Clostridium saccharobutylicum: CLSA_c21350
Help
Entry
CLSA_c21350 CDS
T02876
Name
(GenBank) GTPase subunit of restriction endonuclease
Organism
csb
Clostridium saccharobutylicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_5
AAA_16
PhoH
bpMoxR
nSTAND1
DUF815
AAA
AAA_29
AAA_11
AAA_30
AAA_6
AAA_7
RsgA_GTPase
RNA_helicase
AAA_18
TsaE
ATG14
T2SSE
AAA_22
ABC_tran
DUF4407
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGX43115
UniProt:
U5MR86
LinkDB
All DBs
Position
2415879..2418023
Genome browser
AA seq
714 aa
AA seq
DB search
MKNEKINLNQEEATILEAQVISTESGFNKENEIIISDELRNEEVNLNNNKDIMITEVNSD
EIIKMSNENKIEYLEKNVFKSKFVLGRLNKIRDGKNGKYTFVDLVLPYDINTNYKINGTN
WRAFCDFNYVPNDVKQTLNQGDLIYFRPELNSINPHDIIRVNGITVKKLTSYKEFLKKEN
IELKDVKIGGLVALEREEDIRVWATEEFYRNFGQLHDDLLANVEEEQKKIESIMKEKEKL
YKSIQDERDKADKKKKDLEKELERNKKKADQEIKNKEDMLNKKKKEIENLVRKLEYFGFK
GFKDNEEQESLLKDNLLDSTFNELFDYIKNYLKYNKKLIYSDDTIRRFLVALQSNELVIL
SGPSGTGKSSIVTAVAEAIGGVAKIIPVKPSWTESEDLIGFYNPIEKSYVSTPFLDALVE
AKKNENKDKLYLICLDEMNLSHVEYYFAEFLSKLEVNKENPSIELYSKEILDEVCESIED
TIQLMSGESVEISIDSIKKWCADNSKEYTELIIELKKKIRFIEKYPAIFDIPNNVRFVGT
MNIDQTTKLISPKVIDRSFIIELLKFRAKVDDIKGEKVESKFIPADILKLNNKEELSKQS
KEIIKELDLTNQVLELLDCDYNSRTYSHISKYLCNLEQWEIKFDKNEVLSDLIAMKILPR
MNISIKNKADEKYKKWIEFKTEGYKKYSDDVKFKISKMDKGLEEDNILSFWGVY
NT seq
2145 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatgaaaaaataaatctaaatcaagaagaagcaactatacttgaagctcaagta
atttctacagaaagcggttttaataaggaaaacgaaataataatttcagatgaactgcgt
aatgaagaagtaaatttaaacaataataaagatattatgataactgaagttaatagtgat
gaaataattaaaatgagtaatgagaataagatagagtatcttgaaaaaaatgtttttaaa
agcaaatttgttttaggaagattaaacaagattagagatggcaagaatgggaaatataca
tttgtagacttagttttaccatatgatataaacactaattataaaattaatggcacaaat
tggagagcattttgtgattttaactacgtgccaaatgatgtcaaacagactttaaaccaa
ggagacttaatatactttaggccggagttaaatagtataaatccacatgatattattaga
gtaaatggaataaccgtaaaaaagctgacaagctataaagaatttttaaaaaaggaaaat
atagaacttaaagatgtaaaaataggtggactagttgcattggaaagagaagaagatatt
agagtatgggcaacagaagaattttatagaaattttggtcaattacatgatgacttatta
gcgaatgtagaagaagagcagaaaaaaatagagagtattatgaaagagaaagaaaaatta
tacaaatcaattcaagatgaaagagataaagctgataaaaagaaaaaggatttagaaaaa
gagctagaaagaaataaaaagaaggcagatcaagaaataaaaaataaagaggatatgcta
aacaagaaaaaaaaggaaatagaaaatttagtgagaaaacttgaatattttgggtttaag
ggtttcaaagataatgaagaacaagagagtttactaaaagataatttattagatagcaca
tttaatgaattattcgattatataaaaaattatttaaaatacaataaaaaattaatatat
agtgatgatacaataagaagatttttagttgctttacaatctaatgagttagtaatttta
tcagggccatcaggaacaggaaaatcaagtatagttacagcagttgctgaagctattggt
ggtgtagctaaaataataccagttaaaccaagttggactgaatcagaagatttgattggc
ttctataatccaatagagaaaagttatgtatcaacaccttttctagatgcacttgttgaa
gcaaaaaagaatgaaaataaagataaactttatcttatttgtttagatgaaatgaattta
tctcatgtagaatattactttgcagaatttttgagcaagcttgaagttaataaggagaat
ccatcaattgaattatatagtaaggaaattttagatgaagtgtgtgaaagtatagaggat
acaattcaattaatgagtggcgaatcagttgagatttcaatagattcaattaaaaaatgg
tgtgccgataattcaaaagaatatacagaattaataatagagttaaagaaaaagataaga
tttattgaaaaatatcctgcaatatttgatattcctaataatgtaagatttgtaggaact
atgaatattgatcaaactacaaaattaattagtccaaaggtcatagatagaagttttata
atagagttattaaagtttagagctaaagtagatgatataaaaggagaaaaagtagaaagc
aaatttataccagcggatattttaaaattaaataataaagaagagttgtctaaacagtcc
aaagaaataataaaagaattagatttaaccaatcaagttttagaattattagattgcgat
tataacagtagaacatatagtcatattagtaaatatctttgtaatttagaacaatgggaa
ataaaatttgataagaatgaagtgctaagcgatttaattgcaatgaagattttacctaga
atgaatatttcaattaagaataaggctgatgaaaaatataaaaaatggattgaatttaaa
actgaaggttataaaaaatattctgatgatgttaaatttaagataagtaaaatggataaa
ggtttggaagaagacaatattttgagtttttggggtgtatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
