECIGDTSFRAPT
LRSLTFRVPAMGITLKELGIIKLTAQFVARYSSEFSRAVEKIASFEFLDPYDSRFDFYVG
LFTAYRKVLKSSIKPDVCMLSTVLEGFHQRLRLWELHKGVEELAMIDLHAFVGGVDCFAH
MEDKDYSAIMDPPERTSMMINQLTQRQPPTHHECLRRGYDFPYAFGAKITLKELGIMKFT
ALFVARYGMHFCHDLMKEVVMKPQFKFMEPTNSMFSLYSVIVDAYSRVLEPSDDACTKIV
LEDFFCRLRLDKLESEEEAMIDLHAFVNGVDYFAYLEDADYSALMPPPDLLSVIMNGIPG
IHKREITVSSERLPLDGMQPEAKRQKFDESALVPED
NT seq 2271 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaccttaatatggacaataacatattcggttatatgaagaactcagaacacccttgc
cacgcattgtaccagcttaagcttgctggataccgttctcagcagaatcaaggaggtgga
tctcaggagcctgtatgcgatgcaaaatcctaccttgagcctcttcccttaaaggagcct
ccgggttgtgcatctccgtttcccaaggagattgagcttggtgttattaagttcactgcc
ctgtttgtggctcgttatggggatatttttcgtgagtctttgatggagacagtggttatg
agccctcggtttgactttatgaagccatctgatagcaacttcgctctttatgatgcgctt
gtcgtttcgtattcaggggtattaaaaccttccagtaatggtgcaatggtagactccctt
cttgattgttatttcaacagtctccaattagaggagctggaggagggtgtggagactgct
gcaattgatttgcatgcttttgtgggtggtcttgactgctttgctcacatggacgatgct
gtgtcaccacctgaacgccgttcaatgatgatgcaatggccaatgcagcctcaacctgat
ggtttagctactcatgagtgtctaggcgatgcagaaaccgatctaccgcctcgtcctcct
ataaggatcacactcaaggagcttggtattattaagctcacatcccagtttgtggcgcgg
tatgggatgcgtttttgccgagctttgatgatgagagtggctatgaaccctctgtttgag
tttatgtttttccgcccgtctctgagaaagaagacagtgcttatgaaccctccgtttgag
tttatggatccaacagagatcaggttcaatattttcactgtgcttgttgatgcgtattcc
agagtactagtgcgttccaaaaagctgaagaagagtgatgcttgtacgagggccgttctt
cttaaggacttttttaactgtcttcaattagagaggctggagaatggagtggaggagact
gctttaattgatttgcatgcttttgtggctggtgttgactgttttgctcacatggacgtt
gctgactactctgctaccatgccaccacctgaacgcctttcagtgatgatgaaccggtta
acacaacaatctcagccgcctgatatgcttttgcagcttccattgggatctcagcttgct
aatctcggtgttggtaagcaatatgaatgcataggcgatacttctttccgtgctcctact
ctaagaagcctaacatttagagtccctgctatgggtatcacactcaaggagcttggtatt
attaagctgacagcacagtttgtggcgcggtatagctctgaattttcccgtgctgtagag
aagatagcatcgtttgagttcttggatccttacgatagccgtttcgatttttacgtgggg
ctgtttactgcgtatagaaaagtgttaaagtcttctatcaagcctgatgtttgtatgttg
tcgaccgtgcttgagggttttcaccaacgtcttcgattatgggagctgcataagggagtg
gaggagctagctatgattgatttgcatgcttttgtgggtggggttgactgttttgctcac
atggaagataaagactattctgctatcatggatccacctgaacgcacgtcgatgatgatt
aaccagctaacacaaaggcagccacctactcatcatgagtgtttaagacgtggatatgat
tttccatatgcttttggtgctaagatcacgctcaaggagcttggtattatgaagttcaca
gctctgtttgtggcgcgttatgggatgcatttttgtcacgatttgatgaaggaagtggtt
atgaaacctcagtttaagtttatggagccaactaatagcatgttcagtttatatagtgtg
attgttgatgcgtattccagagtattagagccttccgatgatgcttgtacaaagatcgtt
cttgaggattttttctgccgtcttagattggacaagctggagagcgaagaagaagctatg
attgatttgcatgcttttgtgaatggtgttgactattttgcttacttagaggatgccgac
tattctgctttaatgccaccacctgatctcctttcagttatcatgaacgggatacctgga
atacacaagagggaaataacggtttcaagtgagcgccttccactggatggtatgcaacca
gaggcaaagagacaaaagtttgacgagtcagctcttgttccagaagactag

DBGET integrated database retrieval system