| Entry |
|
|---|
| Name |
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase UPL4 isoform X1
|
|---|
| KO |
|
|---|
| Organism |
csav Cannabis sativa (hemp)
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:csav00001]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
115708653
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:csav04121]
115708653
Enzymes [BR:csav01000]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
115708653
Ubiquitin system [BR:csav04121]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
115708653
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
3:complement(27935825..27943851)
|
|---|
| AA seq |
1590 aa
MGNRGQKRTETVEELPADKRACNSLEFRPSSSNSSVQTHMNSTNSTAETGDHDMDTSSSA
SASSRSEGEPEKDSTYGSCDSDDAEQRHSELRDYQRRRSSGDHGKFKRILSVLNEETDES
GQLVVLTELCEVLSFCTENSLSSMTADSLSPYLVRLSRHETNPEIMLLAIRAITYLCDVY
PRSSGFLVRHDAIPALCQRLMAIEYLDVAEQVNLMFSFVFILGIYVFCVCLNTLLIYIKC
LQALEKISREQPLACLQAGAIMAVLSFIDFFSTSIQRVALSTVMNICKKLPSECPSPFME
AVPILCNLLHYEDKQLVENVALCLIRITDRVRKSSEMLDELCKHGLIEQTTHFINSSSRT
TMSLPVYNGLLGVLVKLCSGSTVAFKTLFELNISSILKDTLSNYDMSHGVSSPRTIDGQG
NQVYEVLNLINALLPASTGDQDAPELLDKESFLKNQPDLLKKFGMDILPSMIQVVNSGAN
LYISFGCLFVINKMIHLSTADLLVEVLKNANFSSFLAGVFTRMDPHVLILALKIAELVLQ
KLSDIFLDSFVKEGVLFAIDALLTSEKCPDLKQDKYSQLTVPVFCTTQVSSDSSQKSVFR
EARTCLCYTFATGSTASTVESNSCKLEKDSVYNIAMHIRTSYFSADLFDSNITLTDVLQE
LKSYSLALNDLLNIPMNNEAFDQHEERFYDILYQVIAKLNGSEPISTFEFIESGLVKSLV
NYLSDGQYLRKERECCVNHSNIHAMEKRFEAFAKVYLLSSDPLSQDSPLSAFILKLQNGL
SSLETFPVVLNNAKMRSSFAAVPSGRCIMYPSLTVRFVRGEGETGLSDYSEDYLTADPFS
SVGAIEGFLWPKVSSEVTKPLMQGSGQLQELPLQSLAPSSSSPDGSLDDRGSDSMLTDLA
EMQETHAALSQASHEQAATSSVVTPGAMSQESAEEVQFYPKADIDMERELSASRSGTDAL
RNLLFFLDGQLLERDLTLYQAIIQKKIRERETVASTRLWSQVYTLTYRKSVNKPYTIKEC
SCAVKKCGLSDTIKMYVQPTSFASSMFTSDLVDDLEKPSPTYDIMYLLKCLERMNRFCFH
LISQERMGAFAEGKLDDLDSLNVAAIPSVPQNEFVSSKLTEKLEQQMRDRMAVSVGGMPS
WCSQIMASCPFLFSFEARCMYFRLGAFGQSPLSHSDAATTIDRRVRSGGLSRKKFLVSRD
SILESAKQMMEQHARHKGLLEVVFNDEVGTGIGPTLEFFTLVSHEFQKTGLGMWRDDHGS
ASDTSWQLENKEFVMCPLGLFPHPWSSSTDVSDGTQFSGVMKNFELLGQILAKALHNGRV
LDLHFSKAFYKLILGQELGLFDIMSFDPELGRTLLEFKALADRKLFLDSTGGVVSTSNID
TCFRNTRIEDLFLDFTLPGYPDFCLASGPDYDTVTMRNLENYVSLVVDATLNGGISRQME
AFKLGFNQVFPIEQLQIFTEEELERLLCGEHNSWAADELVDQVKFDHGYTASSPPVVNLL
EIIQEFNKKQQRAFLQFVTGAPRLPPGGLASLNPKLTIVRKHCNGYVDADLPSVMTCANY
LKLPPYSSKERMKEKLLYAITEGQGSFHLS |
|---|
| NT seq |
4773 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgggaaatcgtgggcaaaagcgtacagaaacagtagaagaattgccggccgataaacga
gcctgcaactctctggagttcagaccgagttcatcaaattcatctgttcaaactcatatg
aattctactaattcaactgctgaaaccggtgaccatgatatggatacctcatcttctgct
tcggcctctagccggtcagagggagaacccgaaaaggattcaacatatgggtcttgtgac
tctgatgatgcagagcaaagacactctgagcttagagactatcagaggcggagatcttct
ggtgatcatggaaaattcaagaggatcttatcagttctgaatgaagaaacagacgagtct
ggtcagctagtcgtgcttacagagctatgtgaagtgctgtcattttgtacagagaattca
ctttctagcatgacagctgactccttatctccttatcttgtaaggctctcaagacatgag
actaacccagaaattatgctattggctataagagctataacttatctttgcgatgtttat
ccccgatcatcgggttttctggtccgacatgatgctattcctgctctttgtcaaagactg
atggcaattgaatacttggatgtggcagagcaggtaaacttgatgttttcctttgtgttt
atactaggaatatatgttttttgtgtgtgtcttaatacattgcttatctacattaagtgt
ttgcaagcattggagaaaatatcgcgggagcaaccactcgcttgtttgcaggctggtgca
ataatggctgtcctgagttttatcgatttcttctcaacaagcattcagagagttgctctt
tccactgtgatgaacatatgcaagaaacttccttctgaatgtccctccccttttatggag
gctgttccgatattatgcaatcttcttcattatgaagataagcagcttgttgaaaatgtg
gctctctgcttgattagaattacagacagagttaggaagtcttctgagatgctggatgaa
ctttgcaagcatgggttaattgagcagaccactcatttcataaactcaagtagccgaact
actatgtcactaccagtttataatgggttactaggggtactagtcaaactttgctctggt
tcaactgtagcattcaagactttgtttgagcttaatataagtagcatattgaaggatacc
ttgtctaattatgacatgtcacatggagtttcctctccacgtacaattgatgggcaggga
aatcaggtatatgaagttttaaacttaataaacgcgcttcttcctgcttcaaccggagat
caagatgcaccagaattattggataaagaatcatttctcaaaaaccagcctgaccttttg
aaaaaatttgggatggatattcttccctccatgatccaggtggttaattctggggcaaat
ttatatatttcctttggttgcctttttgtaatcaacaagatgattcatttgagcactgct
gacttgcttgttgaagtgctcaagaatgccaacttttcaagtttcttggctggtgtattt
actagaatggatcctcatgttttgatcttggccctgaaaatagctgaattggttctccaa
aagctttcagatattttcttggactcttttgtgaaagaaggcgttctttttgccattgat
gccctgttaacatcagaaaagtgtcctgatttaaagcaagataaatattcacaattaacg
gtccctgtgttttgtacgacacaggtctcatctgattcgagtcaaaagtctgttttcagg
gaggctcggacatgcttatgttacacttttgctactggcagcacagcttcaacagtggaa
agtaatagctgcaagcttgaaaaggattctgtttacaatattgctatgcatataagaaca
agttatttctcagctgatttatttgactccaatataacattaactgatgttcttcaagag
ctcaaaagttattctttggcactaaatgatttgttgaacatccccatgaacaatgaggcc
tttgatcaacatgaggagaggttctatgatatattatatcaagtgatcgcgaagcttaat
ggaagtgagcccatctccacatttgagtttattgaaagtggacttgtcaaatcattggtt
aattacttgtcagatggtcagtatttgagaaaagaaagagagtgctgtgttaatcacagt
aatatccatgccatggagaaaagatttgaagcatttgcaaaagtgtatttgctttcatca
gacccactttctcaggactcgcccctatcagcattcatacttaaattacaaaatggacta
tcttctttggaaacatttcctgttgttttgaataatgccaagatgaggagctcatttgct
gctgttccaagtggccgttgcataatgtatccatctctaacagttcgttttgtaagaggt
gaaggagagacaggcctcagtgactacagtgaagattatctgacagctgaccccttttcc
tcagtgggtgccattgaagggtttctgtggcctaaagtcagtagtgaagtgacaaagcca
ctgatgcaaggttcaggccaattacaagagctgccacttcaatcattagcaccttcaagt
tctagcccagatggaagtctggatgacaggggatcagacagcatgttgacagatttggct
gagatgcaggagactcatgctgctttgtcacaggcttcccatgaacaagcagccacttct
agtgtggtaacccctggagcaatgtctcaggaatctgcagaggaagtacagttttatccg
aaggcagatattgatatggaaagggaattgtctgcatctaggagtggtacagatgctttg
cggaacctgttatttttccttgacgggcaactgctagagagggacttgactttataccag
gcaattattcaaaaaaaaattagagagcgtgaaactgttgccagcacgagattgtggagc
caagtttacaccttaacatacagaaaatctgtaaataaaccttatactattaaggaatgc
tcttgtgcagttaaaaagtgtggtctatctgacacaatcaagatgtatgtgcagccaact
tcatttgcctccagcatgttcacttctgatcttgttgatgacttggagaaaccgagccct
acttatgatataatgtatctgctgaaatgcttggaaaggatgaacaggttttgttttcat
ctgatatctcaggaaagaatgggtgcttttgcagaaggaaaacttgatgatttggatagt
ttaaacgtagcagcaataccttcagtgccgcagaatgagtttgtaagtagtaaactgaca
gaaaaactagaacagcagatgcgtgaccgaatggctgtgtctgttggtggtatgccttca
tggtgcagtcagataatggcctcatgtccctttctgtttagttttgaggcaagatgcatg
tactttcgtttgggagcatttggtcagtcgccgctatctcatagtgatgcagccaccaca
attgacagacgagtaagatctggtggcctgtctcgtaaaaagtttttggtttcccgtgat
agcattctggaatctgctaaacaaatgatggaacagcatgcccgccataaaggactactt
gaggtagtgtttaatgatgaagttggcaccggtattggtccaacattggaattctttacc
ttggttagccatgaatttcagaagactggactgggcatgtggagagatgatcatggatct
gcttctgatactagttggcagcttgagaataaagagtttgtgatgtgccccttgggtcta
tttcctcacccatggtcatcttctaccgatgtatctgatggaactcaatttagtggcgta
atgaaaaactttgaactcctgggacaaattttagcaaaggctcttcataatggacgagtt
ttggatcttcacttctcaaaagctttctataagcttattcttggacaggaacttggtttg
tttgatatcatgtcatttgatcctgagcttggaaggacattgctagagttcaaagctctt
gcagatagaaaactctttctggattccactggtggagttgtttccacttctaatattgat
acatgcttccggaataccagaatcgaggatcttttcctcgattttacacttcctgggtat
cctgatttttgtcttgcttctgggcctgattatgacactgtaactatgagaaacttggaa
aattatgtttcacttgttgtagatgcaactttaaatggtggaatttcaagacaaatggaa
gcttttaaattaggctttaatcaggttttccctatagagcaacttcagatctttactgaa
gaggaattagaacgcttactatgcggagaacacaattcttgggctgctgacgagcttgtt
gatcaagtgaagtttgatcatggatacactgctagcagtcctcctgtggttaatttgtta
gagataatacaagagttcaacaagaaacaacagcgagctttcttgcaatttgtgactgga
gcaccccgtttacctccaggaggtttggcatctcttaatccaaagttgactattgttcga
aagcattgtaacggctatgtagatgcagacctcccaagcgtcatgacgtgtgccaactat
cttaaactgccaccctactcgtcaaaagagaggatgaaagagaagctattgtatgcgata
acagaaggacaaggatccttccatctttcgtag |
|---|
