Clostridium saccharobutylicum: CLSA_c17680
Help
Entry
CLSA_c17680 CDS
T02876
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
Organism
csb
Clostridium saccharobutylicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGX42762
UniProt:
U5MTH9
LinkDB
All DBs
Position
1971853..1975071
Genome browser
AA seq
1072 aa
AA seq
DB search
MKISKLEQIILHNSSKVNLNRAKHILNNKELLKFNISKIDNVYNIYGNFKSENKLQTCNT
HLKIDFVEEKIIFAKCNCSMFSEINYQNKTYLCEHLISTGLRFVEEVKKKLNNRTTNKDK
FRIDKNILNELDFFRCKDSNNLAEKEECGLKYKRKKLEINVSISEVKENNSKCFDVSFFV
GTNNMYSITNIKEWAESIINSKEYYIGKGLVYTPKKYYFSKADEELLEYIYEYTLFSDNE
NNERIIRIPNEILRRFLEKLLKKKIKLNYNYQTYITEVKDENVPLSFTLKQINDNYILTT
KKIFPIPLNEKMNVFFFDRKLFIPNKSQIEIYKIFYKHLKESGKITFYNDTTVEELNKII
SSLKLISDNLILDISVIEKLRENFKIDFKFKKQADKYICDVSFINDKEIISYCDALKSHN
DIISNWNKIRIIESELNKYSFFYRDDTFVFLGNDDDYYDFLKHGKESIQKIGSIKINDNE
KYFSFRNGNISEFFLQENEDGKYNFSFNLEGISKEELYNVVDSYKNKKSYIKLNDNTFIN
LGDASIIDTIRMIESLNIDVSDKKDTYELELGKIYYLNEKLNGDIKKIANSKETISNALE
KLNEIDENNSEIPKKFNGRLREYQIKGYNWFENLSYLGLGGILGDEMGLGKTIQTIVFLA
SKQGKHSLIITPTSLIYNWKEEFNKFAPSLSVGIVHGNKNERKKVLDNIEEYDGLLTTYG
TLRNDCLEYENIKFDYCILDEGQNINNPKAETTKIVKNINSKSRFILTGTPIENNLLELW
SLFDFIMPGYLYSKEEFSNKFIKKDKENLDDLKILIRPYILRRLKKDVIKELPDKIEKKF
LVELSLEQKKLYRSFIKDVQSKLQNPETRGNNMTIFSYLTRLRQICLDPSIIIDDYLGES
AKLNVAKDLIIKNIFRHKILLFSQFTTVLKRMEKELKQEKIDYCYIDGSTSSKNRIKFVD
EFNTNEQKRVFLISLKAGGTGLNLTSADMVIHFDPWWNPSVEEQATDRAHRIGQKHIVEV
IKLIAKDTIEEKIMLLQEDKKILINNIITEELEDINITSALKSEELLDLLLN
NT seq
3219 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaagatatcaaaattggaacaaataatattacataattcatctaaagttaatttaaat
agagcaaagcatatattaaacaataaggagttattgaagtttaatattagtaaaatagac
aatgtttataatatatatggaaattttaaaagtgaaaacaagctacaaacttgtaatact
cacttaaaaatagactttgtagaagaaaaaataatttttgcaaaatgcaattgtagcatg
ttttcagaaataaattatcaaaataagacatatttatgtgaacatttaatttcaacagga
ttaaggtttgttgaagaggtaaagaaaaaactaaataatagaacaaccaataaagataaa
tttagaattgataaaaatatattaaacgaactggatttttttagatgtaaagattcaaat
aatttagcggaaaaagaagagtgtggcttgaaatataaaagaaaaaagttagagataaat
gtttcaataagcgaagttaaagaaaataatagtaagtgctttgatgttagcttttttgta
ggaacaaataatatgtactctattactaatattaaggaatgggctgaaagtataattaat
tcaaaggagtattatattggaaagggacttgtgtatactcctaaaaagtattacttttct
aaagcagatgaagaacttttagaatatatatacgaatatacattgttttcggataatgag
aacaacgaaagaatcataagaataccgaatgaaattttaagaaggtttttagaaaaactt
ttaaaaaagaagataaaattaaattataattatcaaacatacattacagaggtcaaagat
gaaaatgtacctttgtcttttacattgaaacaaattaatgacaattatattttaactaca
aaaaaaatatttcctattccattaaacgaaaagatgaatgttttcttttttgatagaaaa
ctttttattcctaataaaagtcaaattgaaatatataaaatattttataagcacttaaaa
gaaagtggtaagattacattttataatgatacaactgtagaagaacttaataaaataatt
tcgtcattaaaattaatatctgataatttgatattagatatttcagtgattgaaaaatta
agagaaaatttcaaaattgattttaaattcaaaaagcaagcagataaatatatttgtgat
gttagttttattaatgataaagaaataatatcatattgtgatgctttgaagtcacataat
gatattataagtaattggaataaaattaggatcattgaaagtgaactaaataaatatagt
tttttttacagagatgacacttttgtttttttaggaaatgatgatgattattatgatttt
ttaaaacatggaaaagaatcaatacagaagattggaagcataaagataaatgacaatgaa
aaatattttagttttagaaatggaaatatatcagagttttttttacaggaaaatgaagat
ggtaaatataatttttcatttaacttagaaggtataagtaaagaagaattatataatgta
gttgattcgtataaaaataaaaagtcatatattaagcttaatgataatacatttattaat
cttggagatgcttcaataatagatactataagaatgattgaatctttaaatatcgatgta
agtgataaaaaagatacatatgaattagagttgggaaagatatattatttaaatgaaaaa
ttaaatggtgatattaagaaaattgcaaattcaaaagaaacaatatcaaatgcattagaa
aagttgaatgaaattgatgaaaacaatagtgagattcctaaaaaatttaatggtaggcta
agggaatatcagataaaagggtataattggtttgaaaatttaagctatttaggccttgga
ggaatcttgggcgatgaaatggggcttggaaaaacaattcaaactattgtatttttagca
tctaagcaaggaaaacattctctaattataacgccaacctctcttatatataattggaaa
gaagagttcaataagtttgctccaagtttaagcgtaggtattgtacatggaaataaaaat
gaaagaaaaaaagtattggataatattgaggaatatgatggtttgttaaccacttatgga
acattaagaaatgattgtttagaatatgagaatattaaatttgattactgtattttagat
gaaggtcaaaatataaataatcctaaagctgaaactacaaagatagtaaaaaatataaat
tcaaagagtagatttatattaacaggaactcctatagaaaataatttattagaattatgg
tcattatttgattttataatgccaggatatctttatagtaaagaagaattttcaaataaa
tttataaaaaaggataaggaaaatttagatgatcttaaaattctgattagaccatatata
ttaagaagacttaaaaaagatgtaataaaagaattgccagataaaatagagaagaaattt
ttagttgaattatccttagaacaaaagaaattatatagaagttttataaaagatgttcaa
agcaaattacaaaatccagaaacacgaggaaataatatgactatattttcttatttgaca
agacttcgtcaaatttgtttagatccatctataataattgatgattacttaggggaaagt
gcgaaattaaatgtagcaaaggacttaataataaaaaatatatttagacacaaaatttta
ttattctcacaatttactacagtattaaaaagaatggaaaaagagttgaaacaagaaaaa
atagattattgttatatagatggaagtacttcctctaaaaatagaattaaatttgtagat
gagtttaatacaaatgaacaaaaaagagtgtttttaatatcactaaaagctggagggact
ggacttaatttaacaagcgcagatatggtaattcattttgatccttggtggaatccatca
gtggaagagcaagctactgatagggcacatagaataggacaaaagcatatagttgaagta
attaagctaatagctaaagatacaattgaagaaaaaataatgcttcttcaggaagataaa
aaaatacttataaataatataataactgaagagcttgaagatattaatattacaagtgca
ttaaaaagtgaagaattgttagatttacttttaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system