Clostridium saccharobutylicum: CLSA_c18890
Help
Entry
CLSA_c18890 CDS
T02876
Name
(GenBank) MATE efflux family protein
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
csb
Clostridium saccharobutylicum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
csb02000
]
CLSA_c18890
Transporters [BR:
csb02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
CLSA_c18890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGX42874
UniProt:
U5MQ30
LinkDB
All DBs
Position
2124164..2125534
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MNKTEQLKNFPINRLIVSLSGPAIFAFIISTLNMTLDRIFLAKAVGTIALAAISIALGIQ
MLIQAFSQLIASGASSSIAIELGKNNKIGAERMIGNAFMLGIIISIIITIVGCIFIKPIL
ILYGATAESMNYALPYTFIMIFSTIFFTASQVLNNIIRGMGYSKKSTINFVSSIITHAVL
NTIFLFIFHMGIRAVAVASAIGYLVSCILAAKFLISDKCVARLHVSCFKLEKITVKRILT
VGLSALVMQITVSVISMVFNHVTNKYGGAIGQAAYGIIYTLLMIIYMPIMGLGQGIQSII
GINYGAELNKRVKETMLKAIKYATIFAIFMFIVIELFTDPIVLLFGGAKDQMLAEMTSNG
MRIVGLTISMIGFQIIGASYFQYVGKVKQSVFLSALRQFILLIPFAIILPMFLGISGVFD
SFVVSDLLSFGVTLFLIIKELRNLNIRIDQTKEKLI
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaactgaacaattaaaaaattttcctattaatcgtttgatagtaagtctatct
ggtcccgcgatttttgcatttataataagcacactaaatatgacacttgatagaatattt
cttgctaaggctgttggtacaatagctttggcagctatatctattgcacttggaattcaa
atgttgattcaagctttttctcaattaattgcatctggagcatcttcctctattgcaata
gagcttggtaaaaataataaaattggtgcagaacgtatgattggaaatgcatttatgctt
ggaattataatcagtattattattacaatagttggatgtatttttattaaaccaattctt
atactgtatggagcaactgcagaaagcatgaattatgctttaccttatacctttattatg
atatttagtacaattttttttacagctagtcaagtactaaataacatcatccgtggaatg
ggatattctaaaaaatcaactattaattttgtatcaagcataataactcatgctgtttta
aatacaattttcttatttatatttcacatgggaataagagcagtggcagttgcaagtgca
atagggtatttagtttcttgtattttagctgccaagtttttaataagtgataaatgcgtt
gcaagattgcatgtatcatgttttaagttagaaaagataacagtaaagagaatattaact
gttggtttatctgcattagttatgcaaattacagtaagtgtaatatctatggtatttaat
catgtcacaaataaatatggtggtgctataggacaggcagcttatggaatcatatatacc
ttgttaatgataatatatatgccgattatgggactaggtcagggcattcaatcaataata
ggaataaattatggcgctgaattaaataagcgagtaaaagaaactatgttaaaagcaatt
aaatatgcaacaatatttgcaatttttatgttcatagttattgagttattcacagatcca
atagttcttttgtttggtggagcgaaagatcaaatgcttgcagaaatgacatcaaatggg
atgcgaatagtaggtttaactatttctatgattggatttcaaataattggtgctagctac
tttcaatacgttggcaaagtgaaacaatccgttttcttatcagctttaaggcagtttatt
ttattaataccatttgcaattatattaccaatgtttttggggatatcaggagtgtttgat
tcatttgttgtatctgatctcttatcctttggagtaaccttattcttaataataaaagaa
ttgagaaatttaaatattcgtatagatcaaacaaaagaaaagttaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
