Clostridium saccharobutylicum: CLSA_c20100
Help
Entry
CLSA_c20100 CDS
T02876
Name
(GenBank) efflux ABC transporter, permease protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
csb
Clostridium saccharobutylicum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
csb02000
]
CLSA_c20100
Transporters [BR:
csb02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
CLSA_c20100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGX42994
UniProt:
U5MQD5
LinkDB
All DBs
Position
2270877..2273369
Genome browser
AA seq
830 aa
AA seq
DB search
MSFLKNNNSAIIRKLTIKTLKANKLRNIFAIIAIALTTLLFTSIFTIGIGITKSFEQETM
RQSGGSAHATFKYLNENELDKIKVHPLIKEFGYSIMVSKGENSELLKHHTEIRYETDKMA
QMSFCYPTAGKMPQKENEIVTSTKVLDLLGVSHEIGQKLKIEYNIQGEKRSQEFVLSGFY
ESDDASNFSMILVSKSFIDKELVNIDFKNTKFTSQDTGFINLDVMLKNSLSIQEDLDTIL
NECGYSNNKGAENYIATGVNWAYMSSNFNSEIIIPILGAILLIILTGYLIIYNIFQISVI
KDIRSYGLLKTIGTTPKQIKKLITNQAFLLSFIGIPIGLILGFLIGNILLPIIMSTTTIK
KAYIPFNPIIFIGASLFSLITVYISCKRPGKIAASVSPVEATKYNEVKIKSKKKIKKFSQ
GISVYNMAFCNVLRNKKKTIIVIISMSLSLILLNSVYTFIKGFDMDKYLSKYIVSDFIVG
SANYFNNQKLFKSESDIVSEETINTINNLDYIKSGGRVYFNLGKDKVSFNDVKRTAQVYG
LDDFPMSQLKVVEGNIDLEKLKSGKYILENVQTNDYGNYETKSAPFDVGQRITLSLGNYG
DKEYEVMAKIEMKNNMTARYYSYEAGEGYPVRMILPSSEFCNIVEKPLTMIYMFNVHKNN
LDEAERFIENYTNNIEYNMNYESKQVYINGFKSVQNMFLIVGATLSIIIGVIGILNFINA
ILTSIISRQMEFAILQSIGMTTKQLKNMLKFEGVFYAVSTILVSVIIGSIVSITIVAPIS
REIWFCKYEFTILPLLIIVPILLILGVLVPSISYKATSRKSIVERLRKLE
NT seq
2493 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttttttaaaaaataataatagtgctattattcgtaaacttacaattaaaacacta
aaagcaaataaattacgtaatatatttgctattattgcaattgcacttaccacattactt
tttacatcaatttttactataggcattggaataactaaatcgtttgagcaagaaactatg
cgtcaaagtggtggttctgctcatgcaacctttaaataccttaatgagaatgagctggac
aagataaaagtgcatccacttattaaagagtttggatactctattatggtaagcaaggga
gaaaattcagagcttttgaaacatcatacagaaattcgttatgaaacagataaaatggca
caaatgagtttttgttatcctactgctggtaaaatgccacaaaaggaaaatgaaatagtc
acaagtactaaagttcttgatcttttaggagtttctcacgaaatagggcaaaaattaaaa
attgaatataatatccaaggtgaaaaacgttcacaggaatttgtactttctggattctat
gaaagtgatgatgcatctaattttagcatgatattggtatctaaatcttttattgacaaa
gaacttgttaatatagattttaagaatacaaaatttacgtcacaagatactggatttata
aatctggatgttatgttaaaaaatagtcttagtattcaagaagatttagatacgattcta
aatgagtgtggatatagcaataataaaggtgcagaaaattatatagcaacaggtgtaaat
tgggcatatatgtctagtaattttaatagtgaaataattatacctatattaggagctata
ctactaatcattttaactggatatctcattatatataatatttttcaaatatctgttatt
aaggatattcgatcatatggtcttttaaaaacgataggtacaacgccaaagcaaattaaa
aaacttattacaaatcaagcttttttactttcatttattggaataccaattggcttaata
ttgggattcttaattggaaatatactcttacctataattatgagtacaacgaccattaaa
aaagcttatattccttttaatccaattatttttattggagcatcactattttcattaatt
acagtttatataagctgcaaaagaccagggaaaattgctgcatcagtttcaccagtagaa
gctacaaaatataatgaagttaaaattaaaagcaaaaagaaaattaaaaaatttagtcaa
ggtattagtgtttataatatggcattttgcaatgtcttaagaaataagaaaaaaacaatt
attgttattatttctatgtccttaagccttattttacttaattcagtatatacatttata
aaaggctttgatatggataaatacttatcaaaatatatagtttcggattttatagtaggt
agtgcaaattattttaataatcaaaagttatttaaaagtgaaagtgatatagtatctgaa
gaaacaataaatactattaataaccttgattatattaaaagtggaggcagagtatacttt
aatttagggaaggataaggtttcttttaatgatgttaagagaactgcacaagtatatggt
ttagatgattttcctatgtcacaattaaaagtagtagaaggaaatatagatttggaaaaa
ttgaaaagtggaaagtatatacttgagaatgttcaaacaaatgattatggaaattatgaa
acaaaaagtgcaccatttgatgttggacaaaggattactttgagcttaggaaattatggt
gataaggaatatgaagttatggcaaagatagaaatgaaaaataatatgacagctagatac
tattcctatgaggctggagaaggatatccagttcgaatgattttgccttcaagtgaattc
tgtaatatagtagaaaaaccattaacaatgatttatatgttcaatgtgcacaaaaataat
ctagatgaagcagaaagatttatagaaaactatacaaataatatagaatataatatgaat
tatgaatcaaagcaagtttacataaatggatttaaaagtgttcaaaatatgtttttgatt
gtaggcgcaacactttcaatcataattggagttataggtatacttaattttataaatgca
attcttactagtattatttcaagacaaatggaatttgcaatattacaaagtattggaatg
actactaagcaattaaaaaatatgcttaagtttgaaggcgtattttatgcagtatctacg
attttagtaagtgttattattggttcgattgtatctataacaattgtagccccaatttca
agagagatatggttctgtaaatatgaatttacaattttaccactattaattatagtacca
atattactcatattaggagttctcgtgcctagcatttcatataaagcaacgagcagaaaa
agtattgtagaaagacttagaaaattagaataa
DBGET
integrated database retrieval system