Clostridium saccharobutylicum: CLSA_c25370
Help
Entry
CLSA_c25370 CDS
T02876
Symbol
ycxD
Name
(GenBank) HTH-type transcriptional regulator YcxD
Organism
csb
Clostridium saccharobutylicum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
Asp_aminotransf
HTH_41
HTH_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGX43510
UniProt:
U5MSD4
LinkDB
All DBs
Position
2863197..2864534
Genome browser
AA seq
445 aa
AA seq
DB search
MLKYEEIIEYIKNNIKSEKLNTPKKLPSIRSIKELFQCSTGTVLKAYEKLEQDHIIYSVP
KSGYYIVDDFHNPNSSKQPMVDFSAVNLNSETFPYKNFQHCLNKSIDLYKEKLFTYSDPR
GLKSLIKVLTKHIQNYQIFTKPDNILITSSSQQALNILSIMPFPNCKSNILVEQPTYYGM
IKFLELNNIPTLGINRDFNGINLDELEKLFKYGNIKFFYSIPRFHNPTGTSYSKFEKQEI
IKLAEKYDVYIVEDDISADLDINKKNDPLYSYDTSSRVIYLKSYSKIIMPGLRVAALILP
DLLINNFLEYKKWTDMNSPILSQGALEIYLKNGMFDSHMKQLVSLYSSRINCLKNILLEC
EYPNIQYNIPESGYFSCIHVNGSVNYDKIITSLYHKNIRIFDTRECFLKEYKCDNYFRIT
ISEVNEKQIKKNIPIILHSIQKNLN
NT seq
1338 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaaaatatgaagaaattatagaatacataaaaaataatataaagtctgaaaaactc
aatactccaaaaaaactaccttctattagatcaattaaagaactgtttcagtgtagtaca
ggtacagttctaaaagcttatgaaaaacttgagcaggatcatattatctattcagtacct
aaaagtggatattatatagttgatgattttcataacccaaattcctctaagcagccaatg
gtagatttttcagctgtaaatttaaactctgaaacttttccatataagaattttcaacat
tgtttaaataaatcaatagatttatacaaggaaaaactttttacatattctgatcctaga
ggattaaaatctttaattaaggtattaacaaaacatattcaaaattatcaaatattcaca
aaacctgataacatacttattacatcaagctctcaacaagcattgaatattttatcaatc
atgccatttccaaattgtaaatctaatattcttgttgaacagcctacatattatggaatg
ataaaattccttgaacttaataacatccctactctaggaataaatagagacttcaatgga
ataaatttagatgaattagagaagttgtttaaatacggcaatattaaatttttctatagt
atacctagatttcacaatccaactggaacttcatacagtaaatttgaaaaacaagagatt
attaaattagcagaaaaatatgatgtgtacattgtcgaagacgatatttcagcagattta
gatataaataaaaagaatgaccctctatattcctatgatacttcatcaagggtaatatac
ttaaaaagttattcaaagataattatgccaggtttaagggttgcggctcttatattacct
gatttacttattaataattttttagaatataaaaaatggactgatatgaacagtccaata
ctatctcaaggagccttagaaatatacttaaagaacggaatgtttgattcccatatgaaa
caattagttagtctatacagtagtcgtatcaattgcttaaaaaatatcttattagaatgc
gaatatccaaatatacaatataacatccctgagtctggatactttagctgtattcatgta
aatggttcagtaaattatgataaaataattacttcactatatcataagaatataagaata
tttgacacacgtgaatgtttccttaaagaatacaaatgtgataattatttcagaattact
ataagtgaagtgaatgagaaacaaataaagaaaaacatacctataatacttcattctatt
caaaaaaatttgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
