Cannabis sativa (hemp): 115723110
Help
Entry
115723110 CDS
T08987
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
csav
Cannabis sativa (hemp)
Pathway
csav03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csav00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
115723110
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
csav03019
]
115723110
Messenger RNA biogenesis [BR:
csav03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
115723110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115723110
NCBI-ProteinID:
XP_030508394
LinkDB
All DBs
Position
9:3195939..3199312
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKEYFENYGEVLQTVVMREKFTGKPRGFAFVVFSDPSVL
DRVLQETHTIDGRTVDAKKALSREEQQTSARSGNPNPGRNAGGGGGGNMRTKKIFVGGLP
PTLSEEGFREYFESFGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPSGGGRSMGGGGGGGYQGYGASGGNQNSYDGRMDSSRFIQPQNTGGA
FPPYGSSGYGAPSYGYGPSNNGMGYGGYGNYASANTGYTSPASAAYGNPNAANPAYGSGP
PGGRSSWSGQNPAGYGAMGYGNTAPWGVTGSGTGAGNGSAPAGQSPSAAGYGTQGYGYSG
YGGSDGSYGNSAGYGAVGGRSGSGPNSGSGDLQGSGGGYLGGGYSDANGNAAWRSDPSQA
SGNYGAPQTNGQSGYAGAGYGSGQPRQAQQQ
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagctattcattggtgggatttcatgggaaaccacagaggag
aagctcaaggagtattttgagaactatggtgaagtgttgcagacagttgttatgagggaa
aagttcactgggaaacctagaggatttgcttttgttgttttttcagatccctctgtcctc
gatagggttcttcaggaaactcataccattgatggtagaacggttgatgctaagaaggcc
ttatcaagagaagagcaacaaacgtctgcacgatctggaaatcctaatcctggtagaaat
gctggtggtggcggtggtggaaatatgaggaccaagaagatttttgttggagggttacct
cctactttatctgaagagggatttcgtgaatattttgagtcctttggacatgtaactgat
gtagtagttatgtatgatcaaaatacaggacgaccaagaggttttggatttatttctttt
gattctgaagatgcagttgatagggttttgcataagacatttcatgatttaaatggtaag
caagtagaagtgaagcgagctcttcctaaagatgccaatcctagtggaggtggccgttcc
atgggcggcggcggcggcggcggctatcaaggatatggtgcatctggtggcaatcaaaat
tcatatgatggacgtatggattccagcagatttattcaacctcagaatactgggggtgct
tttcctccttatggctcttcagggtatggtgcgcctagctatggttatggtccttcaaat
aatggaatgggctatgggggttatggaaattatgctagtgcaaatactggctatactagc
ccagctagtgctgcctatgggaatcctaatgccgcaaatcctgcttatggaagtggtcca
ccaggtggccgaagttcatggagcggacagaatcctgctggatatggtgctatgggctat
ggtaatactgctccttggggcgttacaggcagtggaactggtgcagggaatggttctgca
cctgcaggtcaatcaccaagtgctgctggatatgggactcaaggttatggctacagtggg
tatggtggcagtgacgggtcctatgggaattctgctgggtacggtgctgttggagggcgt
tctgggagtggtccaaacagcggtagtggtgatctccaaggaagtggtggtggttaccta
ggaggtggctatagtgatgcaaatggaaatgcggcatggaggagtgatccatcacaagca
tctggaaattatggggctccacagaccaatggtcaatctggttatgctggtgctggttat
ggcagcggtcagccccgacaagctcaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
