Cannabis sativa (hemp): 115718953
Help
Entry
115718953 CDS
T08987
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
csav
Cannabis sativa (hemp)
Pathway
csav03015
mRNA surveillance pathway
csav03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csav00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
115718953
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
115718953
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
csav03041
]
115718953
Spliceosome [BR:
csav03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
115718953
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115718953
NCBI-ProteinID:
XP_030503642
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(55085386..55089730)
Genome browser
AA seq
486 aa
AA seq
DB search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NT seq
1461 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagggatgtacggccaagacgccggagacggctatggaggaagtggtggaggtgga
tatggtggtggcggcggaggtggaggctatggaggcggtggacctggaggatatggaggc
gggggtggaggttatggaggaaagggcggtgatagtggttacggcggcggaggcagccgt
ggaggcggcggtcgaggtggtggaggttatggcggtggtggacgagggggtggaggagga
ggatatcaaggagatcgcggaggtagaggcggtgggggccgaggcggtcgcagtgggagc
ggccgagatggcgattgggtttgtcctaatcaaagttgtgcaaatgtaaactttgctaga
agagttgagtgtaacaagtgtggtgctccctcccctgctggagctggtggtgaccgtggg
ggcggtggtggtggtgatcgtgggggtggtgatcgtgggagtggtggttacagtagagga
gggagtggtggcggatatggtggaagtcgtggtggcagaggtgggggttacgatgggggt
agaaatgctaattacgatggaggtagaagtggtagttacgaagggggtaaagggagtagt
tatgatggtagtagaggtggaggcagtagagggggttcctatggtggtagccaaggcaga
gaagatagtggatttaaccaggctcctcctgccgcgcccccatcttatggtggaagtggg
gcaggtgggaattatcctccatcctataatagttatgggggaaatgccaattatggaact
gatgctgttcctcctccaacaagctatactggtggacctgcctcatatcctccatcttat
ggtggtagtgccggtggttatggtggtgatagtttaggcgatgcaaggggtggtggccgt
ggtccttcaggtggtcacaatggtggtggtgggtatggtggtgctggtaatcgtggtggt
tatggctctgctcctgcagaaaccccggccaaggtgaaacagtgtgatgacaactgtggg
gatacttgtgacaattctagaatatacatctcaaatttgccgcctgatgttacaattgaa
gaactcagagaactttttgggggcattggacaagtgggaaggatcaagcaaaaacgtggt
tacaaggatcagtggccttggaacatcaaaatctacacagatgatgcgggaaacaacaaa
ggagatgcttgtttggcctacgaggatccatctgccgcacattctgctggaggcttctac
aacaattatgatctgagaggatttaaaatcagtgttgcaatggcagagaggtcggcgcca
aagcctgcatttgagcatggtggtggtggtggtagaggtggatatgggggcggagacagg
cgcagggataattacagagatggtggaggttctgggccagataggcatcagcatggggga
aatcgctcgcggccttactaa
DBGET
integrated database retrieval system
