Capilliphycus salinus: ACL6C3_19835
Help
Entry
ACL6C3_19835 CDS
T10919
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin N-terminal domain-containing protein
Organism
csau Capilliphycus salinus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XNO68227
LinkDB
All DBs
Position
complement(4908182..4912240)
Genome browser
AA seq
1352 aa
AA seq
DB search
MVQHPLLDLSLFTGLIVLSSIIPVLPAQAQIVPDNSLGSENSVVTPNVNIRGINSDRIDG
GAVRGGNLFHSFQEFNVEVGRGAYFSNPDNIVNILTRVTGDNISQILGTLGVLGNANLFL
INPNGIVFGPNARLDVGGSFFATTADGILFENGFEFAASNPAAPPLLTINMPVGLNIREN
PGTIVNQAAPQLVRPDGSALRNDAGFLISQGLNVPQNQTLALVGGDVLFDNGFAISPGSR
IQLGGLSEPGIIQINPDNSLSFPDNIQRGNVALTNESEINVRGNGGGDVNINARNVEISG
DSVIRVGIDQGLGFLEAQAGDVNINAQENILLTGAGSSIRNAIDTNGIGQSGNINITANS
LRMNNGAFINTLIFGQGNAGNINVKAASVEASGTSPNGEFRSGFFADVNDTGMGNGGNIQ
IETGQFRLTEGARIQIALFGQGNAGSLSILATDSVELSNSSILGEIAENAVGSGGNLEIS
TSSLNATNGQISLSASGNGNAGNIYLEAQNINLSNSIVFGETSGTDNIGNITIDTGTLVL
RDGADIRLDVNPEATGSTGNITVNASESIEIIGVSPTGITSRIATRTLGNGSAGSVIINT
PRLAVRNGGTIFASSFNTGQAGDVIINASESIEVRGGSPFQFDPESVEFGTEPSIPLEDA
TAIFSDISTSSDNVEGSAGSVFITTNKLTLQEGGEIGTSATGRGSSGVVQVKANEVEIAG
ELSINGLNSSSGLEVFTNGAGTAGTLNLETGRLTIRDGGNISVRSLNGSSAGSINIQASV
VELIGEGRFPSENGETIFPSGIFVTTGTLSGGSRVGSITLEADQLRILNGAQISTFSGDV
GSSGSINIRANTIEISGRGTRTVTLSTGEIGIGSQIAAQAGNGGNTGDISITTQRLIGQD
GALIRTDSSGTGSSGSISIQSQEVIFDDQVNISSGTAGAGNGGNITIETEQLRVQNGSII
SSGISLPIESEITTVEIPPNRRGGTVLIKASESINVEGEGTAIFTGGSEGAIGNGGNIII
ETGDLTVNNRASLSTGTLGNGNAGFINIQAENIELTDRAFVNALVAETAVGNGGTITIDA
EQLIVRDQSNIFVNSRGVGNPGNIDVSASQVRLEQGGLFAESVTGEGGNIAINSPDIRVR
ESQISAAGSQSGQTFDGNIDINSNLLVLLENSQIVTSAFDPTGGSNINIRPFESAELGLL
QSQNSIINAAGEVSIDTTLNFDPPESLEVTVVDPAELIAQDPCKQRGDSQFIITGRGGIA
PNPVQDSSAIPGLIELESPLIQPVTPQANTSSEPPQQQSENSDNNTVDSRTIVPARGWVR
DENGNVLLVGYDPTNMGVQRQRPNPQTCQPGS
NT seq
4059 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtacagcatcccctcctagacctgtccttattcacgggtttaattgtcttgagttct
attattcccgttctacccgcacaagcacaaattgttcccgataacagcttgggttcagaa
aactccgttgttactcctaatgttaatattcgcggaataaatagcgatagaattgacggg
ggagcggttcgaggaggtaatttatttcatagttttcaagaatttaacgtcgaagttgga
cggggtgcttatttttccaaccccgacaatattgttaatattttaactcgcgttaccggg
gataacatttcacaaattctcggaacattgggggttctcggaaatgctaatttattttta
attaatcccaatggaattgtatttgggccgaacgcacggttagatgtgggcggttcattt
tttgccacaacagccgatggtattttatttgaaaatgggtttgaatttgcagcaagtaac
ccagcagcgccgccattattaacgattaatatgccggtcgggttaaacattagagaaaat
cccggaacaatagttaatcaagccgcaccccaactggttcgacccgatgggagtgcgtta
agaaatgatgcaggatttctaatttcgcaaggcttaaatgttcctcaaaatcaaacttta
gcattagttgggggagatgtattatttgataatggctttgcaatttctccaggaagtcga
attcaattggggggattatcagaaccgggaattattcaaattaaccccgataatagttta
agttttcccgataatattcaacggggaaatgtagcgttaaccaatgaatcagaaataaac
gttcgtggaaatggaggcggagacgttaatattaatgcgagaaatgttgagatatctggc
gatagtgttattcgggtgggaattgatcaaggtttagggtttctagaagcgcaagcggga
gatgttaatattaacgctcaggaaaatattctcctaacaggtgcaggaagttcgattaga
aatgctatcgataccaatggaattggtcaaagcggaaacattaacatcacagctaattcg
ctcagaatgaataatggagcgtttatcaatacacttatttttggacaaggaaacgcaggg
aacataaacgtaaaagccgcatccgttgaagcttcaggtacttctcctaatggtgagttt
cggagtggtttttttgcggatgtcaatgatacaggtatgggtaatggaggtaatattcaa
atcgaaaccggacaatttcgactaactgaaggagcgcgaattcaaatcgctctatttgga
caaggaaatgcgggttctctatcaattttagcaaccgattcggtagagctatcaaacagt
tctattttgggtgaaatcgcagaaaatgcagtgggaagtgggggaaatcttgaaatttca
acctcatcgctaaatgcaacaaatggacagattagtttaagtgcatcaggtaacggaaac
gcaggaaatatttatcttgaagcacagaacatcaatctttcaaattctattgtattcggc
gaaacttccggaaccgataatattggaaatattacgattgataccggaactttagttctt
cgagatggtgctgatattcggcttgatgttaacccagaagcaacaggttcaacgggaaac
ataactgttaatgcttcggagtctatagaaataataggagtctcaccgactggcattacc
agtcgaattgctactcgaacattaggtaatggtagtgcaggaagcgttattattaatact
cccagattagccgttcggaatggagggacaatctttgctagtagcttcaacaccggacaa
gcaggagatgtgattattaatgcttcagaatctatagaagttaggggaggaagccccttt
caatttgatccagaatccgttgaatttggtacagaaccctctattccacttgaagatgcc
actgcgatttttagtgacatatcaaccagcagtgataatgtagaaggaagcgcaggaagt
gtttttatcaccacaaataaactcacacttcaagagggaggagagattggaacttctgct
acaggaagggggagttcgggtgttgtacaagttaaagcaaatgaagtggagatagcagga
gagttgagtataaatggactgaattcaagcagtggcttggaggtttttaccaatggtgca
ggaaccgcaggaactctcaacttagaaaccggacgattaaccattcgagatggaggtaat
atatcagtaagaagtttaaatgggagtagtgctggctctatcaatattcaagcttctgtt
gttgaattaattggagaaggaagatttcccagtgaaaatggagagacaatatttcccagt
gggatttttgtgacaacaggtacactatcaggcggtagtagggtgggaagtatcacactc
gaagcagaccaattaagaatactcaacggagcgcagatatcaactttttcaggggatgta
ggcagttcgggttcaattaatattcgtgcaaatactatcgaaattagcggaaggggaact
cgaacagttaccttatcaaccggagaaatcggaataggtagtcaaattgctgctcaagcg
ggtaacggaggaaacaccggagatatttcaattacgacacaaagattaatcggacaagat
ggagcattaattcgcactgatagttcgggaacaggttcttcaggttcaattagtatacaa
tctcaagaggttatatttgatgatcaagttaatatttctagtggaacggcaggtgcgggt
aatggaggaaatattactatagaaacggaacaactaagagtgcaaaacggctctataatt
tcttcaggaattagtttacccattgaatcggaaattactactgttgaaattcccccaaat
cgccgaggaggaacggtcttgattaaagcgtcagaatcgattaatgtagagggcgaagga
acagcaatttttactggaggttcggaaggagccataggaaatgggggaaatattattatt
gaaactggagatttaaccgtaaacaatcgagcttcattgtctacaggaactttaggtaat
gggaatgcgggttttataaatatacaggctgaaaatattgaattaacagatcgagctttt
gtcaacgcattggttgctgaaactgcggtcggaaatgggggaacgataactattgatgca
gaacaattaatagttagagatcaatctaacatttttgtaaatagtcgcggtgttgggaat
cccggaaatatagacgtgagtgcttcccaagttcgcttagaacaagggggtctatttgca
gaatcagtaacaggtgaaggcggaaatattgctatcaattcaccggatattcgagtgcgt
gaaagtcaaatttcggcagcaggaagtcaaagcggtcaaacgtttgatggaaatattgat
attaattctaatttgttagtgttgttagaaaatagccaaattgttaccagcgcctttgac
cctaccggaggaagtaatattaatattcgtccttttgaaagtgccgaacttggacttctt
caatctcaaaatagtattattaacgcggctggagaagtttctatcgatacaacacttaat
tttgaccccccagaatcattagaagttacagttgttgacccggctgaattaatcgctcaa
gacccctgcaaacagagaggagacagccaatttattatcaccggacggggaggaatagca
ccaaatcccgttcaagattcatcggcaattcctgggttaattgagttggaatctcctctc
attcaacccgttactcctcaagccaatacttcatcagaacctcctcaacaacaatcagaa
aattctgataataatacggtcgattcaagaacaattgttccggcgaggggttgggtaaga
gacgaaaatgggaacgtgttattagtcggttatgacccgacaaacatgggagttcagcgt
caacgccctaatcctcaaacttgtcaacccggaagttga
DBGET
integrated database retrieval system
